BRESEQ :: Evidence

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP016816	245,262	0	G	T	66.0%	3686.2 / inf	4363	V1631L (GTA→TTA)	JCVSYN2_01035	ABC transporter permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (766/717); new base T (1502/1374); total (2270/2093)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 4445 total aligned reads displayed.

ATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGG  >  CP016816/245135‑245389

aTCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAg                                                                                                                                 >  2:9063935/1‑128 (MQ=255)

    gCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAat                                                                                                                             <  2:2758896/128‑1 (MQ=255)

      ttCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAatta                                                                                                                           <  1:539959/128‑1 (MQ=255)

       tCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAattat                                                                                                                          <  2:5792997/128‑1 (MQ=255)

       tCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAattat                                                                                                                          <  1:2984999/128‑1 (MQ=255)

         tGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACTGTAAttatta                                                                                                                        <  1:8462626/128‑1 (MQ=255)

          ggTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTAc                                                                                                                       >  2:9351314/1‑128 (MQ=255)

             gatgatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTc                                                                                                                    >  1:8938677/1‑128 (MQ=255)

             gatgatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTc                                                                                                                    >  2:9207096/1‑128 (MQ=255)

             gatgatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATAAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTc                                                                                                                    <  2:665131/128‑1 (MQ=255)

                gatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTAATGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGc                                                                                                                 >  2:8558923/1‑128 (MQ=255)

                 atgatatgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTAATACAGCt                                                                                                                >  2:4402196/1‑128 (MQ=255)

                  tgatatgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCtt                                                                                                               <  2:2583833/128‑1 (MQ=255)

                    atatgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATAAGCTACATCAAAAACTTTAATAAATCAAATTACTATTATATCTATTTCTATTTGAATGTTATTAAAAATTAGATTAATAATTACTTCAGCTTTa                                                                                                             >  2:1088600/1‑128 (MQ=255)

                      attatTAGTAATATAAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACt                                                                                                           <  2:4725278/125‑1 (MQ=255)

                       tgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTAATAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTa                                                                                                          <  2:5912121/128‑1 (MQ=255)

                        gatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAg                                                                                                         <  1:6149012/128‑1 (MQ=255)

                         atTAGTAATATTAAATATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTTGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGt                                                                                                        <  1:2450349/128‑1 (MQ=255)

                         atTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTTATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGt                                                                                                        >  2:6106952/1‑128 (MQ=255)

                         atTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTACTATTGGATTGTTATTAATAATTACATTAATTATAACTTCAGATATACttga                                                                                                        >  2:5099032/1‑125 (MQ=255)

                             gTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATg                                                                                                    >  2:8900475/1‑128 (MQ=255)

                              tAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGt                                                                                                   <  2:6816012/128‑1 (MQ=255)

                                 tatTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTaa                                                                                                <  2:2407010/128‑1 (MQ=255)

                                 tatTAAAAATCAAAAATTATTATCTAAATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTaa                                                                                                <  2:8726623/128‑1 (MQ=255)

                                  atTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCa                                                                                                                   >  2:8112302/1‑108 (MQ=255)

                                  atTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAAt                                                                                               <  1:2197165/128‑1 (MQ=255)

                                     aaaaaTCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTc                                                                                            <  1:1753667/128‑1 (MQ=255)

                                         aTCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGat                                                                                        <  2:779750/128‑1 (MQ=255)

                                         aTCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGat                                                                                        <  2:3674374/128‑1 (MQ=255)

                                           cAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGatat                                                                                      <  2:1464339/128‑1 (MQ=255)

                                           cAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGatat                                                                                      <  1:4154693/128‑1 (MQ=255)

                                           cAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGatat                                                                                      <  1:5238383/128‑1 (MQ=255)

                                            ataaCTAATTAGCTACATCTAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                                                     <  1:2028509/126‑1 (MQ=255)

                                              aaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTa                                                                                   <  1:1910253/128‑1 (MQ=255)

                                                 ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTTTTACTGCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGt                                                                                >  2:454038/1‑128 (MQ=255)

                                                 ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCATATATTTATGt                                                                                >  2:3842753/1‑128 (MQ=255)

                                                 ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTAttg                                                                                >  2:1944173/1‑126 (MQ=255)

                                                 ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGt                                                                                >  1:3149919/1‑128 (MQ=255)

                                                   attaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTaa                                                                              >  1:6791620/1‑128 (MQ=255)

                                                       gCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCa                                                                          <  1:3345127/128‑1 (MQ=255)

                                                        cTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAg                                                                         <  2:3160861/128‑1 (MQ=255)

                                                        cTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAg                                                                         <  2:5640932/128‑1 (MQ=255)

                                                        cTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTAATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAttt                                                                                    >  2:2060850/1‑117 (MQ=255)

                                                          aCATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCATCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTa                                                                       >  1:8269256/1‑128 (MQ=255)

                                                           cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTAt                                                                      >  2:949953/1‑128 (MQ=255)

                                                           cATCAAAAACTATAATTAAACAAATTAATATTATAGCTATTTATATTGGAATGTTATTAATAATTAAATTAATTATAACTTCAGCTTTACTAGTAATATAAATTAAATATAATTAAGAAACTCAGTAt                                                                      >  2:7306951/1‑128 (MQ=255)

                                                            aTCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATc                                                                     <  1:4359238/128‑1 (MQ=255)

                                                            aTCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATc                                                                     >  1:7788850/1‑128 (MQ=255)

                                                              cAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCaa                                                                   <  1:3942230/128‑1 (MQ=255)

                                                               aaaaaCTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAAc                                                                  <  2:5272250/128‑1 (MQ=255)

                                                                  aaCTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGt                                                               >  1:2814885/1‑128 (MQ=255)

                                                                     tttAATTTATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTa                                                            >  1:4868108/1‑128 (MQ=255)

                                                                      ttaattaaTCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTAt                                                           >  2:2894775/1‑128 (MQ=255)

                                                                        aattaatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGa                                                         <  2:7617370/128‑1 (MQ=255)

                                                                         attaatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAt                                                        <  2:7977278/128‑1 (MQ=255)

                                                                         attaatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAt                                                        <  2:4216782/128‑1 (MQ=255)

                                                                          ttaatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAtt                                                       <  1:757070/128‑1 (MQ=255)

                                                                          ttaatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAtt                                                       >  1:6351066/1‑128 (MQ=255)

                                                                           taatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAttt                                                      >  1:7967665/1‑128 (MQ=255)

                                                                           taatCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAttt                                                      <  1:8620428/128‑1 (MQ=255)

                                                                             atCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGa                                                                                         <  1:3525974/91‑1 (MQ=255)

                                                                             atCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGt                                                                                >  2:8415679/1‑100 (MQ=255)

                                                                             atCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                                                    <  1:4526830/128‑1 (MQ=255)

                                                                             atCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                                                    >  2:5443978/1‑128 (MQ=255)

                                                                              tCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTaa                                                   <  1:9307279/128‑1 (MQ=255)

                                                                              tCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTATaa                                                   >  2:1600839/1‑128 (MQ=255)

                                                                                   ttACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGaaa                                              >  2:6489198/1‑128 (MQ=255)

                                                                                   ttACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGaaa                                              >  2:3315083/1‑128 (MQ=255)

                                                                                    tACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAg                                             >  2:7462416/1‑128 (MQ=255)

                                                                                     aCTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGc                                            <  1:1383458/128‑1 (MQ=255)

                                                                                     aCTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACCTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAgt                                            <  1:7182697/128‑2 (MQ=255)

                                                                                       ttttATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCtt                                          >  1:6544027/1‑128 (MQ=255)

                                                                                       ttttATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGttt                                          <  1:7344605/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            taGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGa                                     >  1:4691426/1‑128 (MQ=255)

                                                                                             aGCTATTTCTATTTGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGat                                    <  2:303677/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              gCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGata                                   >  1:263822/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               cTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAAAGTTAATTTCATATATTTATTTAACTCAGTATAAACAGTTTATGATTTAAATGAAAGATTTAGTatat                                  >  1:7014050/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               cTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGATTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGatat                                  <  1:558436/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  tttCTATTTGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCa                               <  2:4909529/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                  tttCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCa                               <  2:2239902/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                     cTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAAt                            <  1:9121279/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                         tGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCTGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATtata                        <  1:8131529/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                         tGGAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACGGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATtata                        <  2:8239155/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                           gAATGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATaaa                      >  1:8794139/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                           gAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATaaa                      <  2:351118/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                            aaTGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATaaaa                     >  2:7007872/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                             aTGTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAAt                    <  1:9608581/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                               gTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTa                  <  2:7169745/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                               gTTATTAATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTa                  <  1:9443933/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                ttattaATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAg                 <  1:1005905/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 tattaATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGt                <  2:3999464/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 tattaATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGt                <  1:1556043/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  attaATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTa               >  1:5064262/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                  attaATAATTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTa               >  1:5747118/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                    taataaTTTCAGTAATTATTAATTCATCTTTAATTGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACGCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTaaa             <  2:6281822/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    taataaTTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTaaa             <  1:3719362/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      ataatTACATTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAata           >  1:5937745/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                           tACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAata           >  2:179280/1‑123 (MQ=255)

                                                                                                                             cAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCtttt    <  1:1187187/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             cAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGTTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCtttt    <  2:1294662/128‑1 (MQ=255)

ATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGG  >  CP016816/245135‑245389

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`