Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG55.0% 2643.6 / inf 2588intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (218/902);  new base G (1039/332);  total (1347/1241)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 3164 total aligned reads displayed.

TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105212‑105468
                                                                                                                               |                                                                                                                                       
  gattaacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaattaa                                                                                                                                       >  1:7667317/7‑128 (MQ=255)
    tAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCATATTAATATaattaatt                                                                                                                                     >  2:4516016/1‑128 (MQ=255)
    tAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                     <  2:5650670/128‑1 (MQ=255)
     aaTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattt                                                                                                                                    >  2:7161528/1‑128 (MQ=255)
     aaTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaaatt                                                                                                                                    >  1:7302445/1‑128 (MQ=255)
      aacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATATAATTATTTATTATAATTGATAATTTTATTTATCCTTTTAATATaattaaatta                                                                                                                                   >  2:4324149/3‑128 (MQ=255)
      aacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTTTTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                   >  2:3731061/3‑128 (MQ=255)
       tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATATAATTATTTATTATTATTTATTATATTATTTATAATTTTAATATAAtaaattaaa                                                                                                                                  >  2:3869474/1‑128 (MQ=255)
       tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTATTTAATATTATTTATTAGTTTATTAATCCTTttaatataattaatataa                                                                                                                                  >  1:2092178/1‑128 (MQ=255)
       tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                  >  2:2074877/1‑128 (MQ=255)
       tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                                  <  2:6469446/128‑1 (MQ=255)
       acatgCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATATAAGTATTTATTATGATAAATTAGTTAAATAATACTATTAATAAAAtcaatttaa                                                                                                                                  >  2:9155773/5‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAAttaatttaa                                                                                                                                  >  2:7440736/2‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaat                                                                                                                                 >  2:8577155/1‑128 (MQ=255)
         aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAATATTAAATATTTTATTTATAATTATAATATAAtaaatataata                                                                                                                                >  1:9518620/1‑127 (MQ=255)
         aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATtaatttaatt                                                                                                                                >  2:3312098/1‑128 (MQ=255)
         aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATgaatttaatt                                                                                                                                >  1:3080685/1‑128 (MQ=255)
         aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATAAAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaata                                                                                                                                >  2:7534999/1‑127 (MQ=255)
          aGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTTATTAGTTTATTTATACTATTAATATAATTAATttaatta                                                                                                                               >  2:2667296/1‑128 (MQ=255)
           gCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaattaa                                                                                                                              <  1:6164727/128‑1 (MQ=255)
            tcTTTTTTATTTTTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaa                                                                                                                             <  2:1144773/127‑1 (MQ=255)
             cTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATTaaaa                                                                                                                            >  2:7646678/1‑128 (MQ=255)
              ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATTAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAat                                                                                                                           <  2:7000063/128‑1 (MQ=255)
                 tttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaat                                                                                                                                 >  2:7845743/1‑119 (MQ=255)
                 tttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAAATTAAATAAAatata                                                                                                                        >  2:6133658/1‑127 (MQ=255)
                       tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTt‑aat‑a                                                                                                                >  2:2266185/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATTAAAAAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTTATTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaa                                                                                                           <  2:2815267/128‑1 (MQ=255)
                                    attatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑Aaa‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                   >  1:8448157/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGATTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                 >  2:4905431/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTACCTAATTATATATTATTATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATAAAATAAATTTAAAAAAAATATATT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                 >  2:5146295/1‑128 (MQ=255)
                                       ataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATT‑ATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                               >  1:7182198/1‑128 (MQ=255)
                                       ataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                >  2:4727928/1‑128 (MQ=255)
                                        taGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                               >  2:3523393/1‑128 (MQ=255)
                                          gTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                             >  2:8429868/1‑126 (MQ=255)
                                           tATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTAACTAATTATTTATTTTGATTTATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                            <  1:8297487/128‑1 (MQ=255)
                                            attaaataaaataGATAAATGTTTAAATAAATAAGTTATGTTTTTATTATGTTTGATTATTTTATTTATCCTTTTAAAATAATGAATTTAAATAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                           <  2:8995101/125‑5 (MQ=255)
                                            aTGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                           >  1:2878368/1‑127 (MQ=255)
                                              gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAAAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑aaaaaaaaaaaaaaacaagaccta                                                                                         <  1:3236397/128‑7 (MQ=255)
                                               aaaTTATAAATTTTAATTTTAATTTAAATTTTTTAATTTTTTTTTATGTTTTTATTTTTTTTTTATAATTTTAATATATTTAATTTAATTAAAATTTTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAcc                                                                                        <  2:8808276/128‑1 (MQ=255)
                                                aataatAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATAATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTA‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                       >  1:919460/1‑123 (MQ=255)
                                                aataatAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                       >  2:1714114/1‑123 (MQ=255)
                                                aataatAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                       >  2:5899749/1‑123 (MQ=255)
                                                 ataataAATATTAATTTTAATAAAAATTATCTAATTAATTATTATGATTTATTATTTTATTTATAAATTTAATAAAAATAATTTAATTAAAATATTTTAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                       <  1:1146812/128‑1 (MQ=255)
                                                  taataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaa                                                                                     >  2:7745903/1‑121 (MQ=255)
                                                  taataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAAGAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                     >  2:6667607/1‑121 (MQ=255)
                                                     taaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaat                                                                                  >  1:7885951/1‑118 (MQ=255)
                                                        atatttatttTAATATAAATTATTTAATTATTTATTATGATTGTTTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGt                                                                               <  1:5585949/126‑1 (MQ=255)
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                                                                     tataAATTATCTAATTATTTATTATGATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaa‑tta‑at                                                               <  1:2483971/128‑1 (MQ=255)
                                                                      ttaAATTATTTATGTTTTTATTTGGTTTTCTTTTTTTATTTATACTTTTAAAATAATGATTTTAATTTAAAAATTTT‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAa‑tta‑atta                                                             <  2:3109342/127‑1 (MQ=255)
                                                                       taAATTATCTAATTTTTTATTATGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAa‑tta‑atta                                                             <  1:8851624/128‑1 (MQ=255)
                                                                              gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAATAATATTTTTAAAAAAAA‑tta‑attaaatattt                                                      >  1:9331668/1‑122 (MQ=255)
                                                                                  attattttttATGATTTATTAGTTTTTTTTTAATTTTAATTTAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGAt                                                   <  2:7304070/126‑1 (MQ=255)
                                                                                   gTATTTATTATTATTTTATATTTTATTAAAAATTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAAAATTTT‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGAttt                                                 <  1:3869474/128‑1 (MQ=255)
                                                                                   gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAATAAAATTTTAAAAAAAAA‑ata‑ataaattaataatata                                                 >  1:5869046/1‑117 (MQ=255)
                                                                                    tatttattAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑‑‑ACCTAATATTGTTAAAAAAAA‑TAA‑ATTAATA‑ATTTAATTATTaa                                            >  1:3429426/1‑128 (MQ=255)
                                                                                     ttttattATTATTTATTATTTTATTTATAATTTTAATAAAATGAATTTAATTAAAATAATTT‑AAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATttat                                               <  1:6401627/127‑1 (MQ=255)
                                                                                     atttattattatttattattTTAATTAATATTTTAATATAATGTATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTaa                                            <  1:871936/128‑1 (MQ=255)
                                                                                       ttattaGGATTGTTTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATttatta                                             <  1:5406250/128‑1 (MQ=255)
                                                                                        tattaGGTTTTTTTATTTTTTTTATCCTTTTAATATAATGAATTTTATTTAAATATTTT‑TAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTaa                                            <  1:7536900/128‑1 (MQ=255)
                                                                                        tattaGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTAAAAAAAAA‑TAA‑ATTAATT‑ATTAATTTATaaa                                            >  2:1908163/1‑128 (MQ=255)
                                                                                        tattaGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑AAATAAAAAAAAAAAAACAACAACATATTATGTTAAAAAAAA‑GTATAATAAGT‑GTTGAtttttgta                                            >  2:9549453/1‑123 (MQ=255)
                                                                                              gattgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AAGACAAAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAATT‑CTTAAATTATTAAA‑Aaatatt                                   >  2:5424178/1‑128 (MQ=255)
                                                                                               attttttattttattTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTAAA‑tattat                                    <  1:1411195/123‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                      tAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAGACATAATATTTTTAAAAAAAA‑TTA‑ATAAAGT‑AATAATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAAAAAAttaaaaataagaa            >  1:4704451/1‑117 (MQ=255)
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                                                                                                                       ctttttattaaatTTATTAAAATATTTT‑AAT‑TAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCt            <  1:5106698/122‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                       aaTATAATGAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAATTTTTAAAAAAAA‑TAA‑ATAAATA‑ATTAATTTATTAAA‑AATAATTTTTTAAAAAATTTaaaataaaaaa           >  2:29782/1‑118 (MQ=255)
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                                                                                                                           taattaatTTAAATAAAATAATTT‑AAT‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGc    <  1:4481570/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           taatgaatTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAATACAAAATATTTTTAAAAAAAA‑TTA‑ATTAATA‑ATTTATTTAATAAA‑AATATTTTTTTAACAAATTTAAATTTAGATAAAt        >  2:9374046/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                           taatgaatTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAATTTTTTTTAAAAAAAA‑TTA‑ATAAATT‑ATT‑ATTTATTAAATTATTATTTTTAAAAAAATTAACAtttcaataaaa        >  2:5023905/1‑119 (MQ=255)
                                                                                                                           taatgaatTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCACTAATATTTTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑ATTTATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAACAAATTTACAtttaaataatat       >  2:2507758/1‑118 (MQ=255)
                                                                                                                               |                                                                                                                                       
TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTT‑AAT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAA‑TTA‑ATTAAGT‑CTTGATTTATTAAA‑TATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105212‑105468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑