| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 478,738 | C→A | G301V (GGT→GTT) | JCVSYN2_02210 ← | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 478,738 | 0 | C | A | 98.8% | 2712.9 / NA | 957 | G301V (GGT→GTT) | JCVSYN2_02210 | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/4); major base A (473/466); minor base T (6/5); total (481/476) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 980 total aligned reads displayed.
GTAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTACCACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTTAATAA > CP016816/478613‑478862 | tAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTaacac > 1:1000657/1‑128 (MQ=255) tAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTaacac > 2:210799/1‑128 (MQ=255) cATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCAt < 1:1124591/128‑1 (MQ=255) cATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCAt > 2:217191/1‑128 (MQ=255) cATACGTTTTTCATTATTATCAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCAt < 2:1400234/128‑1 (MQ=255) tACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCt > 2:270139/1‑128 (MQ=255) aCGTTTATCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTa < 2:785727/128‑1 (MQ=255) gTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAAt < 2:721322/128‑1 (MQ=255) tttCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGa < 1:1700888/128‑1 (MQ=255) tCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACAACATCTAATTGaat > 1:1771642/1‑128 (MQ=255) attattTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGaataa > 2:1128648/1‑128 (MQ=255) ttattTACAATATTTGATGGGGCATCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTGATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGaataat < 2:1801801/128‑1 (MQ=255) ttattTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGaataat < 1:889285/128‑1 (MQ=255) attTACAATAATTGATTGTGCACCCATTGCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTg < 2:583854/128‑1 (MQ=255) tttACAATAATTGATGTTGCACCAATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg < 1:483381/128‑1 (MQ=255) tttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTgg < 2:1203596/128‑1 (MQ=255) ttACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGa > 1:1477037/1‑128 (MQ=255) tACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGAc > 1:115573/1‑128 (MQ=255) tACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGAc < 2:1847104/128‑1 (MQ=255) cAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCTTCTAATTGAATTATTGGACGa > 1:254035/1‑128 (MQ=255) aataatTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAAGAATTGGACGat > 2:1291764/1‑127 (MQ=255) ataatTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAAt < 2:379182/128‑1 (MQ=255) aatTGATGGTTCACGCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGt < 1:1247045/128‑1 (MQ=255) aatTGATGGTGAACCAATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGt < 2:487582/128‑1 (MQ=255) ttGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCt < 1:1992620/128‑1 (MQ=255) ttGATGGTGCACCCATTTCTATAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACAATCTAATTTAATAATTAGACGAATGACt > 1:2224550/1‑128 (MQ=255) tGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCtg > 1:313163/1‑128 (MQ=255) gATGGTGAAACCATTTATTTAACTTTTTTTAAGATTTCAATTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCGGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCtgg < 2:843966/128‑1 (MQ=255) ggTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCtggtgg > 1:154373/1‑128 (MQ=255) ttgaaCCCATATCTTTATCTTTTTTTAATCTTTCATTTCTATTAATTATTCTTCTTTATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGTCGAATGTCtggtgta < 1:1025471/124‑3 (MQ=255) gTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACTCCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGa < 1:442031/128‑1 (MQ=255) tGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGaa < 2:1891876/128‑1 (MQ=255) tGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTAATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCTGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGaa < 1:1578986/128‑1 (MQ=255) gCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAAt > 1:1918885/1‑128 (MQ=255) cACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATa > 1:2139205/1‑128 (MQ=255) cACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACAATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGTTGGAATa > 2:1505635/1‑128 (MQ=255) cACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACAATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGtata > 1:1067586/1‑128 (MQ=255) agaattttatttaACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCATAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATaa < 1:1797002/123‑1 (MQ=255) aCCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATaa < 1:350809/128‑1 (MQ=255) cccATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAAc > 1:1335644/1‑128 (MQ=255) ccATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACt < 2:1949505/128‑1 (MQ=255) cATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTg < 1:2281639/128‑1 (MQ=255) tttCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGa < 1:600833/128‑1 (MQ=255) ttCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGaa < 1:805340/128‑1 (MQ=255) ttCTTTAACTATTTTTAATCTTTCATTTCTAAAAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATAGGACGAATTTCTGGTGGAATAACTGaaa > 2:1667704/1‑128 (MQ=255) tCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAAt < 1:2014325/128‑1 (MQ=255) tCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAAt > 1:231879/1‑128 (MQ=255) ttAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTAc > 2:531903/1‑128 (MQ=255) tAACTTTTCTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTAct > 1:1419734/1‑128 (MQ=255) aCTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATATCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTActct < 2:153319/128‑1 (MQ=255) cTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACtctc > 1:1745186/1‑128 (MQ=255) tttttttAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCa < 2:1641405/128‑1 (MQ=255) ttttttAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTAAGAAGTAGTAAATCTAACACAATCTAATTTAATAATTGTACGAATCTCTGGTGGCATAAATGTAATTACTCTCAt > 1:2444172/1‑128 (MQ=255) tttttAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATa < 1:864532/128‑1 (MQ=255) tttttAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATa > 2:2075792/1‑128 (MQ=255) ttttAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATac > 2:1089093/1‑127 (MQ=255) aaTCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcat < 1:996246/128‑1 (MQ=255) atatttcttttctAATAATTATTATTATATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcatt < 2:657539/125‑1 (MQ=255) aTCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcatt > 1:1090883/1‑128 (MQ=255) aTCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCAACTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGATTTACTCTCATAAAcata > 2:1157566/1‑127 (MQ=255) aTCTTTCATTTCTAATAAAGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcatt < 1:1848342/128‑1 (MQ=255) tCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACTAATGTCTTGTGGAATAACTGGACTTACTCTCATAACcattc > 2:616169/1‑128 (MQ=255) cTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATACCcattca > 2:2336741/1‑128 (MQ=255) cTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattca < 1:954885/128‑1 (MQ=255) cTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATAAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAAAACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattca < 2:1757073/128‑1 (MQ=255) cTTTCATTTCTAATAATGATTCTTATATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattca < 2:1990227/128‑1 (MQ=255) ttCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACcattcatt > 2:2018946/1‑128 (MQ=255) tCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCattcattc < 1:718562/128‑1 (MQ=255) cATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTTACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATTACTGGATATACTCTCATAACCAgtcattca > 2:1582436/1‑128 (MQ=255) aataatGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGTCGtt > 1:756870/1‑128 (MQ=255) ataatGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCCCATAACCATTCATTCAGGACGTTg < 1:119135/128‑1 (MQ=255) taatGATTAATCTATATAAATAATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGATTGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTgg < 2:1232545/128‑1 (MQ=255) atGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATATCCATTCATTCAGTACGTAGGtt > 2:944453/1‑128 (MQ=255) atGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGtt > 2:445576/1‑128 (MQ=255) tGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTa > 1:1642219/1‑128 (MQ=255) tGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTa > 2:2209958/1‑128 (MQ=255) aTTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGa < 2:1028435/128‑1 (MQ=255) cttctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATTTCTGTTGTAATAACTGTAATTACTCTCATAACCATTCATTAAGGACTTTGGTTAGAACg > 2:2277494/1‑128 (MQ=255) cttctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACg > 1:670383/1‑128 (MQ=255) tctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGATGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGtt < 1:922905/128‑1 (MQ=255) tctATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATACAGGACGTTGGTTAGAACGtt > 1:2099056/1‑128 (MQ=255) atataAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTa > 2:744247/1‑128 (MQ=255) tttaAATCATTAATTTAAGAAGTAGTAAATTTTACACCATCTAATTGAATAATTGGAAGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTaa < 2:2444172/126‑1 (MQ=255) tataAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTaa < 2:677539/128‑1 (MQ=255) aaaTCATTAATTTCTGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGc < 2:2396831/128‑1 (MQ=255) aTCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCAt < 2:2363755/128‑1 (MQ=255) ttAATTTCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCata > 2:1382222/1‑126 (MQ=255) tCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTc < 1:520878/128‑1 (MQ=255) tCAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGATTTAAAGCATCCAAAGTTTc > 2:1716459/1‑128 (MQ=255) cAGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTACGTAAGAACGTGGTAAAGCATCAAAAggtgca > 2:331643/1‑123 (MQ=255) aGAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTa > 1:1293475/1‑128 (MQ=255) gAAGTAGTAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAAt > 2:1338268/1‑65 (MQ=255) agtagtAAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGTTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAAc < 1:2178354/128‑1 (MQ=255) gtagtaAATATAACAACATCTAATTGAATCATTGGACGAATGTCGGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACg < 1:2378840/128‑1 (MQ=255) gtaggaAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACg < 1:1381084/128‑1 (MQ=255) tagtaAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGt > 1:834931/1‑128 (MQ=255) gtaAATCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGttt < 2:909373/128‑1 (MQ=255) taAATCTAACACCATCTAAATGAATAATTGGACGAATGTCTGGTTGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGtttt < 2:1057499/128‑1 (MQ=255) aaaTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGGTAGAACGTTTTAAAGCATCATAAGTTTCTAAACGTGTta > 2:1463557/1‑128 (MQ=255) aaaTCTAACACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGGTCGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACTTTTta > 1:1873890/1‑128 (MQ=255) | GTAACATACGTTTTTCATTATTTACAATAATTGATGGTGCACCCATTTCTTTAACTTTTTTTAATCTTTCATTTCTAATAATGATTCTTCTATATAAATCATTAATTTCAGAAGTAGTAAATCTACCACCATCTAATTGAATAATTGGACGAATGTCTGGTGGAATAACTGGAATTACTCTCATAACCATTCATTCAGGACGTTGGTTAGAACGTTTTAAAGCATCAAAAGTTTCTAAACGTTTTAATAA > CP016816/478613‑478862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |