| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 117946 = | 1272 (1.120) | 37 (0.040) | 35/212 | 20.0 | 3.4% | intergenic (+67/+792) | JCVSYN2_00460/JCVSYN2_00465 | ABC transporter substrate‑binding protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 117942 | 1027 (1.080) | intergenic (+63/+796) | JCVSYN2_00460/JCVSYN2_00465 | ABC transporter substrate‑binding protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1288 total aligned reads displayed.
AAGGAAATTGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATATTT > CP016816/117815‑118069 | aaGGAAATTGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGcaacaa > 1:1256669/1‑128 (MQ=255) aaTTGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tatta > 1:1461292/1‑128 (MQ=255) tGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattatta > 2:1270888/1‑128 (MQ=255) tGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattatta < 2:636299/128‑1 (MQ=255) aagagaagaATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAATTAACTAAATATATAATTTTATAAGCAATAAATCAAGGTATTGATTTTTTATAAATATAAAAATTATAAACTTAAAAAA‑‑‑tattattatt > 1:1047352/1‑128 (MQ=255) agagaagaATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattatta > 2:1303582/1‑128 (MQ=255) agagaagaATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATATTAAAAAGCAACAA‑‑‑tattattatta > 1:816602/1‑128 (MQ=255) agaagaATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattatt > 1:1412808/1‑128 (MQ=255) gaagaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattatta < 1:385195/128‑1 (MQ=255) gaagaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattatta < 2:671139/128‑1 (MQ=255) gaagaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattatta < 1:2291223/128‑1 (MQ=255) gaagaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAAATAAATAAATAATTTTATAAGAAATAACTAAAGGTATTGCTTATTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGAGACAA‑‑‑tagttttattatta > 2:2163527/1‑128 (MQ=255) aagaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattat > 2:2122509/1‑128 (MQ=255) agaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACat‑‑‑tattattattattatt > 2:1197549/1‑128 (MQ=255) agaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattatt < 1:1911646/128‑1 (MQ=255) agaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattatt > 1:2454037/1‑128 (MQ=255) agaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattatt < 1:756056/128‑1 (MQ=255) agaaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTGTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattatgattattatt > 1:1360289/1‑128 (MQ=255) aaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACACATTTTAAACAGAAACAA‑‑‑tattattattattattag > 1:1645246/1‑127 (MQ=255) aaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattattat > 1:212068/1‑128 (MQ=255) aaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattattat < 2:2094444/128‑1 (MQ=255) aaTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattattat < 2:853992/128‑1 (MQ=255) aTGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattattatt > 2:2361023/1‑128 (MQ=255) tGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tattattattattattatta < 1:1000398/128‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACATCAACAA‑‑‑Tattattattattattattatt > 2:104275/1‑128 (MQ=255) aaaaaaaGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑Tattattattattattattatt < 2:330007/128‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATAGCTTTTTTATAAAATTACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑Tattattattatttttattattt > 2:386613/1‑127 (MQ=255) aaaaaGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTattaa > 2:1545621/1‑128 (MQ=255) aaGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTattaatta < 1:2200216/128‑1 (MQ=255) aaGAGTACGAGAGTAAAAAT‑AAAAACAAAATAAAAAAATTTATAATGAATACCGAAAAGTATTGCATTTTTATTAAAATACCAATTTTAAAAAAGAACAA‑‑‑ATATATTTATATTTTTATTATTAAatat > 1:784182/1‑128 (MQ=255) agagTACGAGAGTAAAAATAAATAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAATGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTAt < 2:1334345/128‑1 (MQ=255) gagTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATc > 2:1476751/1‑128 (MQ=255) gagTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATc > 1:285641/1‑128 (MQ=255) gTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCaa < 2:1113072/128‑1 (MQ=255) gTAAGAGAGTAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAATTTTATAATCAAAAAATAAAAGTATTTGATTTTTATAAAAATAAAAATTTTAAAAAAGAAAAA‑‑‑TATTAATATTAATTTTTTTttttattttaaa > 2:1717782/1‑123 (MQ=255) cGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATAATCAAGCa > 2:1734106/1‑128 (MQ=255) gagaGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCat > 2:1953746/1‑128 (MQ=255) gagaGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATAACTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCat < 2:1841438/128‑1 (MQ=255) agagTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGGAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCata < 2:1900321/128‑1 (MQ=255) agagTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAT‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCata > 2:950785/1‑128 (MQ=255) agagTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCata > 1:1305324/1‑128 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑tatta < 2:1511710/95‑1 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCAtata > 1:1678882/1‑128 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCAtata < 1:563392/128‑1 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCAtata > 1:1605076/1‑128 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCAtata > 2:291695/1‑128 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACATCAAGGTATTTCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAATCAtata > 2:438529/1‑128 (MQ=255) agTAAAAATAAAAAAATAAATAATTAATTTTATTAGCAATACATCAATTTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCAtata < 2:787720/128‑1 (MQ=255) gaaaaaataaaaaAGTAAATAAATATTTTTATAAGCAATACCTAAATGTATTTCTTTAATATAAAAATACAACTTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATGAAAAATCAAGCATATaa > 2:1671472/3‑128 (MQ=255) aaaaaCTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATAGCTTTTTTATAAAAATACAAAATTTAACCAGCAACAA‑‑‑TATTATAATTATTATTATTAAAAATAATCAAGCAAACAaatataatat > 2:1597858/1‑128 (MQ=255) aaaaCTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATg < 1:2019645/128‑1 (MQ=255) aaaCTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAATGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGa < 1:1769541/128‑1 (MQ=255) aaaCTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGa > 1:1089258/1‑128 (MQ=255) aaCTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTAAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGat < 1:1559557/128‑1 (MQ=255) aaataaatAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATAc > 2:2397152/1‑128 (MQ=255) aataatTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTAtt < 1:1728411/128‑1 (MQ=255) aataatTTTATAAGCAATAACTCAAGTTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTAtt < 1:23927/128‑1 (MQ=255) aatTTAATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTa < 1:929943/128‑1 (MQ=255) atTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAg < 1:856994/128‑1 (MQ=255) ttttATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAgg < 1:1874938/128‑1 (MQ=255) gCAATACCTCAATGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTaaa < 1:987965/128‑1 (MQ=255) gCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTaaa < 2:1412808/128‑1 (MQ=255) cAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGAATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTaaaa > 1:50763/1‑128 (MQ=255) taaataaatttATTGCTTTTTTATAAAAATATAAATTTTAAACAGAATAAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 1:1223180/118‑1 (MQ=255) tACCTCTAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 2:600424/128‑1 (MQ=255) tACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 1:1025848/128‑1 (MQ=255) tACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 1:1823683/128‑1 (MQ=255) tACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 2:1234823/128‑1 (MQ=255) tACCTCAAGGTATTGATTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGa < 1:317524/128‑1 (MQ=255) accttgaGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGaa > 2:711715/7‑128 (MQ=255) ccTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATATTAGGTGATTAAAATGaaa > 2:81119/1‑128 (MQ=255) aatgTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACg < 1:714320/125‑1 (MQ=255) aaGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTATAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACg < 1:602482/128‑1 (MQ=255) aGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATGTGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGa > 1:349564/1‑128 (MQ=255) gTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGGAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGAATAAAATGAAAAACGAGt < 2:1781346/128‑1 (MQ=255) gTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCATGCATATGAATATAATATGATGTTCATATTATAGTTGATTAAAATAAAAAACTAGt > 1:112352/1‑128 (MQ=255) aTTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATTCCTATTTTAGGAGAGTAACCTGAAAAACGactaa > 1:151183/1‑124 (MQ=255) ttttttATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAata < 2:2220860/128‑1 (MQ=255) tttttATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAatat > 2:90439/1‑128 (MQ=255) tttttATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAatat > 2:536530/1‑128 (MQ=255) tttttATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑‑‑‑TATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATtaa > 2:2033820/1‑128 (MQ=255) ataAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGa < 1:451128/128‑1 (MQ=255) aTACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTaaa < 2:498086/128‑1 (MQ=255) tACAAATTTTAAACAGCAACAATATTATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTa < 2:1149108/128‑1 (MQ=255) tACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTaaaa > 1:1965653/1‑128 (MQ=255) taaTTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAaacaa < 1:651041/127‑1 (MQ=255) aaTTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGttt > 1:2154515/1‑106 (MQ=255) ttAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAATATTTATAACAACAAGc > 2:749588/1‑128 (MQ=255) tAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTATTTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAacaaca < 2:1079689/124‑1 (MQ=255) tAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCt > 1:1169939/1‑128 (MQ=255) tAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCt > 2:1985188/1‑128 (MQ=255) aaaCAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAATCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTg < 2:137265/128‑1 (MQ=255) cAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGaaa < 1:2361023/128‑1 (MQ=255) caacaa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACta < 2:1639812/128‑1 (MQ=255) acaa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACtata < 1:2063627/128‑1 (MQ=255) caa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTTATTAAAATAAAAAACTAGTTTTAATAAAAAGATTTAAAACAACAAGCTTAAACTatat > 2:2259128/1‑128 (MQ=255) aa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATAtt < 2:2454521/128‑1 (MQ=255) aa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATAtt > 2:2300299/1‑128 (MQ=255) aa‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATAtt < 1:692635/128‑1 (MQ=255) a‑‑‑tatTATTATTATTATTATTATTAATTATCAATCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATAttt < 1:2259128/128‑1 (MQ=255) | AAGGAAATTGAAGAGAAGAATGAAAAAAAGAGTACGAGAGTAAAAATAAAAAACTAAATAAATAATTTTATAAGCAATACCTCAAGGTATTGCTTTTTTATAAAAATACAAATTTTAAACAGCAACAA‑‑‑TATTATTATTATTATTATTATTAATTATCAAGCATATAAATTTAATATGATATACCTATTTTAGGTGATTAAAATGAAAAACGAGTTTTAATATAAAGATTTAAAACAACAAGCTGAAACTATATTT > CP016816/117815‑118069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |