New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP016816 | = 165247 | 971 (0.850) | 134 (0.120) | 39/252 | 21.1 | 12.0% | intergenic (+211/‑331) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
? | CP016816 | 165251 = | 987 (0.870) | intergenic (+215/‑327) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/165124‑165247 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT > CP016816/165251‑165368 ATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTAGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTT > 1:2192933/1‑128 GTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTT > 1:57949/1‑128 GTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTT > 2:2286797/1‑128 GTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTATTTTTT > 2:1707263/1‑128 GTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTAG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTATTTTTT > 1:73370/1‑128 GTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGAAAATTATTAAAAAATTAATTTGAAATTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTT > 1:1171886/1‑128 TTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTT > 1:1593393/1‑128 ATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATACAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TATTTTTTTTTTTATT > 2:1583366/1‑128 TTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAta > 2:227260/1‑126 TCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTCTATATGAAAATTTTTAAAAAATTAAATTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTAataatata > 1:2209345/1‑120 GCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATATGAAATTG‑TAAA‑AA‑‑A‑TAAA‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATttaa > 1:649458/1‑124 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TATA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑C‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATTATtgcaaata > 2:2438509/1‑120 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AGCT‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTAATATTGTAA‑ATA > 2:2398219/1‑128 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑C‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTAATAATTCAA‑ATAT > 1:445577/1‑128 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTAATATTGTAA‑ATAT > 1:1112431/1‑128 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAaaatttaaat > 1:1801121/1‑118 CTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATTGAA‑ATAaa > 1:1389365/1‑126 TATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑TAGA‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATGAAA‑AAAAAAA > 1:1081169/1‑128 TATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑C‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAA‑AATTAAAT > 1:47084/1‑128 TATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGAATATGCAATTTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTATTTTTTTTTTTATAATAGTA‑ATTAAAAT > 2:2271841/1‑128 TATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTCAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AGCT‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTAATAATGTAATATATAt > 2:643174/1‑127 attAATTTGTAAGAAAATAAAAATATTATATTTTTAGATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑A‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATT < 2:881259/125‑1 ATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATTTAA‑ATAAAAATT > 1:827715/1‑128 AATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTGTTTTTTTTTGTTTTTAA‑GGAA‑ATtaatatgtttag > 2:438268/1‑116 ATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGTAA‑ATATAAATTTTAGt > 1:1162958/1‑127 TTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATTATTGAA‑ATATAAATTTTAGtt > 1:2279917/1‑126 TAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑C‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGAAA‑ATA‑ATATTTTAtttt > 2:1005934/1‑124 AGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑G‑CTTTTTTTTTTTTTTTATAATGAAA‑AAATAAATTTTttttttt > 2:537604/1‑121 GAAACTAAAAATATTTTCTTTTTATATATTTTTTGTATATGCAAAATTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑G‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTG < 1:2097643/128‑1 CTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATTAAA‑ATATAATTTTTAGTTATTTTTTTGTa > 1:1492253/1‑127 CTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑TAATGGAA‑ATATAAATTTTAGTTATTTTTTTttat > 1:1938219/1‑124 AAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTATATTTTAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTTTTttata > 1:1351994/1‑123 TATTATTTTTTTTTATATTTTTTTTATATTTAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTAT < 1:882967/128‑1 ttaatataTTTTGATATTTTTTGTTTATGAAAATTTTTTAAAAATTAATTTGAACTTG‑TCAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATC < 2:2398104/120‑1 TTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGTAA‑ATATAAATTTTAGTTATTTTTTTTTATAATTATat > 1:812113/1‑126 TATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATTTAA‑ATATAAATTTTATGTATTTTTTTTTATAATTATATA > 1:1147473/1‑128 TTTTATATATTTTTTTTATATGTAAATTTTTAAAAAATTATTTTTAAATTT‑TTAA‑AA‑‑A‑T‑‑‑‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAA < 2:143001/128‑1 tttttTATTTTTTTTATATTCAAATTTTTAAAAAATTTATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TA‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAA < 1:1729017/123‑1 TTAGATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGTACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑G‑GTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAtag < 1:175306/128‑4 tATATTTTTTGTTATTTAAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGA < 1:416520/127‑1 ATATTTTTTTTATATTTAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGA < 1:2408050/128‑1 ATATTTTTTGTTTATGGAAATTTTTAAAAAATAATTTTGAATTTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑G‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGA < 2:2381035/128‑1 ATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTACTTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGA < 1:298643/128‑1 ttTTTTTTTTATATGATAATTTTTTAAAAATTAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAA < 1:2219322/126‑1 tTTTTTTTTTTATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAG < 2:1357026/127‑1 ATTTTTTTTATTTGTAATTTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAG < 1:1016414/128‑1 TTTTTTGTATATGTAAATTTTTAAATAATTTATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑T‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAG < 2:1477010/128‑1 ttTATATTAAAATTTTTTAAAAATTAATTTTAAATTT‑TTAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAA < 2:384418/126‑1 tTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTTAATTG‑TTAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAA < 2:984315/127‑1 atattctAAATTTTAAAA‑AATTAATTTTAAATTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AT‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAAGAAAAAAT < 2:2348789/121‑1 ttatttAAATTTTTATAAATTTAATTTTAAATTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAAT < 1:1317180/122‑1 ttatttAAATTTTTAAAAAATTTATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TG‑A‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAAT < 1:1153604/122‑1 ttatttAAATTTTTAAAAAAATAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TA‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAAT < 1:1326386/122‑1 TATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑ATGT‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAAT < 2:2022576/128‑1 ttCAAATTTTTTAAAAATTAATTTGAAATTT‑TTAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATT < 2:615331/126‑1 gtaatTTTTTAAATAATTTATTTTATCTTT‑TAAA‑AA‑‑T‑T‑‑A‑‑T‑‑G‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGT < 2:910854/123‑1 aAAATTTTTAAA‑AATTAATTTTAAAATG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑ATTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTA < 1:63703/127‑1 AAATTTTTAAAAAATTTATTTTAAATTGTTAAA‑AA‑‑T‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTT < 2:840608/128‑1 AATTTTTATAAAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAA < 1:736622/128‑1 AATTTTTAAAAAATTATATTTTACATG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGGCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTA < 2:2453331/128‑1 ATTTTAAAAAAATAAATTTATCATTT‑AAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑TATTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAA < 2:2422501/128‑1 ttaaaAATTTATTTTATATTT‑TAAA‑AA‑‑T‑T‑‑AT‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATTGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTA < 1:125339/123‑1 taaaaatTTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑ATT‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTA < 1:473246/121‑1 tAAAAAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑ATT‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTA < 2:613694/127‑1 tAAAAAATTAATTTTAACTTT‑TAAA‑AAATA‑T‑‑A‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGT < 1:1176231/127‑1 tAAAAAATTAATTTTAAATTT‑TAAATAA‑‑T‑T‑‑G‑‑G‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTA < 1:851254/127‑1 tAAAAAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑G‑CTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTTTTGTATAATTATATAAAAAAATAGAAAGTAAAAAATATTGTTAAAATTAAT > 2:1474671/2‑128 ataatAATTTATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTA < 2:806995/123‑1 aaaaaaTAATTTTAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑‑‑‑GCTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTA < 1:513862/122‑1 aaaAATTTATTTTAAATTT‑TATA‑AA‑‑A‑T‑‑AT‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAAT < 2:509117/125‑1 aaaAATTAATTTTTAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAAT < 2:900838/125‑1 aaatTTATTTTTAATTTT‑TAAA‑AAT‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATA < 1:1389607/124‑1 aAATTAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACT < 1:1925017/127‑1 AATTAATTTGAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTA < 1:573183/128‑1 TAATTTTATATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AT‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAA < 2:169576/128‑1 TAATTTTAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAA < 1:2379342/128‑1 AATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATATAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAAT > 1:1995078/1‑128 atttaaattttaTAAA‑AT‑‑A‑T‑‑C‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAAT < 2:2105658/116‑1 tttaaatttttaAAA‑AT‑‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATT < 2:736876/116‑1 ttttaaaattTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑TCAT‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAAT < 2:1022164/118‑1 TGAACTTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑G‑CTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:669177/128‑1 ttACTTG‑TTAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑G‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 2:1389365/126‑1 GAAATTT‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AG‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATT < 1:2208965/128‑1 tttttttTAAA‑AA‑‑T‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATTAATTTTAGGTATTTTGTTGTATAAGTATATAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 2:11771/121‑1 ttaatttTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑G‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:197727/121‑1 ttaatttTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑AT‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATT < 2:760277/121‑1 tatttttaAAA‑AA‑‑T‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGTAA‑ATATAAATTTTATTTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:1471092/120‑1 atattttTAAA‑AA‑‑T‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTATGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:1505674/121‑1 aatttttaAAA‑AT‑‑A‑T‑‑C‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:1291956/120‑1 aatttttaAAA‑AA‑‑T‑T‑‑C‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 2:506868/120‑1 aaaTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑TA‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:95911/125‑1 AACTTG‑TAAA‑AAT‑A‑T‑‑G‑‑A‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTT < 1:1255323/128‑1 aattgtTAAA‑AT‑‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTA < 1:2124916/122‑1 tttTAAA‑AA‑‑T‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATG < 2:116603/125‑1 ttTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑T‑GTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT < 1:1626423/126‑1 tTAAA‑AT‑‑A‑G‑‑A‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAAAGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT < 1:662631/127‑1 tTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTATGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT < 2:416447/127‑1 tTAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑T‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT < 1:1242871/127‑1 TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑T‑‑TC‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT < 1:1905709/128‑1 tataaattA‑T‑‑A‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGGAA‑ATATTAAATTTAGGTTTTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGT < 2:1254834/120‑1 TAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTG‑TAAA‑AA‑‑A‑T‑‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/165124‑165247 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑T‑‑T‑TTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAA‑ATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTT > CP016816/165251‑165368 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |