Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG54.1% 835.3 / 293.4 856intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (73/306);  new base G (349/97);  total (450/406)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1024 total aligned reads displayed.

TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGC  >  CP016816/105212‑105466
                                                                                                                                |                                                                                                                                      
 tgattaacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTAATTATATTATTTAT‑AATTATAATAtaatta                                                                                                                                       >  1:2054042/8‑128 (MQ=255)
 tgattaacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTAT‑CATTTTAATAtaatta                                                                                                                                       >  2:256588/8‑128 (MQ=255)
 tGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTATATTTAT‑ACTTTAAATAtaatta                                                                                                                                       >  1:971260/1‑128 (MQ=255)
  gTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATAtaatgaa                                                                                                                                      <  1:1835488/128‑1 (MQ=255)
  gTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGAATTATTAGTTTATTTAT‑AATATTAAAAtaataaa                                                                                                                                      >  1:1873248/1‑128 (MQ=255)
   ttAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATAtaatgaat                                                                                                                                     <  1:1164539/128‑1 (MQ=255)
    tAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                    <  1:1757955/128‑1 (MQ=255)
     taacAAGCATTTTTTATATGTAAAATCACTAATTAAAGTATGAAATAATAAAGAATAATGTTAATATAAATTAGCTATCTATTTATTAGGAATGATAAGTTTATTTAT‑CCATTTAATAAAAtgaattt                                                                                                                                   >  1:3193564/4‑128 (MQ=255)
     aaTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTGATTAGTTTATTTAT‑CATTTTAATATAAtgaattt                                                                                                                                   >  2:129348/1‑128 (MQ=255)
      aTCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                  <  2:2157294/128‑1 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTAATTTAA‑CCTTTTAATATAAtaaattta‑a                                                                                                                                >  1:2184235/2‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATATAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAAttaattta‑at                                                                                                                               >  1:1363229/1‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAAtgaattta‑at                                                                                                                               <  1:284277/128‑1 (MQ=255)
         aagacatttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATTAAATAATAAATAATAATGATAATATAAATAATATAATAATTTATTATTAATGATTAATATATATAT‑CATAAAAATATAAagaatata‑ata                                                                                                                              >  1:1512220/7‑127 (MQ=255)
         aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTAGTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATgaattta‑att                                                                                                                              >  2:3117004/1‑128 (MQ=255)
          aGCCTTTTTTAGTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATtta‑atta                                                                                                                             <  1:322477/128‑1 (MQ=255)
           tcattttttATTTGTAATATGACTTATTATAGTATGAATTTTTAATTATTTATGTTAATATATATTTTCTATGTTTTTATTTTTATTTATTAGTTTTTTTTT‑CGTTTTAATATTATTAATtta‑attaa                                                                                                                            <  2:1970111/125‑1 (MQ=255)
            ccTTTTTTATTTTTAAAATAACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTAATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTaaa                                                                                                                           <  2:525945/128‑1 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATTTATTAGTTTATTTAA‑ACTTTTAATATAATTAATATA‑ATTAAAatat                                                                                                                       >  1:534146/1‑128 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATTAATATA‑ATTAAAatat                                                                                                                       >  1:1033042/1‑128 (MQ=255)
                   tATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATAtttt                                                                                                                    >  1:2899280/1‑128 (MQ=255)
                    aTTTGTAAAATCACTTATTATAGAAAAAAATAATAAAGAATAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTATTATGATTTATTAATTAAAATAT‑CATTATAAAATAATAAATTAA‑ATAAAAataaaaaa                                                                                                                   >  1:2450473/1‑123 (MQ=255)
                     tttGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGGATTTATTATTTTATTTAT‑CATATTAATATAATAAATTTA‑ATTAAAATATTAt‑‑aa                                                                                                                >  2:1740361/1‑128 (MQ=255)
                      ttGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTAATTATTAGGATTTATTAGTTTATTTAT‑CCTTATAATATAATTAATTAA‑ATAAAAATATATa‑‑aat                                                                                                               >  1:888851/1‑128 (MQ=255)
                          aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTAATTATTTTATTTAT‑CATTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATATA‑‑AAT‑‑aaaa                                                                                                         >  2:2935713/1‑128 (MQ=255)
                           aaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaa                                                                                                        >  1:2991642/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATGATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaa                                                                                                       >  1:1054364/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CATTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaa                                                                                                       >  1:1636889/1‑128 (MQ=255)
                             aTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTAAA‑CATTTTAATATAATAAATTAA‑ATAAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaa                                                                                                      >  1:324615/1‑128 (MQ=255)
                             aTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaa                                                                                                      >  2:3223775/1‑128 (MQ=255)
                                   tattatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                >  1:2563599/1‑128 (MQ=255)
                                     ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CATTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aa                                                                                             >  1:801561/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaa                                                                                            >  1:1793931/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTTATTATTTTATTTAT‑AATTTTAATATAATTAAATTA‑ATAAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaa                                                                                            >  2:3185474/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaa                                                                                            >  1:1592914/1‑128 (MQ=255)
                                       atatTATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTAGCAAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTAA‑CCTTTTAAAATAATGAATTTA‑ATTAAAAAATTTT‑‑aaa‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaaa                                                                                           <  2:2903878/128‑1 (MQ=255)
                                       ataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTAT‑AATTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaaa                                                                                           >  2:2613017/1‑128 (MQ=255)
                                         aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATATATTATTTTATTAAT‑ACTTTTAATAAAATAAAATTA‑AATAAAATATTAT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa‑aaaaaa                                                                                         >  1:440947/1‑127 (MQ=255)
                                         aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAc                                                                                         <  2:2492952/128‑1 (MQ=255)
                                              gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑Aaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaaaaa                                                                                    >  1:311480/1‑125 (MQ=255)
                                                  taataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑Aaaaaaaaaaaaa‑aaaaaaaataaataa                                                                                >  1:3295571/1‑121 (MQ=255)
                                                         gATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAA‑AAAACATAATAttataa                                                                        >  2:2652045/1‑124 (MQ=255)
                                                          aTTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAATAAAATTTTTa                                                                        >  1:2816537/1‑128 (MQ=255)
                                                              attttaaattaAATTTTCTAATTTATTATTATTATTTTTTATTTTATTTAA‑CATTTTAAAATAAATAATTTA‑ATTAAAAAATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTaaaaa                                                                    <  2:1757123/119‑1 (MQ=255)
                                                              attttAATATAAATTAGATAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAAc                                                                   <  2:2081201/125‑1 (MQ=255)
                                                              aTGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACATATAAATTTTaaaaa                                                                    >  1:2690787/1‑128 (MQ=255)
                                                                tttAATATAAATTATATAAGTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaat                                                                <  1:1228768/127‑1 (MQ=255)
                                                                  tAATATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTAT‑ACTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAA‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaat                                                                <  2:1133792/128‑1 (MQ=255)
                                                                   aaTATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAACATAAAATTATAaaaaaaaaaa                                                               >  2:2700367/1‑126 (MQ=255)
                                                                    atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑AATTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAATATTATAAAAAAAaaat‑a                                                             >  2:1045500/1‑128 (MQ=255)
                                                                       taAATTATCTTATTATTTTTTATGATTTTTTTTTTTATTTAT‑ACTTTTAATAAAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaatt‑aatt                                                          <  1:2636953/128‑1 (MQ=255)
                                                                        aaaTTATATAATTATTTATTATTATTTTATATTTTATTTAT‑AATTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAAAATTTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaatt‑aatt                                                          <  2:407016/128‑1 (MQ=255)
                                                                              tgtAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCtt                                                   <  2:2843495/126‑1 (MQ=255)
                                                                              gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAATATTTTAAAAAAAAAtt‑aattaataata                                                   >  1:1435676/1‑123 (MQ=255)
                                                                               cTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑AATAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAAAAAAAAATTATAAAAAAAAAat‑aaataataatta                                                  >  1:2330128/1‑122 (MQ=255)
                                                                                  aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAATAAAAAAAATTTTTAAAAAAAAtt‑aattaattatttaat                                               >  2:2986310/1‑119 (MQ=255)
                                                                                   gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAGACATAAAATTTTTAAAAAAAAtt‑aattaaataattatat                                              >  2:2763537/1‑118 (MQ=255)
                                                                                   gTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTGTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAAAACATAATATT‑TTAAAAAAAAat‑aataaaataattatat                                              >  1:2722453/1‑118 (MQ=255)
                                                                                    tatttattAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAA‑AAAACATAAAATTTTTAAAAAAAATT‑AATTAATTATTAATttat                                            >  1:2597670/1‑128 (MQ=255)
                                                                                      tttattAGGATTTTTTATTTTATTTAT‑CCTTTTTATATTATTAATTTA‑ATTAAAATTTTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATttatta                                          <  1:765330/128‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttattAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAATAAATAATATTTTTAAAAACAATT‑AATTAATTATTAATttata                                           >  2:2806552/1‑127 (MQ=255)
                                                                                      atttttaGTATTTATTTATTTTTTATT‑CCTTTTAAAATAATTAAATTA‑ATTTAAAAATTTA‑‑AAA‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCCAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATttatt                                           <  2:1659101/124‑1 (MQ=255)
                                                                                        ttttttgtttttttAGTTTATTTTT‑ACTTTTAATATAATTTATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATttatta                                          <  2:920862/116‑1 (MQ=255)
                                                                                        tatttttattttttATTTTTTTTAT‑ACTTTTAATAAAATTAATATA‑ATTAAAAATATTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATTTATTaa                                         <  1:406357/116‑1 (MQ=255)
                                                                                        tattaGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATGAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAAACAAAATATTTTTAAAAAAAATT‑AATTAAATATTTattaatta                                          >  2:2527018/1‑128 (MQ=255)
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                                                                                                                             aatgaattTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAAATACATAATATTTTTAAAAAAAATT‑ATTTAAATATTTATTTATTAAATATTATTTTTAAACAAATTTAACTTGATATAAAta     >  2:869069/1‑127 (MQ=255)
                                                                                                                               ttaattta‑aaTAAAAT‑TTTT‑‑TAT‑‑TAAAAAAAAAAAA‑AAATACAAGACCTAATATTTTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGc  <  2:3297209/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                |                                                                                                                                      
TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTAT‑CCTTTTAATATAATTAATTTA‑ATTAAAATATTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAA‑AAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATT‑AATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGC  >  CP016816/105212‑105466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑