New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 294244 = | 123 (1.340) | 4 (0.040) | 4/586 | 12.9 | 3.2% | coding (556/855 nt) | yagM | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein |
? | NC_000913 | 294263 = | 121 (1.350) | coding (537/855 nt) | yagM | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTAT > NC_000913/293949‑294541 | gCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCttt > 1:305236/1‑301 (MQ=255) ctcactTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCttt < 1:463665/300‑1 (MQ=255) ttctggggagaATGGGTTAATAATGTGGTCATCGGGTACATTACCACGTTGGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACATTTTCATTAACATGGTAAATATAAATCCAACAAACAACCGAATAAGGCATAAAAACCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAAAAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACa < 1:36270/294‑1 (MQ=255) tgtgAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCATGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATACGAATAATGTTTAACTATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑aa > 2:768102/1‑301 (MQ=255) aGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAAt < 2:197014/300‑1 (MQ=255) tATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATg < 2:821534/299‑1 (MQ=255) ggTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGTATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCATGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATTCTGAGACAGttcggaagagcgtcgtgtagggaaagag > 1:759928/1‑275 (MQ=255) ggTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTg > 2:181900/1‑301 (MQ=255) ggTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTg > 1:193727/1‑301 (MQ=255) ttATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGAtt < 2:329272/301‑1 (MQ=255) tataATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATtg > 2:282713/1‑301 (MQ=255) tataATGATGGCATCCGGTACAATAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAAACACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCAAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTGCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAGAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACAAC‑AAAATGTCTTTGATtg < 1:49546/301‑1 (MQ=255) cttaATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATtg < 2:23485/299‑1 (MQ=255) ataATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACCACCGGATCAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAGTGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AGAATGTCTTTGCTtgt > 1:164723/1‑301 (MQ=255) tcaatactgtttaacagacacacGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATtgtaaa‑tg < 1:427548/282‑1 (MQ=255) tCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATtgtaaa‑tgtaaa > 2:528358/1‑301 (MQ=255) cATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTgtaaa‑tgtaaat > 2:700837/1‑301 (MQ=255) cGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCt < 1:282710/301‑1 (MQ=255) ttAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCa > 2:494954/1‑301 (MQ=255) tggagttcagacgtgtgctcttccgatctaCTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATc < 2:149507/272‑1 (MQ=255) cacGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCatat > 2:118463/1‑300 (MQ=255) gTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGTATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTaa > 2:209139/1‑301 (MQ=255) gAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCTTGAGACGCTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGCCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTATtttt > 2:350490/1‑301 (MQ=255) aaCATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTcc < 2:607531/301‑1 (MQ=255) aCATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTcc > 1:161535/1‑300 (MQ=255) aTCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCtt > 2:443359/1‑301 (MQ=255) gTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCACAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCg > 1:140843/1‑301 (MQ=255) ttGCGGAGCACTGGAAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAgg < 1:806607/301‑1 (MQ=255) 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aTTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGTCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCTTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCATTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATCACTGtttttt > 1:576320/1‑301 (MQ=255) ttGACATGGTAAATACCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCGTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATGATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGGTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTGTCACGTATAACTGTTTTTTCATCtt < 1:768092/301‑1 (MQ=255) gACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCttt > 1:741941/1‑300 (MQ=255) 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aaTATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCAtttt < 1:379936/300‑1 (MQ=255) tCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTCCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTAtt > 2:507433/1‑301 (MQ=255) ccTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTAttt > 1:21759/1‑301 (MQ=255) 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GTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATC‑AAAATGTCTTTGATTGTAAA‑TGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTAT > NC_000913/293949‑294541 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |