New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3826376 = | 186 (0.840) | 5 (0.020) | 5/544 | 31.6 | 2.6% | coding (1167/2082 nt) | recG | ATP‑dependent DNA helicase |
? | NC_000913 | 3826574 = | 193 (0.910) | coding (1365/2082 nt) | recG | ATP‑dependent DNA helicase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
GGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTCCTGATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGT > NC_000913/3826278‑3826873 | tAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCCCGGTGATAGAGGAGCTGCCGCCAGGCCCCACGccc > 3:1165049/1‑300 (MQ=255) aGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTg < 4:779051/301‑1 (MQ=255) gCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTg > 4:365655/1‑300 (MQ=255) gaccgctggcgatggcttcctgctgtgCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCCCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTgcg > 3:342439/27‑299 (MQ=255) ccGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACAAGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACTGCCTGGCGCTAGTGATTATAGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACt < 4:771141/300‑1 (MQ=255) cagcagGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCt > 4:873117/1‑300 (MQ=255) ggAAGCCATCGCCAGCTGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTAGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGATCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCGCGATACTTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTccc > 4:1570900/1‑300 (MQ=255) 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ggCCGCACGCCAGTGACTACGTTCGCTATTCCTGATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTg < 4:1693415/301‑1 (MQ=255) cGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTCCTGATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAg > 1:29358/1‑301 (MQ=255) | GGTAAAGCACGGCTGGCACAGCAGGAAGCCATCGCCAGCGGTCAGGTGCAGATGATTGTCGGTACACACGCCATCTTCCAGGAACAGGTGCAGTTTAACGGCCTGGCGCTGGTGATTATCGACGAACAGCATCGTTTTGGCGTGCATCAGCGTCTGGCATTGTGGGAGAAAGGCCAGCAGCAGGGCTTCCATCCGCATCAGTTGATCATGACCGCCACGCCGATCCCCCGCACGCTGGCAATGACTGCGTATGCCGATCTCGATACCTCGGTGATAGATGAGCTGCCGCCAGGCCGCACGCCAGTGACTACGGTCGCTATTCCTGATACCCGCCGTACCGACATCATTGACCGCGTGCACCACGCCTGCATAACTGAAGGTCGTCAGGCATACTGGGTTTGTACGTTGATTGAAGAGTCGGAATTGCTGGAAGCGCAGGCGGCGGAAGCTACCTGGGAAGAGTTGAAACTGGCGCTACCAGAGTTGAACGTTGGCCTGGTACACGGGCGGATGAAACCTGCCGAGAAACAGGCGGTGATGGCGTCGTTTAAACAAGGTGAGCTACACCTGCTGGTTGCCACAACCGTTATTGAAGT > NC_000913/3826278‑3826873 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |