| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,920 | C→T | 7.0% | intergenic (+64/‑65) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,920 | 0 | C | T | 7.0% | 164.0 / 2.5 | 57 | intergenic (+64/‑65) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/27); new base T (2/2); total (28/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
GTGAACCAATGAGAGGCAACAAGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAG > NC_000913/2758620‑2759214 | gTGAACCAATGAGAGGCAACAAGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGcc < 2:482046/301‑1 (MQ=255) aaCCAATGAGAGGCAACAAGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTa > 2:280311/1‑301 (MQ=255) gagaGGCAACAAGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAAAATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAACg > 1:35138/1‑301 (MQ=255) acaaGAATTAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGGaaatagca < 2:463172/301‑7 (MQ=255) aGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCCGTAAACTTATTTGAGGGTGTTCCATGAATTCATACTCAATTGACTTCATCGGAGTGTAAACATCCTTCTATTTCCACCATTAATAGCGAAATAACCaaa > 1:390835/1‑299 (MQ=255) aaTCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTaaa > 1:481830/1‑301 (MQ=255) cgGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCATGCTATTTCCCCCATTACAAGCGGAATAGCCCCATTTGCTAAACAAtttt > 1:334610/1‑300 (MQ=255) ggCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGCTTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGAGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGAGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACaaaatct > 2:536498/1‑296 (MQ=255) gCCGTTTGATTCCTACTGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTTGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtt < 1:606224/301‑1 (MQ=255) gTTAGAATACTACGGTTACCATCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGGaaatagcaggatgtttacactccgatgacagc < 1:280008/301‑31 (MQ=255) atAGCATACTTAGGTTACCCGCGGTTATTACAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACACTCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGATCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatt < 1:479243/300‑1 (MQ=255) tAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 2:530917/301‑1 (MQ=255) aaTACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGACATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTAAATTGCTGTCATCGGCGTTTAAACCTCCTACTATTTCCACCATAAATATCGGATTAGCCATATTTGCAAACCAATTTTttattttaat > 1:334963/1‑301 (MQ=255) ccgtatACCAGCGGTTATCCAAAAAAAAGGGTTGGAACGGGCCACCATTTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGTTACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATa < 1:329394/296‑1 (MQ=255) cccAGCGGTTATCCAAAAAACAGGGTTGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGc < 1:237187/300‑1 (MQ=255) ccAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCa > 2:237454/1‑301 (MQ=255) gTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAATGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCAt < 1:222957/301‑1 (MQ=255) accAAAAAACAGGTTGGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGGTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTGCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTc < 1:535195/300‑1 (MQ=255) cAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 1:212459/1‑301 (MQ=255) aaaaaCAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAAAGGCATTGCATGTTCAAtt > 1:120780/1‑300 (MQ=255) gCAGGGGCCTCCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTccc < 1:466507/301‑1 (MQ=255) cACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCt < 2:482431/301‑1 (MQ=255) ggCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAg < 2:335015/301‑1 (MQ=255) cTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCATGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTCATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTACCTGTAGATGAATTTc > 1:159494/1‑301 (MQ=255) tGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaaaaa > 2:22180/1‑300 (MQ=255) aCCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAgg < 2:212702/301‑1 (MQ=255) tCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAt < 2:120904/301‑1 (MQ=255) acgagGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTTGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTTAGGCCGAGATGGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCC‑‑TAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa < 1:431267/301‑1 (MQ=255) cgatGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTCAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTgg > 1:573489/1‑301 (MQ=255) tccACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACa < 2:335368/300‑1 (MQ=255) cACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTACTAAAATTATCAGGAATGCAATTACTGAAGTGGAACAGc > 1:401649/1‑301 (MQ=255) tttccgatctaGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATAc < 2:195186/291‑1 (MQ=255) aaGCGGATGGTGGGGGTGTAATCTGTCTGATGGATTGTGGCCGGGATTGATGAGTGGTTATAACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGcccc < 1:81291/301‑1 (MQ=255) aGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGAAACAGCATAcaaaacggaaa > 1:194943/1‑291 (MQ=255) cGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCa > 2:365884/1‑301 (MQ=255) gAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAAATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCaa > 1:444323/1‑301 (MQ=255) ttcTCGGCGTTAAATGTGTTGGATGGATTGATGTCGAGATTTATGAGTGGTTATCATAACGCTGTAATCTTATTTGAGTGTGTTACATTAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTCAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATACGTGGCCTTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCATTTTATGAAGTGTAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGt < 1:535825/299‑1 (MQ=255) tGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGt < 2:35189/301‑1 (MQ=255) tggCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGa < 2:391349/300‑1 (MQ=255) gTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATtgc > 2:369379/1‑301 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTTAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGcc < 2:159645/301‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAAATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGcc < 2:444887/301‑1 (MQ=255) atgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGt > 2:403969/1‑301 (MQ=255) tATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTACAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCgg > 1:42382/1‑301 (MQ=255) tttATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTTAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGAtt < 1:403406/300‑1 (MQ=255) aGGGTGTTACATGAATTCTTACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATc < 1:365400/301‑1 (MQ=255) gggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCACCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTAAACAATCt > 1:407841/1‑301 (MQ=255) tACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTgg > 1:29236/1‑301 (MQ=255) aCATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCAGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGc > 2:115678/1‑301 (MQ=255) tGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGcccc > 1:177079/1‑300 (MQ=255) taaTTCATACTCAATTGCTTTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCgg < 2:42435/300‑1 (MQ=255) tACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACt > 1:393612/1‑301 (MQ=255) aaTTGCTGTCATTGGAGTTGAAACCTCCTGCGTTTTCCGCCATTAATAGCTGAATAGCCATATTTGCTGATCAATTTCTTAAGTTAATTAAATAAGAGGCATTGCAGGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCt < 1:368895/301‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCt < 1:22129/301‑1 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACTTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATTACTCTGGc > 1:219181/1‑301 (MQ=255) tCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGa < 2:177276/301‑1 (MQ=255) tggctattCCGCTATTAATGGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGACCCAGATTTATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGACCCGGTATCCCTTTTATTAATGAATCTGGCTTACACAGGTaaaac > 1:502104/7‑299 (MQ=255) ttCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAagag > 1:42010/1‑301 (MQ=255) | GTGAACCAATGAGAGGCAACAAGAATGAACAATCGATCGGCCGTTAGAATACTACGGTTACCAGCGGTTATCCAAAAAACAGGTATGGCACGGGCCACCATCTATGACTGGTTGAACCCCAAATCACCACGATACGATGCCACCTTTCCCAAAAAGCGAATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTCAAGGTTTGATTGCTGCTTCTGCTCTTGGGGTAATTTCTCTTGCCTGTCAGAACCGGATTGATGTTTGCCGATTGAATAATCTACGTGGCCCGGTATCACTTTTCTTAATGACTCTGGCTGAATCAGGTGAACGTAAGAG > NC_000913/2758620‑2759214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |