Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_000913 | 1,153,219 | G→A | 6.5% | intergenic (+39/‑81) | fabF → / → pabC | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II/4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 1,153,219 | 0 | G | A | 6.5% | 251.0 / 3.3 | 85 | intergenic (+39/‑81) | fabF/pabC | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthase II/4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/41); new base A (4/2); total (42/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGGCGCTGCGCGATCAGGCTGTTCCGCCAACCATCAACCTGGATAACCCGGATGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAA > NC_000913/1152926‑1153518 | ttgtTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGGCGCTGCGCGATCAGGCTGTTCCGCCAACCATCAACCTGGATAACCCGGATGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCttttt < 2:412948/300‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |