Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,067,747 | 0 | T | A | 9.1% | 182.2 / 7.4 | 66 | intergenic (‑39/‑334) | wrbA/ymdF | NAD(P)H:quinone oxidoreductase/KGG family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/30); new base A (2/4); total (31/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.42e-01 |
ATTTGACCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTAT > NC_000913/1067449‑1068045 | aTTTGACCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGAATc > 2:583724/1‑301 (MQ=255) 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tCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGaa < 2:462504/301‑1 (MQ=255) aaCCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACAAATTTTTCTCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGTCTTATGGATAAATATTGTAGATGATATCTATTCTCGCTCATAAGCTGTTGCAGGCTATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTAACTAAGATTAGTCCAACGAACCGAAAat > 1:555991/1‑301 (MQ=255) aCCACTTCTCGTGTTATTTTTTTTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAata < 1:212025/301‑1 (MQ=255) 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ATTTGACCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTAT > NC_000913/1067449‑1068045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |