New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3136627 | 58 (1.010) | 5 (0.090) | 6/550 | NT | 7.9% | intergenic (‑256/+36) | pitB/gss | phosphate transporter/glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
? | NC_000913 | = 3136632 | 61 (1.120) | intergenic (‑261/+31) | pitB/gss | phosphate transporter/glutathionylspermidine amidase and glutathionylspermidine synthetase |
CCCTGTGTATATATCAAGGCCAACAAATAAATTTAGCATATATTAGATTACGCCATTTTGAATTTACGAACGGACGCATTATCAGTGACTTTAACGGCATGGGCAAAGTGAAATATCATTTTTTAACGATAAAAAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCATAATCAGTACGGGGTTGCTACAACATGTATTACTTTTTCACCACAATTAACGGTTCAATATCACTCTCTTTTTTGATGACCAGTGATTCATCACCGCGCAAACACGTCCCACCGTAGTTGCCGCCAACGGTGAAGGTACATACCTGAATGTATTTACCGTCCACTTTCGGCAAACACCACAGTTG‑CTGATAGATGTTTTTCTGCTCGGCAAATTTACCGCTGGTTTTGTCCAGCACCTCTTCATGATGGCTGACGAGGTCGATATTGCTGCCACAGCGACCGGCGATCGGTTTCACTG > NC_000913/3136333‑3136931 | gacgtgtgctcttccgatctcaacaaataaatttagcatatattagATTACGCCATTTTGAATTTACGAACGGACGCATTATCAGTGACTTTAACGGCATGGGCAAAGTGAAATATCATTTTTTAACGATAAAAAGAGTGTTATTTCTTGTGTATCAGACAATAAGCATTCATTCAAAACCTTTAGAAATAATCAAAACACAGGTATTCCACTGGTTAATATATTCACATATGAAATGAATAAATATTGGAATATATAAATATTGAATATTTTGATTAATCCCCGTACTGATTATTCTTCa > 2:474296‑M2/21‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |