New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1067740 = | 59 (1.030) | 2 (0.040) | 3/566 | NT | 3.4% | intergenic (‑32/‑341) | wrbA/ymdF | NAD(P)H:quinone oxidoreductase/KGG family protein |
? | NC_000913 | 1067755 = | 56 (1.000) | intergenic (‑47/‑326) | wrbA/ymdF | NAD(P)H:quinone oxidoreductase/KGG family protein |
CCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATG > NC_000913/1067455‑1068046 | ttaacgcggcgtatggcggctgccatattttcgctacgtgggactaagcttagtgaactgacgcgggcagacccgcgtttggtaatatcctgcaacagcgtcttagcgagaatagatatcatctccaataattatccataagccgctcttatgattaaaaaaacgcgatgagataaaaatgtgtcattttgcgacaaaattacgtgcttgtgaaagttgttataaatcaaataagtggttgtgaaatttgcactctgaaaaggacgtcttatctttaaataagtggtagcgattcgctacc < 1:62889‑M2/1‑1 (MQ=255) 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tGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATCATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCCGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACCCGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTTCGCGTTCCATCGTTTCAATCTGTCCGTACATGGACTAATAACGCACCAGAACTTTAGCCATTACTAACACCTCCTCGTGTTCACTCTATTCCATAGCCATTCCCTACCACTTATTTat > 1:499105/1‑300 (MQ=255) cAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGa < 2:132663/301‑1 (MQ=255) aCCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGAACACTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCa > 2:436760/1‑301 (MQ=255) 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tCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGaa < 2:462504/301‑1 (MQ=255) aaCCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACAAATTTTTCTCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGTCTTATGGATAAATATTGTAGATGATATCTATTCTCGCTCATAAGCTGTTGCAGGCTATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTAACTAAGATTAGTCCAACGAACCGAAAat > 1:555991/1‑301 (MQ=255) aCCACTTCTCGTGTTATTTTTTTTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAata < 1:212025/301‑1 (MQ=255) 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GCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGCGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCCTCAGTTCACTAAGCCTAGTCCCACGTACCAAAATAATGGCAGCCGCCATACCCCccgttactttt < 1:2457‑M1/301‑6 (MQ=255) GATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTAt > 1:432255‑M1/1‑301 (MQ=255) tttctttacCATTTATTTAAAGGTAATACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATg < 2:607733‑M2/292‑1 (MQ=255) | CCGGACATGTTGCCAAAGCGGGTAGGTGTACCAAAAATAATGGCGTCGTAATCGGCCAGTTCTTGCGGGGTTGCAACCGGTGCAGTTTGCGTTTTACCGCCTGCTTTTTCAAATAATTGCGGCGGCATGGTTTCCGGTACACGCTTAACGACAACTTCAGCGCCATCCACTTTGCTTGCACCCTCAGCGACTGCGCGTGCCATCGTTTCAATATGTCCGTACATGGAATAATAAAGCACCAGAACTTTAGCCATTTCTAACCACTCCTCGTGTTATCTCTATTCCGTAGCGATTCGCTACCACTTATTTAAAGATAAGACGTCCTTTTCAGAGTGCAAATTTCACAACCACTTATTTGATTTATAACAACTTTCACAAGCACGTAATTTTGTCGCAAAATGACACATTTTTATCTCATCGCGTTTTTTTAATCATAAGAGCGGCTTATGGATAATTATTGGAGATGATATCTATTCTCGCTAAGAAGCTGTTGCAGGATATTACCAAACGCGGGTCTGCCCGCGTCAGTTCACTAAGCTTAGTCCCACGTAGCGAAAATATGGCAGCCGCCATACGCCGCGTTAATTCTATG > NC_000913/1067455‑1068046 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |