| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 947028 = | 54 (0.940) | 3 (0.050) | 3/552 | NT | 5.9% | intergenic (+9/‑201) | ycaD/ycaM | putative MFS transporter, inner membrane protein/putative transporter |
| ? | NC_000913 | 947064 = | 45 (0.820) | intergenic (+45/‑165) | ycaD/ycaM | putative MFS transporter, inner membrane protein/putative transporter | |||||
CGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATG > NC_000913/946730‑947328 | cccatgaaaaaacaaccaccagccccttgttggcatagttattaataacgttgccaaaaccccatacagtgataaaagacatcagcgcaatgttgtaccatcgcaactgtttttcctgaacattcccagccatagacaaatccttcgccaaaattaaaggggcatcggtaaaacgagggattatgcgcggcaaataagaagtgcggaaatagcgaaatgcaaaattataacctgctgcacattttatttttaaacgaataaaatttggaataaagcaagtcagatagaagaaacaaaaAAg > 1:200475‑M1/299‑301 (MQ=255)acccatgaaaaaacaaccaccagcccctggttggcatagttattaacaacgttgccaaaaccccagacagtgataaagacatcagcgcaatgttgtaccatcgcaactgtttttcctgaacattcccagccatagacaaatccttcgccaaaattaaaggggcatcggtaaaacgagggattatgcgcggcaaataagaagtgcggaaatagcgaaatgcaaaattataacctgctgcacattttatttttaaacgaataaaatttggaataaagcaagtcagatagaagaaacaaaaAAg > 2:9202‑M1/299‑301 (MQ=255) ccgccAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCTCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATTGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCagag < 1:456319/298‑1 (MQ=255) aacaaccaccagcccctggttggcatagttattaacaacgttgccaaaaccccagacagtgataaaagacatcagcgcaatgttgtaccatcgcaactgtttttcctgaacattcccagccatagacaaatccttcgccaaaattaaaggggcatcggtaaaacgagggattatgcgcggcaaataagaagtgcggaaatagcgaaatgcaaaattataacctgctgcacattttatttttaaacgaataaaatttggaataaagcaagtcagatagaagaaacaaaaAAGCAGAGTGTGa < 1:273171‑M1/13‑1 (MQ=255) aGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGCGa > 2:178403/1‑301 (MQ=255) cATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGt > 2:217350/1‑301 (MQ=255) ttcttCGGTGCCGCGTTCTGTATGCTATATCCGGTGGTGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACGGGTGGCGATTAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGtt < 1:485928/297‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGaaacagtaagttcacactc < 2:154286/301‑18 (MQ=255) ctcTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTGACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGc < 2:208152/299‑1 (MQ=255) tGGCTTTACGCTATTTCCGGTTGCGATGGCATGAGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGaaacagtaagttcacactctgcttg < 2:58846/301‑24 (MQ=255) ttttACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCtttttt < 2:316059/300‑1 (MQ=255) cTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCtttttt > 2:110236/1‑301 (MQ=255) cGCTATTTCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGCGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttc < 1:178206/301‑1 (MQ=255) ttataTCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttctt < 2:619331/300‑1 (MQ=255) aatatCCGGTGGCGATGGCATGGGTTTGCTAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTttcttc < 1:574436/300‑1 (MQ=255) atCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTAt > 1:91451/1‑301 (MQ=255) tGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCttt > 2:146135/1‑301 (MQ=255) gAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTaaa < 2:379149/301‑1 (MQ=255) ttgtgctcttccgatctgCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTaaaa < 2:527680/284‑1 (MQ=255) aaCTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGGTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCGATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAAtgt > 2:368931/1‑301 (MQ=255) aCTGGTGGCGGTGAACTAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAAtgtg < 1:146009/301‑1 (MQ=255) gCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTTTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTaaaaagatcggaaaagcgtcg > 1:527007/1‑285 (MQ=255) cGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGt > 2:41456/1‑301 (MQ=255) gggtttATTGTTGGGCTATACTGTGGTAAGTTTGCTTGGCCCGTCATTTACCTCTATGCTAATGCAGAATGTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTg < 1:409632/297‑1 (MQ=255) ttgttgtggttgtatttgGGAAGGTTGCTTTGGCCTTCATTTACCGCTATTCTAATTCAGAATTTCTCCGATAATTTAGTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCg < 1:13472/285‑1 (MQ=255) 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tgCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATg < 2:318287/300‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATg < 2:7972/301‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATg > 2:252446/1‑301 (MQ=255) ccAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGtt < 1:368447/301‑1 (MQ=255) cGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGagatcggaagagcaa > 2:7250/1‑287 (MQ=255) tCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTg < 2:88191/301‑1 (MQ=255) cTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGc > 2:447044/1‑301 (MQ=255) tGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGAATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGTTTTGTCTATGGCTGGGAATGTTAAGGAAACACAGTTGCGATgg > 1:205295/1‑301 (MQ=255) gCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGt > 2:173769/1‑301 (MQ=255) tgctgcGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACAtt > 2:378275/1‑301 (MQ=255) aaacgaataaaatttggaataaagcaagtcagatagaagaaacaaaaAAGCAGAGTGTGAAACAGTAAGTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTAGCGATGGTACAACATTGCGCAGAt < 2:629721‑M1/254‑1 (MQ=255) aaCGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGAt > 2:273474/1‑301 (MQ=255) gCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAACATGTGCAGCAGGTTATACTTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTCAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGAGATGATACAACATTGCGCTGAAGtt > 1:546588/1‑300 (MQ=255) cGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTTACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCtt < 1:252178/301‑1 (MQ=255) cccGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTgggg > 2:247530/1‑301 (MQ=255) gCTTACGTGTAAATGAATTTAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTgg < 1:173572/301‑1 (MQ=255) cGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACg > 2:101983/1‑301 (MQ=255) AAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATg < 2:323903‑M1/301‑1 (MQ=255) | CGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATGGCTGGGAATGTTCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATG > NC_000913/946730‑947328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |