| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,653,262 | Δ1 bp | 7.5% | coding (654/1020 nt) | rspB ← | putative Zn‑dependent NAD(P)‑binding oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,653,262 | 0 | A | . | 7.5% | 160.7 / 6.0 | 53 | coding (654/1020 nt) | rspB | putative Zn‑dependent NAD(P)‑binding oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/25); new base . (2/2); total (25/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
GCAACATGCTGGAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCGGAACCACGGCATA > NC_000913/1652966‑1653558 | gCAACATGCTGGAAATTAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCg < 1:236429/301‑1 (MQ=255) tctcttccgatctaTCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCgg < 2:72590/288‑1 (MQ=255) tGGAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGc < 2:238038/301‑1 (MQ=255) aaaTCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGt < 1:152299/301‑1 (MQ=255) aTCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCggagatcggaaaagg > 1:72500/1‑288 (MQ=255) tCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGttat > 2:579313/1‑301 (MQ=255) aaaaaaGTAGGGGAAATTAATGTTGTTGGTTTAAGTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTGAGTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAAGTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGttat < 1:325061/299‑1 (MQ=255) aaaCGTTTGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGttatta < 2:257974/301‑1 (MQ=255) ccgatctattaattTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGcc < 2:232311/294‑1 (MQ=255) attaattTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGccagaacgg > 1:232068/1‑294 (MQ=255) ttttAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCttt < 2:202680/300‑1 (MQ=255) tttAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTc < 1:578597/301‑1 (MQ=255) ccTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCa > 2:600934/1‑301 (MQ=255) tAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATc > 2:315018/1‑301 (MQ=255) cGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTTTCTGGCTGTTATTAATCTCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCATTCGTTCATCAATTCGATCGGc > 2:427667/1‑301 (MQ=255) gATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGca < 1:314614/301‑1 (MQ=255) cGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAAtacaaacgccacca > 1:87358/1‑288 (MQ=255) tGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTa > 2:556112/1‑301 (MQ=255) ttttAAGCGTGAAGAGAAAATATAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCACTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACg < 2:489464/300‑1 (MQ=255) cGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGa > 1:281260/1‑301 (MQ=255) tGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCCCTCTTTCGCTTTTTCCAGTTGTTCAACAATGCGAACGGACACAATCACATTTTTAACGTTATAGAcc > 1:233141/1‑300 (MQ=255) aaaaaTAGTGATTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCtttt < 1:555398/300‑1 (MQ=255) aaTAGTGAGTTCTTTTCAGTTAATTCCTTGCGTAATCACTTCAGACTGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAAt < 1:427103/301‑1 (MQ=255) gagagTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCC‑AGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCAAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCtt > 1:180605/1‑300 (MQ=255) tttCCGGTTATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACGATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTGCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAAGTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCg < 1:143006/301‑1 (MQ=255) tttCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCg < 2:281563/301‑1 (MQ=255) gTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCC‑AGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCAGCCCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATAGGCAAAAATAACAATTTTAACGTTATAGACGACTTTTAATAACTAAACGAACGTCAAGcc > 2:221291/1‑301 (MQ=255) ggAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCCCATTTTTAACGTTATAGACTCCTTTTAATACCTGAAAGATCGTCAGGCAGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACggaaaca > 1:67466/1‑296 (MQ=255) atacGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCA‑CATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATg < 1:600173/301‑1 (MQ=255) cGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGATCGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGtt > 1:11476/1‑301 (MQ=255) agaAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTa > 2:280270/1‑301 (MQ=255) gCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAAt < 2:84362/301‑1 (MQ=255) tACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGTCAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCACCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTa < 2:340246/301‑1 (MQ=255) ccTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTACGGTTACGTTCGCCGCAATGGTAAAAgg > 1:509022/1‑301 (MQ=255) tCAGGATAGATGGTTGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGAt < 2:24569/301‑1 (MQ=255) ttAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTa < 2:509694/300‑1 (MQ=255) aatttaTAATTAATGTCGGCTTGTTGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCAc < 1:546775/296‑1 (MQ=255) aTAATTTATTTTGTCGTGATGTCTTTTTCATTGACAATCTTGCC‑AGCGTTGTTGGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCATCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTAACATTCGTTCATCAATGCTATCGGCAACAATAACAATTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTc < 1:221048/301‑1 (MQ=255) aTAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCAcagata > 2:547448/1‑296 (MQ=255) attaatGTCGGTGTTGTGCCTGTTTCAGTGAAAATCTCGCCGATCTGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAg < 1:46111/301‑1 (MQ=255) ttaatGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCACCAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCAACATAAACAAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCAGTTCCGGGTAAGTTAACCGCAATGGAAAAAGGATAAATCACTAACGAAAAATGATCGGCACCTACTTCAgg > 1:337845/1‑301 (MQ=255) taatGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTAAGGa > 1:293520/1‑301 (MQ=255) aatGTCGGCTTGATTCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCC‑AGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAAt < 2:180802/301‑1 (MQ=255) tgtcTTTATGTCTTTTTCATTGAAAATTTCGCCAAGCGTTTTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTc < 2:338308/298‑1 (MQ=255) cGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGAAATTTTc > 2:269780/1‑301 (MQ=255) tGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTAAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTCAGTAAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGAACATTACCGCATAATTATCGGACACTGCTTAAGGAATTTTCCACGCAtt > 1:588443/1‑301 (MQ=255) cTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACAAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCACATATTGAACGGCCACTGCTTCCAGAAATTTCCACGCAttttt > 1:114926/1‑301 (MQ=255) tttttCAGTGAAATTTTTGCCATGCGTTGTCTGGCTGTTATTATTCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCAtttttt < 1:279967/301‑1 (MQ=255) tctgTGAAAATTTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTTAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGAGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGGCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGGAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCg < 2:96193/298‑1 (MQ=255) gTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCCCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCCTCCCTGGGATCGGCCCCAATCACATTTTTAACTGTATAGACGCCTTTTCATCCCTGAACGCTCGTCAGGCCTCTTTTCCCTTCACCCTCCCCCCTCCCGGTCTCGTTTTCAGTCGGTTGCCCATCTCCGGTTCCTTTCTCAGCAAGTTTCCCCCCTGCGACCATTCCAGCATATTGATCAGACACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCGaaa > 1:96069/1‑301 (MQ=255) ttctcGCCAAGCGGTGTTTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGATCGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCGGAACCACgg < 2:11476/300‑1 (MQ=255) cGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTCATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGCACGGCCACTGCTTCAGGAAATTTCCACGCCTTTTTTTCCGGAACCACCGcctt > 1:458384/1‑298 (MQ=255) cGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTAAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCGGAACCACGGCata > 1:523583/1‑301 (MQ=255) | GCAACATGCTGGAAATCAAACGTATGGGTAATTAATTTTTCTGGTTTAATTAACCCTTTACTTAACCAGTCGATAACGATCGGGAATTTATTTGCATTTAAGCGTGAAGAGAAAATAGAGAGTTCTTTTCCGGTAATTCCTTGCTGAATCACTTCAGACGGTTCACTGGAGAACCCCATCAATACAATACGTGCCGCTGGAGAAGCCAGCGTTACGGCCTCTTTCAGGATAGAAGGATGACAAGCCGCATCGATAATTAATGTCGGCTTGATGCCTTTTTCAGTGAAAATCTCGCCAAGCGGTGTCTGGCTGTTATTAATCGCCCAGTCAGCCCCGCTCTCTTTCGCTTTTTCCAGTCGTTCATCAATGCGATCGGCAACAATCACATTTTTAACGTTATAGACGCCTTTTAATACCTGAACGATCGTCAGGCCGATTGGACCGGCACCATAAACCAGAACGGTATCATTTTCAGTCGGTTGACCATGTCCGGTTACGTTAGCCGCAATGGTAAAAGGTTCGATCATTACCGCATATTGATCGGCCACTGCTTCAGGAATTTTCCACGCATTTTTTGCCGGAACCACGGCATA > NC_000913/1652966‑1653558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |