Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,905,987 | G→A | 5.4% | G93R (GGG→AGG) | ygcG → | TPM domain protein, putative phosphatase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 2,905,987 | 0 | G→A | 5.4% | 2.1 0.0 ‑0.0 | 74 | G93R (GGG→AGG) | ygcG | TPM domain protein, putative phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (38/32): total (40/34) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.98e-01 |
GATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGGATCTTACGAGTAGCTTAAACTCACAAGAAAAGAAAGAACTGACGCACAAGTTAGAATCTATTTTCAATAATACCCAAGTGCAAATTGCCGTATTAATTGTTCCCACAACCAAAGACGAGACAATTGAACAATATGCTACAAGAGTTTTTGACAATTGGCGTTTAGGAGATGCCAAACGTAATGATGGGATACTGATCGTTGTTGCCTGGTCGGATCGCACTGTCCGCATCCAGGTAGGTTATGGGCTGGAAGAAAAGGTAACCGATGCTCTGGCTGGAGATATCATCCGTAGCAACATGATACCCGCATTTAAACAACAAAAATTAGCTAAGGGATTAGAGCTAGCTATAAACGCTTTGAATAACCAACTCACTTCACAACACCAATATCCGACTAATCCTTCAGAAAGTGAATCAGCGTCTTCCAGTGATCATTATTACTTTGCTATTTTTTGGGTATTTGCAGTGATGTTCTTCCCTTTCTG > NC_000913/2905691‑2906285 | gATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGGATCTTACGAGTAGCTTAAACTCACAAGAAAAGAAAGAACTGACGCACAAGTTAGAATCTATTTTCAATAATACCCAAGTGCAAATTGCCGTATTAATTGTTCCCACAACCAAAGCCGAGACAATTGAACAATATGCTACAAAAGTTTTTGACAATTGTCGTTTAGGAGATGCCAAACGTAATGATGGGAt > 2:227036/1‑301 (MQ=255) 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GATTTAATGAGAAATTTATAATGCGCTATTTCATACTAATGTTCACTTTCGTATGTTCCTTTGTTGCAGCCCAACCAACTATTGTCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGGATCTTACGAGTAGCTTAAACTCACAAGAAAAGAAAGAACTGACGCACAAGTTAGAATCTATTTTCAATAATACCCAAGTGCAAATTGCCGTATTAATTGTTCCCACAACCAAAGACGAGACAATTGAACAATATGCTACAAGAGTTTTTGACAATTGGCGTTTAGGAGATGCCAAACGTAATGATGGGATACTGATCGTTGTTGCCTGGTCGGATCGCACTGTCCGCATCCAGGTAGGTTATGGGCTGGAAGAAAAGGTAACCGATGCTCTGGCTGGAGATATCATCCGTAGCAACATGATACCCGCATTTAAACAACAAAAATTAGCTAAGGGATTAGAGCTAGCTATAAACGCTTTGAATAACCAACTCACTTCACAACACCAATATCCGACTAATCCTTCAGAAAGTGAATCAGCGTCTTCCAGTGATCATTATTACTTTGCTATTTTTTGGGTATTTGCAGTGATGTTCTTCCCTTTCTG > NC_000913/2905691‑2906285 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |