| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3154353 | 121 (1.100) | 3 (0.030) | 3/526 | NT | 2.5% | coding (866/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| ? | NC_000913 | = 3154366 | 121 (1.140) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
AGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGCCGCCGCAAGGTCCGGTCAGCACGTAGTACAGAATTT > NC_000913/3154070‑3154665 | aGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTACTGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTATACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGTGCTTTCATAGCCGAagct > 2:81446/1‑299 (MQ=255) gTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTACCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTCATTCCCCTGCATCGCCCGCCTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTCCGATTCCCTTTCATAGCCGCCccgc > 1:466373/1‑300 (MQ=255) ccTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTCAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTgcg > 1:488771/1‑300 (MQ=255) gTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGc > 2:191383/1‑299 (MQ=255) acgttcgttaAACGCCATGAAGGTCAGGTAATGTCGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacg > 2:670332‑M2/2‑270 (MQ=255) cgttAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTCAACCCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACCCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATTCCGttctt > 1:61135/1‑297 (MQ=255) ttAAGCGCAATTAAGATACGGTACGTACGTTCTC‑GATTATACTGCCAACTGCCTCGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCTCGCTGTTTTTGGTGATTAAAATAAAATACTGTAGCGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCACCGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCGTGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCAGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGga < 1:927670/301‑1 (MQ=255) 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AGTTTTGGCTATGCCTTAAGTATGATTCCGTTCGTTAAACGCCATGAAGATCAGGTAATGACGTTCCT‑GATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGACGATTTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAACGCCGATACGCTCATGTTGGCTTCTGCCGCCAGTTGCTCGACGCTCAGGTTTTCGGTGTATTTATTCTCAATCCGTTTCAGCACGCGGCTAATCAGACTGAAGTGAGTCTGGCGACTGACCAGCGCCAGTAACGCGCCGCCGCAAGGTCCGGTCAGCACGTAGTACAGAATTT > NC_000913/3154070‑3154665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |