New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 373026 = | 123 (0.710) | 3 (0.020) | 3/588 | 24.6 | 2.6% | coding (106/951 nt) | mhpF | acetaldehyde‑CoA dehydrogenase II, NAD‑binding |
? | NC_000913 | 373118 = | 105 (0.620) | coding (198/951 nt) | mhpF | acetaldehyde‑CoA dehydrogenase II, NAD‑binding | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGCCGGACCTGGC > NC_000913/372824‑373418 | tggCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCAACCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAAttt > 1:1721066/1‑301 (MQ=255) cGGTGAATGCGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGc < 1:1432205/300‑1 (MQ=255) ggCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCTCAAATGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGACGGCGGTGATGGTTGGCATTGATTCCCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACTCTTGATGGGGTGACCGGATTGATGAACATGTCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACAt > 1:353405/1‑301 (MQ=255) aTCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGACTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTa > 1:1403548/1‑301 (MQ=255) ttttGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTg < 1:876378/301‑1 (MQ=255) tGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATg < 1:518678/301‑1 (MQ=255) cccATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGAc > 1:595917/1‑300 (MQ=255) gAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCgg > 1:1043290/1‑301 (MQ=255) ggCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTg > 2:525996/1‑300 (MQ=255) acacgacgctctgccgatcggACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGGCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGc < 2:686051/281‑1 (MQ=255) 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cAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTAcg > 1:1054448/1‑300 (MQ=255) cgaggcacAAAAGGAAGTCTGTGGTGAGTAAGCGTAGAGACGACATTAGCGGTTCTGGCAAGATTGTTACCGGTCTTATGGTTAAAATTTTGCGTCACGGTGAGCAGCTGGAGATGGCGGGGATGGTTGGAGTTGCTCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACgcgaagc < 2:1411525/294‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACgcgaagc < 2:1053203/300‑1 (MQ=255) 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atgaACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTGGACGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTg < 2:1431174/301‑1 (MQ=255) aaCATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTGGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGcc < 1:1365244/300‑1 (MQ=255) aCATGCCTGAATTTGCTGAG‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGGGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCGTACTGCGGGCCGGTGGGTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGCCgg < 2:1738599/301‑1 (MQ=255) tGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGCCGGAcc < 1:1704797/301‑1 (MQ=255) cTGACTTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTTAAAAACGATGCCGCTTTCCGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTACTTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACCGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGCCTCACGTCGATCAACTGACCGTCACCATCGTCCCCTCCGTCGGCCAGTCCACCATCCCACTGGTTGCCGCCGTCTCACCCCTCTCCCGCGCCCATTACCCCGACATTCACTCTTCTATACCCAGCAAATCTGcccacccac > 2:958495/1‑293 (MQ=255) tGAATTTGC‑GATGAGCGACATTGTATTTCATGCGACCAACGCCGTTGCTCATGTTAAAATCGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTTACCTGCCGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGACGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGCCGGACCTGGc < 1:1713599/301‑1 (MQ=255) | TGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTTGAAGCCCATATTGAAGGCATAGGTTCAGTTGCTGCGACATTTTCAAGCGCAGCCCCAAAAGGAAGTCTGTCATGAGTAAGCGTAAAGTCGCCATTATCGGTTCTGGCAACATTGGTACCGATCTGATGATTAAAATTTTGCGTCACGGTCAGCATCTGGAGATGGCGGTGATGGTTGGCATTGATCCTCAGTCCGACGGTCTGGCGCGCGCCAGACGTATGGGCGTCGCCACCACCCATGAAGGGGTGATCGGACTGATGAACATGCCTGAATTTGCTGAT‑ATCGACATTGTATTTGATGCGACCAGCGCCGGTGCTCATGTGAAAAACGATGCCGCTTTACGCGAAGCGAAACCGGATATTCGCTTAATTGACCTGACGCCTGCTGCCATCGGCCCTTACTGCGTGCCGGTGGTTAACCTCGAGGCGAACGTCGATCAACTGAACGTCAACATGGTCACCTGCGGCGGCCAGGCCACCATTCCAATGGTGGCGGCAGTTTCACGCGTGGCGCGTGTTCATTACGCCGAAATTATCGCTTCTATCGCCAGTAAATCTGCCGGACCTGGC > NC_000913/372824‑373418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |