New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 149687 | 140 (1.040) | 5 (0.040) | 5/572 | 19.4 | 3.5% | intergenic (‑86/+28) | panB/yadC | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
? | NC_000913 | = 149698 | 141 (1.100) | intergenic (‑97/+17) | panB/yadC | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase/putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GATATCGGCAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATT > NC_000913/149407‑149996 | aaaagcgggcaCGGGAACTGGCAGGGTGTAGTCGTGCCCCGGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTCATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGtgctgc < 1:730678/291‑1 (MQ=255) atatCGGCAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGtgctgc < 2:1116631/300‑1 (MQ=255) tatCGGCAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTa > 2:690658/1‑301 (MQ=255) tCGGAAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCGGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGAATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGGGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACg < 1:689877/301‑1 (MQ=255) cGGCAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCGGAAGGTGACAGTGCTGCTActt > 1:308361/1‑299 (MQ=255) aCGGTAAGCGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGACATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCa < 1:229366/301‑1 (MQ=255) cGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAg < 2:159867/301‑1 (MQ=255) tAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAACCGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTTACAGTGCTGCTCCGTTATCAgggg > 1:1095949/1‑300 (MQ=255) cTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCCTTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGACGGTGACAGTGCTTCAACGTTATCAGGGAtgg > 1:279284/1‑299 (MQ=255) cTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAg > 2:1096661/1‑301 (MQ=255) cTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGAACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAg > 2:195555/1‑301 (MQ=255) gAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGCGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGAATTTTATCAGTCACATTGGTGGGTGCAATGATTTATCCGTAGCAGAACTTCCGGAAGGTGACAGTGCGGCTACGTTATCAGGGTTAGGTTACTTGGaa > 1:336313/1‑301 (MQ=255) gTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGGAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGaacg > 1:583242/1‑299 (MQ=255) tGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTa > 2:128463/1‑299 (MQ=255) gCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGtcatg > 1:899567/1‑297 (MQ=255) cccTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACtggt > 2:879107/1‑301 (MQ=255) ccTGAACCGGCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACtggtg < 1:385824/301‑1 (MQ=255) cTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACtggtgg < 2:900603/301‑1 (MQ=255) tGAACCGTCATGCCCAGCAAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGc < 1:195326/301‑1 (MQ=255) aCCGGCATGACCAGCGAATCGCCCACCAGAATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCttt < 1:1192996/301‑1 (MQ=255) cgctcttccgatctaTGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCg < 1:294785/287‑1 (MQ=255) tCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATCGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAATTTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGAt < 2:426041/301‑1 (MQ=255) aaattgCATGACGGTAAGCCCTTATTCAGAAAAGATTTTGGCGAAGCTTTAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTTCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCaa < 1:806881/296‑1 (MQ=255) accaGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGCTAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAGGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAATGTACTGGTGGCTTGAACTTCGCCGGGTTCGATCGCaaa > 1:1021/1‑300 (MQ=255) gCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGTAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGTTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTTTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCaaagat > 2:807790/1‑296 (MQ=255) 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gCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCttt > 1:742630/1‑301 (MQ=255) ccTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTaa > 2:434984/1‑301 (MQ=255) ttCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATg > 2:927557/1‑301 (MQ=255) aGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTGGCTTTAATGTTGc > 1:844951/1‑299 (MQ=255) gCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGc > 2:351836/1‑298 (MQ=255) gCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCta > 2:558437/1‑300 (MQ=255) 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tGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGTATAGGTTACCTGGCAGGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGGTGGATATCTATATTCCCGTCTTGCTTTATTGTTGCCTGGAAATTAaga > 1:782224/1‑301 (MQ=255) tgaatagagtgggtGGTAGCGAACATTTTTTTTTCCTGTGTGTACGTCTGCAGGAATGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGcc < 1:845314/288‑1 (MQ=255) aTAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTATTGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGctag > 2:846301/1‑298 (MQ=255) 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aGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGt > 2:234457/1‑301 (MQ=255) gTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCATTGCTTCCCGTAAGCGTAt > 1:659312/1‑301 (MQ=255) gTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTa < 2:152029/300‑1 (MQ=255) | GATATCGGCAACGGTAACTGGCAGGGTGGAGTCGTGCCCCTGAACCGTCATGCCCAGCGAATCGCCCACCAGCATGACGTTAAGCCCTTCATCAGCAAAGAGTTTGGCGAAGCTATAGTCATAAGCGGTGATGGTCGCGAAACGTTTTTTTTCCTGTTTGTACTTCTGCAGTAAGGAGATGGTGGTCGGTTTCATAACGTATCCTGATAAATTGATGTTGTGCTGTCTGGCATTTTATCAGTCACATTGGTGGGGGCAATGATTTATCCGTAGCAGCACTGCCAGAAGGTGACAGTGCTGCTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATT > NC_000913/149407‑149996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |