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tACGAATTTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCg > 2:502483/1‑300 (MQ=255) cGAAATTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCATGAAAATAATAAAAATACAATACAAATAAGTTCAATCAAGTGAAAATGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGAAGCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCGTTACCGGCCATGAAGAGGCCATCCACGGGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCg < 1:481780/301‑1 (MQ=255) aaTTTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTg < 2:347675/301‑1 (MQ=255) tttAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGan < 2:686396/301‑2 (MQ=255) aTTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCAACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTg < 2:421452/301‑1 (MQ=255) tataCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGc < 1:544279/301‑1 (MQ=255) | CAGTTTTTCATCAAAACTGGTTAACTGAAAAATATCGTAATTGACCCGCTCTTCTTTGACGTAAGTCCCGCTGCCCTGAATGCTTTCGAGGATCTGCTGCTCGACTAGCTGGCGCAAAGCCTGACGCACCGTAACCCGGCTGACGCCAAACTCTGTTTGTAGCGCTGATTCAGTGGGTAACGCATCGCCAGGTTTAAGCTCGCCACGCGCAATTTGTTCACGAATGCGATCGGCAATCTGCCGGTATAAGGGCTTGTGTCCCATTTTTAGTATCTCATTAATACGAATTTAACCATTATGCCCGATAAATTCATCCTGTAAATAATACAAATACAATACAAATAATTTCAATCAAGTGAAATTGATCACATAATGGTATTGTTTTATCGGGCACACTGGCGCGACTATAAAAACGATCAAGTGAGGATCATGATGAATCTGACGACTCTGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGC > NC_000913/765612‑766208 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |