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aTTCAAGGGTGAAGAACATGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCggg < 1:574859/301‑1 (MQ=255) aTTCAAGGGTGAAGAACATGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCgg < 2:403597/300‑1 (MQ=255) cAAGGGTGAAGAACATGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCGTCTATCGCTATGCCATCCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGCGGATTTACCTCAACCTCTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTCACAGTATCCAGACGCATTCTTTCCCGGTAGTCTGCTGCGGTTTCATACGGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGCTTTACATATACAGGCAGTAAACTGCTGGTGGCATTTGCCTGAATACCGTACTGCGAATTCAATGTATGAGAACAGTGTTCAACGAgtcaggcc > 1:872374/1‑293 (MQ=255) aagaaCATGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACt < 2:487745/301‑1 (MQ=255) aagaaCATGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACt < 2:20002/301‑1 (MQ=255) aTGTCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACTTCTCGc < 2:245987/301‑1 (MQ=255) tCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACTTCTCGCa > 2:807694/1‑299 (MQ=255) tCATAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACTTCTCGCACt < 2:1030168/301‑1 (MQ=255) aTAACCG‑A‑GT‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGATGCAGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTTCATGTATGAGAAGCGAGCTAAACGAGCCGGGAACGGGCAACTTCTCGCACttg > 2:975884/1‑301 (MQ=255) | CCAGCCCATCACCATCGGGATCAGCAAATGCCTGCAAATACACGGTTGATATTTGCATATCTTTCACCCGCTGAATTAGCACATCAATATTGCGATCCATTTGCTGGAGGTTTTCGTCATAAACGTAATCAAGATCGATATGCATTATCCGTTGTGGTGATTTTTCCTGTACGGTAATAATTTGCTGGGCAAACTCTTTTAATGAGGGATTATTGGCGATTAATACCCGCGGAATGGAATCCAATTGCGACGCATTTGCCAAACCTGATTCAAGGGTGAAGAACATGTCATAACCG‑A‑G‑‑TTTTTT‑T‑AATTCCTCTATCGCTATGCCATTCGCTTCGCCATAAGGCCAAACAAAAACGTGTGGATTTACCTCAACCTTTGTACGCAGGTATTCCGTCATTTTTACAGCATCCAGACGAATTCTTTCCCGGTATTCTGCTGCGGTTTCATACCGTGCGTGGTCAGTAAAATATGCACGATTTACATATACAGGCAATAAGCTGCCGGTGGCATTAGCCTGAATACCGTAGTGAGAATTCCATGTATGAGAAGCGAGCTCAACGAGCCGGGAACGCGCAACTTCTCGCACTTG > NC_000913/1088765‑1089353 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |