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ACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCC < 1:718116/301‑1 CCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTatttcagtacaccgcgccg < 1:556828/301‑20 ttggcttgagcgatCACTGGAAGATTGTTAACCTCAGTGGTTGTGTCGATGGTCTCCAGTTGCTGTTTGTGGTCGCTACGGCGGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTGCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAAAAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCTGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGG < 2:498052/287‑1 TTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGA < 1:471882/301‑1 TACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAA < 2:122889/301‑1 caCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGGGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTGGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAG < 2:353862/299‑1 CCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGCATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGTGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGTGGTACTTAAATCCCGCGCCCCTGGGTACTGAcg > 2:875938/1‑298 CACTTGCAGGTTGTAAATTTAAATGGTCATGTCGATGGGCGCAAGTAGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTATCGTTGGAGAGAATGGTCGGGATATCACGTGACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGAC < 2:764459/300‑1 CACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACA > 1:1139682/1‑301 GCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCACTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2911173‑2911479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccagcacTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACA > NC_000913/2911492‑2911789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |