| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,440,253 | A→C | D259E (GAT→GAG) | rpoA ← | RNA polymerase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,440,253 | 0 | A | C | 99.1% | 357.2 / NA | 106 | D259E (GAT→GAG) | rpoA | RNA polymerase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base C (47/57); minor base T (1/0); total (49/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGATTGGGCGCT > NC_000913/3439962‑3440536 | ttGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGAATGACCTTATCCGTCTCAGGAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACa < 1:1044223/301‑1 (MQ=255) cGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAggg > 2:953653/1‑301 (MQ=255) cGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAggg > 1:1118897/1‑301 (MQ=255) aGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCGGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCgcagg > 2:931560/1‑300 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGTCAGTTAGCAGATCGGACAGTCAATTCAAGCTCGTCAACAGGTGgcagc > 1:596703/1‑300 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCgcagca > 1:168952/1‑301 (MQ=255) gTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCgcagca > 1:338542/1‑301 (MQ=255) ttGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGcagcag < 2:86287/301‑1 (MQ=255) gacgacCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAggg > 1:839201/1‑300 (MQ=255) cacCACACTTACGAAGGCGCATGCCCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAGCCTGTGATCCGGTTACACGTCAGCGATGCTTGCCGGTAGCTAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATATTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAggatcg < 2:302869/300‑1 (MQ=255) ccACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAggatcgga > 1:183210/1‑301 (MQ=255) ctctTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTAAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGCGCGGACAGTCCATTCCAGCTCTTCACCAGTGCGCAGCTcgatcggatgg > 1:892070/1‑299 (MQ=255) atgtctcATGACCTTATCCTTCTCAGTAATACCTTAACCTGTGATCCGGTTACGCGTCAGCGATGCTTGCCTGTGGCCAGTTTTCCAGTCTCATGCCCGGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTg < 1:930404/294‑1 (MQ=255) cATGACCTTATCCTGCGCAGAAAAACCTTAAAGTGTGATCCGGTTAATAGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTATTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGACAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTtct < 1:413495/300‑1 (MQ=255) aTGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTctct < 2:513771/301‑1 (MQ=255) gacgtgatgcgtcgcaggacatgcgtAACCTGTGGTGCGGTGAAGTGGCAGAGATGTTCGCCGGTGGACCGTGTTCTAGGCGCATGCGCAGAGACAGTCCACGGCTAGCGAGCACGTCTTTAATCTCAGGAAGATATTGTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCTGTACGCTGTATTAGATCACCGATATAGTGGAGAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGAGCGAACTCTGGTTtctc < 1:519185/273‑1 (MQ=255) ccTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTcttctt < 2:597317/301‑1 (MQ=255) cttccgatctaGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCa < 2:667777/291‑1 (MQ=255) aGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCaagatcggaag > 1:667043/1‑291 (MQ=255) aGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAgg > 2:644076/1‑298 (MQ=255) aCCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTa > 1:518391/1‑300 (MQ=255) ccTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACa < 2:512793/301‑1 (MQ=255) cTGTGATCCCGTGACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGAGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTa < 1:800417/301‑1 (MQ=255) tgtgATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGTCCAGTTTTCCAGGCGCATGTCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCCCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGACTGCCGTACATCACGTaa > 2:633889/1‑301 (MQ=255) gATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCTACACGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTCCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGCCGCACATCACGTAAGt > 2:482626/1‑300 (MQ=255) ggTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGa > 2:415962/1‑301 (MQ=255) ttACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGaaa < 2:183430/301‑1 (MQ=255) cTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATTTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCCGGATCGGATCGAACTCTGGGTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACCTTCACCACTTAAGTCAACGaaat > 1:5575/1‑298 (MQ=255) cGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGTAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCtt > 2:1097465/1‑300 (MQ=255) tCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTcc < 2:518952/300‑1 (MQ=255) gCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGAAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTACAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTAAACGAAAGCTTACAgtt > 2:1039699/1‑301 (MQ=255) cGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAgt < 2:141017/299‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAg < 2:169141/301‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGc < 1:415519/301‑1 (MQ=255) tGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGcc < 2:405130/301‑1 (MQ=255) tGCCGGGGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGcc < 2:795647/301‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGTTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTAACTTCAGGCTGACGTCCATCACGTAAGTCAACGAACGCTTCAAGTTGTTCAGCCAgca > 1:860161/1‑299 (MQ=255) ccAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGtt > 2:37170/1‑301 (MQ=255) cAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTg > 2:572611/1‑301 (MQ=255) ttttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGGCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGcc < 1:712400/300‑1 (MQ=255) ttttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTGCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGcc < 2:726877/300‑1 (MQ=255) tttgCCAGGCGCAAGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTGTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTg < 1:692431/298‑1 (MQ=255) tttCCAGGCGCTGGCCCAGAGAAGGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAAGCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGCGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGc < 1:746760/301‑1 (MQ=255) tttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCGACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCCGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCg > 1:798100/1‑300 (MQ=255) tttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGc < 2:1085240/301‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCa > 2:87289/1‑301 (MQ=255) gagttcagacgtgtgctcttccgatcttCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCctct < 2:60705/273‑1 (MQ=255) aaGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGa < 2:716675/300‑1 (MQ=255) ccgatctggAAGCCAGCACGTCGTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATc < 1:140863/294‑1 (MQ=255) tCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCg < 2:338917/301‑1 (MQ=255) aCGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCGACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGAtt < 2:799028/301‑1 (MQ=255) ggAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATcagatcgg > 2:141002/1‑294 (MQ=255) ccAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCg < 2:86585/299‑1 (MQ=255) gCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGt > 2:462061/1‑301 (MQ=255) ttcagacgtgtgctcttccgatctttttttACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTgg < 2:293164/275‑1 (MQ=255) gtatttcacaccAGTAAGTGATTTTTTACCAAGTTTAGGCGTTTTAAGGAGATCAACTGCAGAACTCTGAACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGATTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGCATCGGATCGAAATCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGttt < 1:916290/288‑1 (MQ=255) tCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCa < 2:1120279/301‑1 (MQ=255) tCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTAGCCGCACGACGAATCGCcgctagatcggaagagctccgtgtagggaatg > 1:60629/1‑273 (MQ=255) tAATCTCAGTAATGAATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTGTTAAGAAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATAACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTc < 1:571997/301‑1 (MQ=255) tAAGCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGGTTTAAGGAGCGCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTc < 1:732819/301‑1 (MQ=255) aaTCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTc > 1:109689/1‑300 (MQ=255) cacAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTGAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGGACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCGCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATg < 1:952465/299‑1 (MQ=255) agaTTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCt < 2:840217/299‑1 (MQ=255) aTTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTg < 2:861179/299‑1 (MQ=255) ttttttACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTggagatcggaatagcgtcgtgtagggaa > 1:292840/1‑275 (MQ=255) tttttACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGTTATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGTAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCa < 1:1096121/301‑1 (MQ=255) tAGGCGTTTTAAGAAGCTCAACCTCGGTACGCGGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTg < 1:489242/301‑1 (MQ=255) aGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACg > 2:887494/1‑297 (MQ=255) gCGTGTTAAGGAGCTCAACCTCGGGACGCGTCACCAGGTCACCTGTAGAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTATCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGTATCGAACGCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGt < 2:211789/299‑1 (MQ=255) ccgatctggAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTa < 1:80283/294‑1 (MQ=255) tAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACAcg < 2:508047/301‑1 (MQ=255) ggAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTaagatcgg > 2:80359/1‑294 (MQ=255) gCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATATTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGCTCGACCTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTCGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCATCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGCTCTCCAGTCgctg > 1:258218/1‑300 (MQ=255) gCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGTTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGCTCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTAGGTACGGTGttacacaagct > 1:685351/1‑288 (MQ=255) aaaacTCGGTACGCTGTAACAGATCATCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAATTAGGAGAGCGGACAGTCAATACCACCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTTTGGTTTAGCGTCTGTCACTTCAAGCTGAAGTACATCACGTAAGTCAACGAAAACTTCCAGTTGTGCAGCCAGCATAGTTGCCGCACGACGAAGCGCCCCTTCAGGATCGATTGTGCTGTTGTTTTCCAGTTCGATGAGCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTc < 1:633199/297‑1 (MQ=255) tACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTa < 1:643386/301‑1 (MQ=255) cGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCATCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACCCGCGCTGCTTCAACCTTGTAgg > 2:244436/1‑301 (MQ=255) ctgtacaatatagacgcgagaGTGGATATCTGCTGCCTTAACGCGATTATCAGGGCGGAACGTCAAGTCCAGCTCGTCGACAGGGCGCAGCAGGCTCGCATCGAACTCTGGTATCTCTTCTTTCACTTCCGGCTGACGTCAATCTCGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCATAATGGTTGCCGCACTACGAATCGCCTCTTCAGTATCGATTGCGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGATCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGc < 1:482093/280‑1 (MQ=255) aCCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATa > 2:265367/1‑300 (MQ=255) tgctcttccGATCTAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGc < 2:312453/294‑1 (MQ=255) cACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCcac < 2:5575/301‑1 (MQ=255) aaacGATATAGTGATAAGCGTCTGCCTTCACGAAGTTAGAAGGGCTGACAGTCAAGTCCAGCTCGTAAACATGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACGCTGTTTTCTCCGTTTTTACTTCCGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCTCACGACTAATCGCCTCCTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTGCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCcac < 1:1115002/298‑1 (MQ=255) aGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCCCTGCTTCAACATTGTAGGCAATCCGcagatcggaagagcg > 1:312102/1‑287 (MQ=255) tGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAg < 1:265076/300‑1 (MQ=255) ggATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACCCGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGc > 2:517578/1‑300 (MQ=255) aTAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATg < 2:109793/301‑1 (MQ=255) gcgtCTGCTTTCAGGCAGTGAGCAGAGCGGAAAGTCAATGCCAGCGCGTGAAAAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCGTGTTTCTCTTCTTTCCCTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCg < 1:245212/297‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATCCGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGt > 1:189359/1‑301 (MQ=255) gCTTCTGC‑TTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAACAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTTACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTTAACGAAAGCTTCCAATTGGTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGGCTCTTCCGGTTAGGTTTGTCCGTTTGTTTCCATTTTGGAGACCAGCTTGTCCCGGTCGGTAAGCCGGTCTACACGCGTTTCTTCAAAATTGTAGGCAATACTCTTCACCGGGCTTTAGCaggtgt > 1:803022/1‑295 (MQ=255) cgtCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTc < 1:517017/299‑1 (MQ=255) cTTCTGCTTTAAGGCAGTGAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTc < 2:893133/301‑1 (MQ=255) ttAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATAGAACTCTGGTTACTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTGCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAAACGCCTCTTCAGGACTGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCATGTCAAGGTCGATACGCGGTTCTACACACGCCGCTTTCATATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGGTGTAGCATGAGTCGGCcagca > 2:636727/1‑301 (MQ=255) tAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGCCcag > 1:279829/1‑298 (MQ=255) cgatctgCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGc < 1:918655/295‑1 (MQ=255) gCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATTACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCCTCGACCAGCAGACGGCCGAttt > 1:827606/1‑300 (MQ=255) gCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCAGAtcg > 2:919762/1‑299 (MQ=255) gCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCCCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGAttt > 1:1080260/1‑300 (MQ=255) cAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGAtt < 1:886431/299‑1 (MQ=255) cAGAGCGGACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGATTg < 2:803950/300‑1 (MQ=255) ggACAGTCAATTCCAGCTCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGATTGGgcgcc > 2:267571/1‑299 (MQ=255) | TTGCGGTTCAGTTGACGACCACTCTTACGATGGCGCATGACCTTATCCTTCTCAGTAAAACCTTAACCTGTGATCCGGTTACTCGTCAGCGATGCTTGCCGGTGGCCAGTTTTCCAGGCGCATGCCCAGAGACAGTCCACGGGAAGCCAGCACGTCTTTAATCTCAGTAAGAGATTTTTTACCAAGGTTAGGCGTTTTAAGGAGCTCAACCTCGGTACGCTGTACCAGATCACCGATATAGTGGATAGCTTCTGCTTTAAGGCAGTTAGCAGAGCGGACAGTCAATTCCAGATCGTCAACAGGGCGCAGCAGGATCGGATCGAACTCTGGTTTCTCTTCTTTCACTTCAGGCTGACGTACATCACGTAAGTCAACGAAAGCTTCCAGTTGTTCAGCCAGAATGGTTGCCGCACGACGAATCGCCTCTTCAGGATCGATTGTGCCGTTGGTTTCCATTTCGATGACCAGCTTGTCCAGGTCGGTACGCTGTTCTACACGCGCTGCTTCAACATTGTAGGCAATACGCTCCACAGGGCTGTAGCATGCGTCGACCAGCAGACGGCCGATTGGGCGCT > NC_000913/3439962‑3440536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |