Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 240,031 | T→C | A53A (GCA→GCG) | yafV ← | putative NAD(P)‑binding C‑N hydrolase family amidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 240,031 | 0 | T | C | 98.4% | 647.1 / NA | 188 | A53A (GCA→GCG) | yafV | putative NAD(P)‑binding C‑N hydrolase family amidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (99/84); minor base A (3/0); total (102/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GCGACCACACAGGAAAACGTAAGTCGTAGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAACGATCACATCGCGCCCGGTAATACCTTCCAGTTGACGATCAAAATGACGCAGGTTGGCAGGACCATCCATCCACACCAGTGGTTGCTGCAAAAGCGTAATCTTCAAACCAGGCACGGTGTACAACTCCTTTATGCGAAGGGTTTTATAACTTTAACACCTTATCAGGCAGTTGCCTTAGCGCAGAATAAATTGATAACAAATGCTGATATTGGAAATATCTGATTTGCAAATTATCGTGTTATCGCCAGGCTT > NC_000913/239739‑240327 | cggACCACACAGGAAAACGTAAATCGTAGCACTCCAGCGACAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCCCGCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCCGCCGCTTc < 2:827545/299‑1 (MQ=255) 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gCTAGCGACGAAGCAGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAACGATCACATCGCGCCCGGTAATACCTTCCAGTTGACGATCAAAATGACGCAGGTTGGCAGGACCATCTATCCACACCAGTGGTTGCTGCAAAAGCGTAATCTTCAAACCAGGCACGGGTTACAACTCCTTTATGCGAAGGGTTTTATAACTTTAACACCGTATCAGGCTGTTGCCTTAGCGCAGACTCAATTGATCACAAATGCTGATATTGTACATATCTGATTTGCAATTTCTGTTGTTAt > 1:451352/1‑301 (MQ=255) cTAGCGACGAAGCCGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAACGATCACATCGCGCCCGGTAATACCTTCCAGTTGACGATCAAAATGACGCAGGTTGGCAGGACCATCCATCCACACCAGTGGTTGCTGCAAAAGCGTAATCTTCAAACCAGGCACGGTGTACAACTCCTTTATGCGAAGGGTTTTATAACTTTAACACCTTATCAGGCAGTTGCCTTAGCGCAGAATAAATTGATAACAAATGCTGATATTGGAAATATCTGATTTGCAAATTATCGTGTTATc < 2:1463885/301‑1 (MQ=255) acgaAGCCGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAACGATAACATCGCGCCCGGTAATACCTTCCAGTTGACGATCAAAATGACGCAGGTTGGCAGGACCATCCATCCACACCAGTGGTTGCTGCAAAAGCGTAATCTTCAAACCAGGCACGGTGTACAACTCCTTTATGCGAAGGGTTTTATAACTTTAACACCTTATCAGGCAGTTGCCTTAGCGCAGAATAAATTGATAACAAATGCTGATATTGGAAATATCTGATTTGCAAATTATCGTGTTATCGCCAg < 1:283314/300‑1 (MQ=255) | GCGACCACACAGGAAAACGTAAGTCGTAGCACACCAGCGGCAAAATACGCCAGCCGCGCCATTCCACAATCACTCGCGCATTGCCCGCTTTATAATGTAGATGCTCATCTGCCATGCGGAACAGATGACGCTTATCATAAAAATGTACCGTGCCGCCCGGCTCAACCAGCAAAAAGCGGTTAACCGAACCAGACTCCGTTTGTAATGCAACACTGCCTGCAATCAGCGCATTGCACTGCTGCGCCTTAGCTGTCATCCAGTTCACTACGTCATCTTGTGCTAGCGACGAAGCTGCCGCTTCCATGGCAAAGCCGCTGGTAAACATCTCCGGTAGAACGATCACATCGCGCCCGGTAATACCTTCCAGTTGACGATCAAAATGACGCAGGTTGGCAGGACCATCCATCCACACCAGTGGTTGCTGCAAAAGCGTAATCTTCAAACCAGGCACGGTGTACAACTCCTTTATGCGAAGGGTTTTATAACTTTAACACCTTATCAGGCAGTTGCCTTAGCGCAGAATAAATTGATAACAAATGCTGATATTGGAAATATCTGATTTGCAAATTATCGTGTTATCGCCAGGCTT > NC_000913/239739‑240327 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |