| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2819836 = | 141 (0.850) | 5 (0.030) | 5/578 | 22.2 | 3.5% | coding (2176/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase |
| ? | NC_000913 | 2819907 = | 137 (0.850) | coding (2105/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CACGATCTGTGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGG > NC_000913/2819536‑2820129 | tCTGTGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTAt > 2:1467084/1‑301 (MQ=255) tcttccgatctcGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTc < 1:260825/290‑1 (MQ=255) tCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTc < 2:1153504/300‑1 (MQ=255) ccTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTcag < 2:1288005/301‑1 (MQ=255) ccTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCCACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGcgcg < 1:919619/300‑1 (MQ=255) ccTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACTGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGcgcg > 1:1180201/1‑300 (MQ=255) ccTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGcgcg < 2:972330/300‑1 (MQ=255) ccTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGa > 2:1177556/1‑301 (MQ=255) cAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTc < 2:1354100/301‑1 (MQ=255) agaAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGATGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTAAGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTa < 1:1203612/299‑1 (MQ=255) aaaCCTTACCTTCGGCTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAg < 1:1150702/299‑1 (MQ=255) aaaCCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATGTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGATCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCg < 2:229664/301‑1 (MQ=255) ccttCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCATTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTTCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTACGCGATcc > 1:1046379/1‑296 (MQ=255) 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tACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTcgcc < 2:1222706/301‑1 (MQ=255) tACTGAGCGAACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGACGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACctttcgctttcg < 2:467474/299‑1 (MQ=255) ttATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCTATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCATTACCAGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGTGCAAGCACCTATGCTCAGCACGCGTCGGCGCACATCATACTTCTTTACCTACAGCGCCAGCGCACCTTACGCTCTCGCCGCTTCGAGATcc > 2:382863/1‑300 (MQ=255) cAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCatgat > 2:107058/1‑301 (MQ=255) aGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATCCTTCTCGCCGAACCGCGCCCACGCAGCTATCGGTTTCGGCGCTGCGATATACatgatg > 1:205129/1‑301 (MQ=255) gCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGCCGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGCTGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACCACTCGGTAGATAAATCGCCTATGCTCCGCACGTGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCGTCGCCCCTTTCGCTTTCGCCCCTTCgagtaccagtatgt > 1:1135285/1‑290 (MQ=255) | CACGATCTGTGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTCTCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGCGTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGG > NC_000913/2819536‑2820129 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |