| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 791,937 | 0 | A | G | 71.5% | 282.1 / 132.8 | 192 | V40A (GTA→GCA) | galE | UDP‑galactose‑4‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/34); new base G (52/83); total (75/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GCTTTCAACGTATGGAATTTTGGGCTGATCGCCATAAACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGA > NC_000913/791639‑792234 | gCTTTCAACGTATGGAATTTTGGGCTGATCGCCATAAACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAAAGCTTCGTTACGAATATCTCCCTCCACAACACTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCTATAACAGTCAGTGCg > 1:155849/1‑301 (MQ=255) 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tACGCTGCGCTTACTGTTACATAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGAACGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGTGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGa < 2:339821/299‑1 (MQ=255) | GCTTTCAACGTATGGAATTTTGGGCTGATCGCCATAAACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTAGGCTTATGGTATGAAATAACCATAGCATAACAAAGATGCGAAAAGTGTGACATGGAATAAATTAGTGGAATCGTTTACACAAGAATTTAGCCGTTTTTTATGCGCGATTAAGTGATTATAAAACAGAGGGTTTATGAATGATTGCGCTTTTTATCTGAAAAAAGA > NC_000913/791639‑792234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |