| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,296,380 | 2 | . | G | 94.4% | 379.0 / 13.6 | 143 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate:proton symporter/Sel1 family TPR‑like repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/3); new base G (71/61); total (76/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCG‑‑CAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑A‑‑C‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAATGCCCACGCCGTTGGCGT > NC_000913/4296132‑4296671 | ttGTAGGTGCGTTTAGGTGTTTGTGCTCCACACGACAACAACGCCGGGTGCGGGGGTTGCCGCGGCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGAAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCG‑‑CAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGc < 1:662286/301‑1 (MQ=11) catgATCAGGGGTGTATGCCGCATCCGACAGGAACGCCTGCTGCGAGTCGTGCCGCGTCGTATCACGCCTACGCCAGAAAGCGCAATAGCGTGATTTAGCGTGAATTTGTAGGGCGGATAAGGCGTTTACGCCGCACCCGACATCAACGCCTGAGGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGCCCTACGCCAGACAGCG‑‑CAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCt < 2:494177/297‑1 (MQ=11) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACATCAACACCTGCTGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCCATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGTATAAGGCGTTTATGCCGCAGCCGACATCACCGCCTGATTCGACGCTTCACGCTTCTTATCAGGCCTACGCCAGCAATAT‑‑CAATCGCCTGCTTTAGCGTAATTTTGTAGGTCGGATCAGGCGTT‑TC‑AC‑C‑‑CGCA‑TCCGCCCCCCATA‑CCTGATGCTCCCCTTTCCGAGCCTTACCCTGCCTACCTTaca > 1:820625/1‑299 (MQ=11) aagagggctcgacgCCGCATGCCACCTCAATGTCTGACGCCACGCTCGCCGTGTATTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGTCATAGCCTGATTTAGTGTGATTTTGTAGGTCGTATAATGCGTTTATGCCGCCTCCGACATCCACGCCTGATGCGCCGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTAAGCCAGACAGCG‑‑CAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAAcc < 2:713033/288‑1 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(MQ=255) tttGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCACACCCTTCCATCCAGCTCAGGTTCCACCAGTGCATCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATACAACCTTCTTCCCCGTTTCAGAACATCCTTCCCGCCCAGTCCTCGGACTCCCCGTTTCTGGAACTTTCCGCGCTTCTTTTTAACTACCATTTTGCCTTGTCCTCCTCTTCCTTactt > 1:906766/1‑298 (MQ=25) ttgggaGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAAGG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAATg < 2:475143/296‑1 (MQ=255) cGGATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCCGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAACACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGCATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTTAAATACCCGGTTTCCTTGTCATCGTCTGCCTTCATTCCCACGcc > 2:96472/1‑300 (MQ=39) gATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTACTTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTCAGAACATCCTTCCCGCCCATTCCTCGGATTAACCGGTTCGGGCCATTTCAGAGCTGCGTTTGCACTCCAAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAGTGCCCCCGCCGtt > 1:92649/1‑301 (MQ=255) gATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTCTCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCCACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTATCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTGAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAAGACCCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGATATACCCAGTTGCATTGTCATCCTCGGCCTTAATGCCCACGCCGtt > 2:250376/1‑301 (MQ=255) gATAAGGCGTT‑T‑‑ACGC‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGa < 1:656719/220‑1 (MQ=255) 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TTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCATCCGACATCAACGCCTGATGCGACGCTTAACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCG‑‑CAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTT‑T‑‑A‑‑C‑‑CGCA‑TCCGACATCAATG‑CCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGTGCAGCGCCTTTTGCTTGTTCTTCTCGATAAAACCTTCTTCACCGTTTAAGAACATCATTCCCGCCCAGTACTCGGAATAACCGGTTCGGGAAATTGCAGAGCTGCGTTTGAAATACCAGGTTGCCTTGTCATCGTCGGCCTTAATGCCCACGCCGTTGGCGT > NC_000913/4296132‑4296671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |