New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3032405 | 119 (1.050) | coding (1039/1449 nt) | uacT | uric acid permease |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTAACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATGGCTATCA > NC_000913/3032118‑3032703 | ttttGGATTCCTTTTCCAGTGGGACCATGACTGGCGTTGTAATCATCGTGTTTAGCGAGTAAATGGGGATGTTCCTGGGTCTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTTTCTTCGGACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCGTCCCCCAAACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGc < 2:109629/301‑1 (MQ=255) 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ttGT‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGTGGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTAACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATgg < 1:15732/301‑1 (MQ=255) gTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTAACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCACCCGCTGCTACCTAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGAGCCGTTTTACTGGACGTCTTCGTTCATGGCTTTct > 1:386973/1‑298 (MQ=255) | TTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTAACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATGGCTATCA > NC_000913/3032118‑3032703 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |