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tCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAg < 1:370282/59‑1 (MQ=255) tCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAg > 2:370272/1‑59 (MQ=255) gTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAg > 1:988769/1‑141 (MQ=255) gTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATGAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAg < 2:988732/141‑1 (MQ=255) tttCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTg > 2:290052/1‑54 (MQ=255) tttCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTg < 1:290058/54‑1 (MQ=255) tttCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAg < 1:377239/140‑1 (MQ=255) tttCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAAAGAATAAAGCAATAAAAg > 2:377229/1‑140 (MQ=255) | CTTATGCCAGAACGAAACCTTTTCATGAAAGGTATTCTGAGCTGGGTAGGAGGAAAGACAGATATTGTTGAATACGTGCGAGCGGAAAGAATTGCTGGAGATACAAAATTTAATGGATGGAAACTTTGGAATTTAGCACTTGAGGGTATTACAAGCTTTTCCACATTCCCTCTTCGCATCTGGACATACATAGGGTTAGTGGTAGCCAGTGTAGCATTTATTTATGGGGCGTGGATGATTTTAGATACTATCATATTTGGAAATGCTGTTAGGGGATATCCTTCACTACTTGTTTCAATACTGTTTTTAGGTGGAATTCAGATGATTGGAATAGGAGTATTAGGTGAATATATTGGACGCACATACATTGAAACCAAAAAACGCCCGAAATACATCATCAAGAGAGTCAAAAAATGAATAAAGCAATAAAAGTATCATTGTATATATCTTTTGTTTTGATTATTTGCGCCTTATCTAAAAACATAATGATGTTAAATACATCTGATTTCGGAAGAGCCATTAAGCCATTAATTGAAGACATACCAGCATTTACATATGAC > NC_000913/2468718‑2469277 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |