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aCATGCACTTTCGCCGAGTACCCTGAGCGTTGTGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAg < 2:601841/301‑1 (MQ=255) ccggAGCTTTGTGCTTCTTATGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGCATATCCAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCTCATCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATCCGCACATGGTGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGACGATTATGt < 2:344263/298‑1 (MQ=255) ccTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGt < 1:826214/301‑1 (MQ=255) tGACGAACCTGAAAAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAAGATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGGGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGAACATGTGGGCCTGGGCATGAATGGTTGCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTaa < 2:804045/301‑1 (MQ=255) cACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTc > 1:739562/1‑210 (MQ=255) cACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTc < 2:739542/210‑1 (MQ=255) atatCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTc < 2:55834/301‑1 (MQ=255) atCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 1:751428/301‑1 (MQ=255) ctgctgAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattt < 1:249943/212‑1 (MQ=255) ctgctgAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattt > 2:249937/1‑212 (MQ=255) | TTGTGTCAGGTTCCGACACTGGCATTGGAAAATGACGAGATTATGACGGAGACAGCGGCGATTGCATTGATGGTTCTCGATCGTCGCCCGGACCTTGCGCCACCGGTTGGGCGCGCCGAACGTCAGCTGTTTCAACGGCTATTGGTCTGGCTGGTTGCTAATGTCTATCCAACATTCACTTTCGCCGATTACCCTGAGCGTTGGGCTCCTGACGCACCTGAACAGTTAAAGAAGAATGTTATTGAATATCGAAAATCGCTTTATATCTGGTTGAATTCGCAGCTCACTGCTGAACCTTATGCGTTTGGTGAGCAACTAACGCTGGTGGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTT > NC_000913/1526394‑1526958 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |