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gAATGAGGACATCGGTGAGTATTATTGGCAAACAGAACTGGGTACATGTAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAat < 1:1063243/284‑1 (MQ=255) gAATGAGGACATCGGTGAGTATTATTGGCAAACAGAACTGGGTACATGTAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAat > 2:1063192/1‑284 (MQ=255) gAATGAGGACATCGGTGAGTATTATTGGCAAACAGAACTGGGTACATGTAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAAAGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTGTATAAGAGCGGGTATGTATAAAAAAAAGAGCAGTGATACAGTTCAGTGTTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAttatctgtatctaatacaa > 2:262884/1‑286 (MQ=255) ggTGAGTATTATTGGCCAAAAGAACTTGGTACATGTAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCACTCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAATATTTTAAAGATGAGAAACCAACTTATGCt < 2:16463/300‑1 (MQ=255) ttAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAATATTTTAAAGATGAGAAACCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAAATGAGTc < 1:408962/300‑1 (MQ=255) aaTTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGTGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCcagttc > 2:585323/1‑186 (MQ=255) aaTTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGTGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCcagttc < 1:585336/186‑1 (MQ=255) aaTTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAATATTTTAAAGATGAGAAACCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAAATGAGTCTTACGAATGttt > 1:1001340/1‑301 (MQ=255) | CAGCAGGGATAGATGATTTGGGTGAAATTTTAGCTAAGATGAAACAGAGAACATCGAGAGGAATAAGAAAATGAAAAGAGTTTTGTTCTTTTTGCTGATGATATTTGTTAGTTTTGGTGTTATAGCTGATTGCGAAATACAAGCTAAAGATCATGATTGTTTTACTATTTTCGCTAAGGGTACTATTTTTTCCGCGTTTCCTGTCTTAAATAATAAAGCCATGTGGAGATGGTATCAGAATGAGGACATCGGTGAGTATTATTGGCAAACAGAACTGGGTACATGTAAAAATAATAAATTCACACCAAGCGGGGCGAGACTCTTAATTCGCGTCGGGTCACTACGCCTTAATGAAAATCATGCCATCAAAGGAACGTTGCAGGAGTTGATAAATACAGCAGAAAAAACGGCGTTTCTCGGCGATCGGTTTAGAAGTTATATAAGAGCGGGTATCTATCAAAAAAAGAGCAGTGATCCAGTTCAGTTGTTGGCAGTCCTTGATAATTCAATCATGGTAAAATATTTTAAAGATGAGAAACCAACTTATGCTCGAATGACAGCACATCTCCCGAACAAAAATGAGTCTTACGAATGTTT > NC_000913/735580‑736176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |