| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 199,522 | 0 | T→A | 5.3% | 3.8 0.0 ‑0.0 | 75 | V532E (GTA→GAA) | bamA | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (32/38): total (34/41) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
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ACGGTACTGAAAGTGGCGTGAGCTTCCAGGCTGGTGTGCAGCAGGATAACTGGTTAGGTACAGGTTATGCTGTTGGTATCAACGGGACCAAAAACGATTACCAGACCTATGCTGAACTGTCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAGACGTGACGTTGGGCTTCCCGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGTACATAACTCCCTGTCCAACATGCAGCCTCAGGTTGCGATGTGGCGTTATCTGTACTCTATGGGTGAACATCCGAGCACCTCTGATCAGGATAACAGCTTCAAAACGGACGACTTCACGTTCAACTATGGTTGGACCTATAACAAGCTTGACCGTGGTTACTTCCCGACAGATGGTTCACGTGTCAACCTGACCGGTAAAGTGACCATTCCTGGATCGGATAACGAATACTACAAAGTGACGTTAGACACGGCGACTTATGTGCCGATCGATGACGATCACAAATGGGTTGTTCTGGGGC > NC_000913/199222‑199821 | acgggaaggaaatgggcggtggCTTCCAGGTTGTGGTGCAGCAGGAGAAATGTGTATGGCCAGGTTATGCGGTTCGTATCAACGGGACAAAAACAGATTACCAGACCTATGCTGAACTGGCGGTAACCAACCCGTACTTCACCGTAGATGGCGTAAGCCTCGGTGGTCGTCTCTTCTATAATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGAACTGTCCGACTAGACCAACAAGAGTTAGGGTACAGACGTGACGTTGGGCTTCCCGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGt < 2:620733/280‑1 (MQ=255) 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gTACAGACGTGACGTTGGGCTTCCCGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGTACATAACTCCCTGTCCAACATGCAGCCTCAGGTTGCGATGTGGCGTTATCTGTACTCTATGGGTGAACATCCGAGCACCTCTGATCAGGATAACAGCTTCAAAACGGACGACTTCACGTTCAACTATgg > 2:200513/1‑196 (MQ=255) gTACAGACGTGACGTTGGGCTTCCCGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGTACATAACTCCCTGTCCAACATGCAGCCTCAGGTTGCGATGTGGCGTTATCTGTACTCTATGGGTGAACATCCGAGCACCTCTGATCAGGATAACAGCTTCAAAACGGACGACTTCACGTTCAACTATgg < 1:200520/196‑1 (MQ=255) cccGATTAACGAATATAACTCGCTGCGTGCAGGTCTGGGTTATGTACATAACTCCCTGTCCAACATGCAGCCTCCGGTTGCGATGTGGCGTTATCTGTACTCTATGGGTGAACATCCGCGCACCTCTGAACAGGATAACCGCTGCAAAACGGACGACTTCACGTTCAACTATGGTTGGACCTATAACAAGATTGACCGTGGTTAATTCCCTACAGATGGTTCACGTGTCAACCTGACCGGTAACTTGACCCTTCGTGGCTCGGATAAGGTATAACACAAAGTAACGTTAGACCCGGccaat > 1:3006/1‑297 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |