| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,028,269 | G→C | 100% | P126A (CCA→GCA) | USA300HOU_1882 ← | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,028,269 | 0 | G | C | 100.0% | 256.0 / ‑6.5 | 75 | P126A (CCA→GCA) | USA300HOU_1882 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (32/40); minor base A (1/2); total (33/42) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TAACCTGCACTTTACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAA > CP000730/2028131‑2028404 | taACCTGCACTTTACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTAGTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAActgctg > 2:142165/1‑141 (MQ=255) ccTGCACTTTACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTAc > 1:843038/1‑141 (MQ=255) ccTGCACTTTACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTAc < 2:684725/141‑1 (MQ=255) ttttCCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTc < 2:779250/141‑1 (MQ=255) tttACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTc < 1:830749/141‑1 (MQ=255) tttACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTc < 2:589611/141‑1 (MQ=255) ttACCTCAACTGTGCCTAACAACAATGGTATTAATTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCa < 1:178916/141‑1 (MQ=255) aCCTAAAATGTGTCTAACAACAATTGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCAcc < 1:151086/141‑1 (MQ=255) ccTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCa < 1:823383/141‑1 (MQ=255) cTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCaa > 2:345312/1‑141 (MQ=255) cTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCaa > 2:38208/1‑141 (MQ=255) aaTGTGTCTAACAACCTTGTCGTTTTGGTCCGTAATATTGTCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCTCCAATTCCATGTCGGATTTGTGCGTCTTCCCACTTATGTACGTAAACGGCTGTACGTTGCTGACCAAACCa < 2:387592/141‑1 (MQ=255) aaTGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAACTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCa < 2:842927/141‑1 (MQ=255) gtCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTCCAGCTTTTGCTAAGTCAATACGTAGGTCGCCAATTCCACGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACtttt > 2:75359/1‑141 (MQ=255) tCTAACAACAATGGTAGTATTTTCCTTCATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTTTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTg < 2:13839/141‑1 (MQ=255) cTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGt < 2:202460/141‑1 (MQ=255) cTAACAACAATGGTATTATTTAACACAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACATTTGt > 2:613876/1‑141 (MQ=255) atcaaTGGTAGTATTTTCCGGAATACTTGCAGCTTTTGTTAATTCAATTTGTAGCTCGCCAATTCGACTTTGAATTTGTACATCTTCCGACTTATATACATAACCTTATGTACGCTGCTCACCAAACCACTTTTGTTtaat < 2:246748/139‑1 (MQ=255) aTGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATaaaa < 1:201810/141‑1 (MQ=255) ggTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGa > 1:142432/1‑141 (MQ=255) gTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGAt < 2:439838/141‑1 (MQ=255) gTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGAt < 1:152787/141‑1 (MQ=255) gTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTGTCGCACCAAACCACTTTTGTGTAATAAAAGAt < 2:820545/141‑1 (MQ=255) attattTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATgg > 1:74486/1‑141 (MQ=255) attattTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGATGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATgg > 2:202379/1‑141 (MQ=255) tattTTCCTGACTATCTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATGCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCTCTTTTGTTTAATAAAAGATGGTg < 2:234633/141‑1 (MQ=255) ttCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGt < 1:515842/141‑1 (MQ=255) ccTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCa > 2:600325/1‑141 (MQ=255) ttAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATa < 2:164618/141‑1 (MQ=255) atatTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAAcc > 1:523581/1‑141 (MQ=255) tatTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAAAATGCAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCt > 1:556922/1‑141 (MQ=255) cAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCg < 1:345312/141‑1 (MQ=255) ttGTTAAGTCAATATTTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCaa < 2:136359/141‑1 (MQ=255) ttGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCaa < 2:843038/141‑1 (MQ=255) tGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAac < 1:142165/141‑1 (MQ=255) gTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAact < 1:38208/141‑1 (MQ=255) ttAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAacta < 2:735596/141‑1 (MQ=255) ttAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCAATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTAAGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGGTAAGGCATAACCTGATTCGTCGCacaga > 1:81043/1‑137 (MQ=255) tAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAactac < 1:62605/141‑1 (MQ=255) attCAATGTGTAGGTGGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATATAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtt < 2:753217/139‑1 (MQ=255) aggcAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtt < 1:558652/138‑1 (MQ=255) aGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtt < 1:648372/141‑1 (MQ=255) aGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtt > 2:806914/1‑141 (MQ=255) gTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACttt > 2:505787/1‑141 (MQ=255) tCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtttt > 2:213645/1‑141 (MQ=255) tCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTAATCCGTCGCAACTACtttt > 1:395732/1‑141 (MQ=255) aaTATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACtttttt < 1:465144/141‑1 (MQ=255) tatGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTg > 1:528838/1‑141 (MQ=255) gTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGtt < 2:337728/141‑1 (MQ=255) aGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATCCATAAACTGCTGTAAGTTGCTCACCACACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACATAATCAGTCGAACCTACTTTTTTTGGTTTa > 2:421712/1‑141 (MQ=255) ggTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGTTTTaa > 2:584913/1‑141 (MQ=255) gTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTaaa > 1:698649/1‑141 (MQ=255) ccGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAAc < 2:649776/140‑1 (MQ=255) gCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTCTTTTTGGTTTAAACtt > 2:747846/1‑141 (MQ=255) gCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAAATACTTTTTTTGTTTTAAACtt > 2:680795/1‑141 (MQ=255) ccAATTCCATGTTAAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTATACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATACACTCATCGGTGGCAACTACTTGCTTTgagttcacatat > 2:706145/1‑130 (MQ=255) tttcattgtGATTTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGATGGACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTGAATTAAAGATTGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTGGTGTa < 2:15683/133‑1 (MQ=255) ttCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTa < 1:264931/141‑1 (MQ=255) ttCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTa < 1:343846/141‑1 (MQ=255) ttCCACGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTa < 1:317781/141‑1 (MQ=255) ccATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTAtt > 1:523424/1‑141 (MQ=255) cATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTa < 1:831986/141‑1 (MQ=255) tGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTaaa < 1:269003/141‑1 (MQ=255) tGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTaaa > 2:616035/1‑141 (MQ=255) gAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGGATTAAATAAc > 1:798755/1‑141 (MQ=255) aaTTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAATCCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACg < 1:710766/141‑1 (MQ=255) aTTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGc > 2:543117/1‑141 (MQ=255) gTACATCTTCCCACTTATATACATAGACTGATGTGCGTTGCTCACTAGACGTCTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGAGACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAAGGcacgt > 2:636031/1‑139 (MQ=255) tCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCTGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGt < 1:577106/141‑1 (MQ=255) tCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGt > 2:692544/1‑141 (MQ=255) tCTTCCCACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTAATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAATTAACGCACAATAAga > 2:34217/1‑140 (MQ=255) cTTCCCACTTATATAAATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGta < 1:864415/141‑1 (MQ=255) ccACTTATATACATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACACTAAGtaataa > 2:851821/1‑141 (MQ=255) atataCATAAACTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTGAAGCTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATaaaaa > 2:319742/1‑141 (MQ=255) aaaCTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACa < 1:505787/141‑1 (MQ=255) aaCTGCTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACaa > 1:806836/1‑141 (MQ=255) | TAACCTGCACTTTACCTAAAATGTGTCTAACAACAATGGTATTATTTTCCTTAATATTTGCAGCTTTTGTTAAGTCAATATGTAGGTCGCCAATTCCATGTTGAATTTGTACATCTTCCCACTTATATACATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAA > CP000730/2028131‑2028404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |