New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 748995 = | 82 (1.250) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 3.6% | coding (64/96 nt) | USA300HOU_0695 | hypothetical protein |
? | CP000730 | 749026 = | 80 (1.240) | coding (95/96 nt) | USA300HOU_0695 | hypothetical protein |
AACAACCAAAGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAATATGTT > CP000730/748856‑749134 | accgtaaccgcaatacccatacctagtagaaacatattagcaacaaagagtttataattctttatttgtaataacgctgcaaacatatccataaccccgcttcttagagccccttttaatttattaattaggggctcttat > 2:563311‑M1/140‑141 (MQ=255) aacCAAAGGCGTAGTTTTCGACCAATTGAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACa < 2:567755/141‑1 (MQ=255) acCAAAGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAg > 1:541176/1‑141 (MQ=255) ccAAAGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGt < 2:644443/141‑1 (MQ=255) cAAAGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGtt > 2:501271/1‑141 (MQ=255) aaGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTgg > 1:608409/1‑141 (MQ=255) aGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGa < 1:479173/141‑1 (MQ=255) aGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGa > 2:36919/1‑141 (MQ=255) cGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGc > 1:95050/1‑141 (MQ=255) cGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACAATTCGATTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAACGGAATACAGTTGGATGc > 2:161637/1‑141 (MQ=255) cGTAGTTTTAGACTAAGTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGc < 2:80752/141‑1 (MQ=255) acccatacctagtagaaacatattagcaacaaagagtttataattctttatttgtaataacgctgcaaacatatccataaccccgcttcttagagccccttttaatttattaattaggggctcttATGCAGTTGGATGCTa > 1:212964‑M1/126‑141 (MQ=255) tgTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTGAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAACGAGTTGGAGGAATACAGTTggtgcgtta < 2:538931/140‑8 (MQ=37) aGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGGGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATTCAGTTggtgcgtta < 1:396710/141‑8 (MQ=255) tttAGACTAATTTAAGGTGTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCACTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTCGATGATAAcac < 2:559860/141‑3 (MQ=255) ttAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCa < 1:314980/141‑1 (MQ=255) gACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCa > 1:95904/1‑141 (MQ=255) cTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATGCGGTTGATTGCTAACGCA‑ccgat > 1:655631/1‑138 (MQ=38) aTTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGc > 2:312272/1‑141 (MQ=255) tttAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAACAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTATAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGCTGCTAACGCA‑CCAGCTGct > 2:270989/1‑140 (MQ=255) ttgacggTTTGCATTTAATTTTAAAATATTCGGTTAAATAGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATCAAAAGGGGACAAAGGAAAACAGTTCAATGCTAACGCA‑CCAACTGCa > 2:271130/6‑141 (MQ=37) aaGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATaa > 1:193657/1‑141 (MQ=255) aGGTTTTTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAag < 2:462992/141‑1 (MQ=255) ggTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAaga < 1:285857/141‑1 (MQ=255) tGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCATAATTAATAAATTACAAGAAGACAAAGGAATACAGATGGATGCTAACGAA‑CCAACTGCATAAGAGccc > 1:475372/1‑141 (MQ=255) gTATTTAATTTTAAACTATTCGTTTAAATTGAACGTAGTTGGTTTCTAATGCACTAACAGCAATTGTGTCTTTAATGATTAAACGACAAGCGGACAAAACAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGcccc < 2:23446/141‑1 (MQ=255) atttatttTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCta < 2:714367/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCta < 1:35940/141‑1 (MQ=255) tttAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCtaa < 2:411903/141‑1 (MQ=255) ttAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCtaat > 1:728669/1‑141 (MQ=255) tAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCtaatt > 1:454283/1‑141 (MQ=255) ttttAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATGAGAGCCCCtaattaat < 1:377771/141‑1 (MQ=255) ttttAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCtaattaat > 2:347209/1‑141 (MQ=255) aaccTAATCGGTTACATTGACCGTAGTTGGTTGCTCATGCACCAACAGCAAAAGTGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAAt < 1:483824/138‑1 (MQ=38) aaaCTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAAt < 2:45836/141‑1 (MQ=255) aaaCTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAAt < 2:570134/141‑1 (MQ=255) aCTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTAGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGGCCCTAATTAATAAATTa > 2:471917/1‑141 (MQ=255) cTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTaa > 1:636517/1‑141 (MQ=255) actCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTAGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGTGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTATCGCA‑CCAATTGCATAAGAGCCCCTAATTAACAATCTaaaa < 1:558519/139‑1 (MQ=38) ttCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGGTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAg < 1:30248/141‑1 (MQ=255) tCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGACCCTAATTAATAAATGAAAAgg > 1:425850/1‑141 (MQ=255) tCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCCAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAgg < 2:418020/141‑1 (MQ=255) tCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGATAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAgg < 2:413020/141‑1 (MQ=255) cGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAggg > 1:1577/1‑141 (MQ=255) aaaTTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGctct > 2:463962/1‑141 (MQ=255) aaaTTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGctct > 2:704059/1‑141 (MQ=255) aaTTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTa < 1:442977/141‑1 (MQ=255) gTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGATCCCCTAATTAATAAAATAAAAGAGGCTCTAAGAAGCgg > 2:313777/1‑141 (MQ=255) gTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCgg > 2:242113/1‑141 (MQ=255) aGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCgggg < 1:133979/141‑1 (MQ=255) ttggttgCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCgggggt > 2:194449/1‑139 (MQ=255) ggttgCTAATGCACGACCAGCAAAAGAGCCCGTAATTAAAAAATTAAAAGGGGACAAAGGAACACAGTTGGCTGCAAACGAA‑ACAACTGCATACGAGGCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTAt > 2:324770/1‑141 (MQ=255) gCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCT‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAACGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGat < 2:454283/141‑1 (MQ=255) ccTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCCAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGat < 1:118172/140‑1 (MQ=255) cTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGata < 1:534148/141‑1 (MQ=255) aaTGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAACAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATg > 2:102598/1‑141 (MQ=255) cACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTg > 2:306375/1‑141 (MQ=255) cACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTg > 2:131870/1‑141 (MQ=255) ccAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCa > 1:485207/1‑141 (MQ=255) ccAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCa < 1:280079/141‑1 (MQ=255) ccAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCa > 1:591127/1‑141 (MQ=255) ccAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGAGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCa > 1:189785/1‑141 (MQ=255) cAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAg < 2:426096/141‑1 (MQ=255) cccgcttcttagagccccttttaatttattaattaggggctcttATGCAGTTGG‑TGCGTTATCATCCAACTGTCTAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATAGATATGTTTGCAGCGt < 2:113855‑M1/97‑1 (MQ=255) cAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGt < 2:95050/141‑1 (MQ=255) cAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGt < 1:166770/141‑1 (MQ=255) aGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGtt > 2:430899/1‑141 (MQ=255) aaaaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCG‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGttatt > 2:663854/1‑141 (MQ=255) aaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTAc < 2:193657/141‑1 (MQ=255) aaGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGACGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTAc < 1:583370/141‑1 (MQ=255) agagCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACa < 2:550998/141‑1 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTATCGCA‑TCAGCTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAACGTTATTACAAATaa < 1:561669/141‑1 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATaa > 2:591720/1‑141 (MQ=255) cccTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCATAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATaa > 1:553354/1‑141 (MQ=255) ttaatAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAGtt > 1:394703/1‑141 (MQ=255) aataaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATtat > 1:114007/1‑141 (MQ=255) aataaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATtat < 1:61649/141‑1 (MQ=255) aataaATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATtat > 2:55619/1‑141 (MQ=255) aaaGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAAGTCttt > 2:382604/1‑141 (MQ=255) aaaGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCttt > 1:700488/1‑141 (MQ=255) aaaGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCttt > 1:705987/1‑141 (MQ=255) aaaGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCGAATTAATAAATTAAACGGGGCTCAAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCttt < 2:568536/141‑1 (MQ=255) aGGGGATAAAGGCATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CACAATGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGACATGTTTGCAGCGTTATGACAAATAAAGAATTATAAACTCTttgt < 1:75881/141‑1 (MQ=38) ggACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGc > 1:277865/1‑141 (MQ=255) aggggctcttATGCAGTTGG‑TGCGTTAGCATCCAACTGTATAAGAGCCCCTAATTCATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTctttgtttc < 2:719997‑M1/131‑3 (MQ=255) gACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAGAGAATTATAAACTCTTTGTTGCt > 1:671867/1‑141 (MQ=255) gACAAAGGAATACAGCTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCt < 1:571932/141‑1 (MQ=255) aGGAATGCAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCAGAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAatat < 1:730825/141‑1 (MQ=255) aGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCCGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAatat < 2:405917/141‑1 (MQ=255) aGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAatat < 2:217989/141‑1 (MQ=255) ggAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAATATg < 2:1577/141‑1 (MQ=255) ggAATACAGTTGGAGGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGAGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAGCTCTTTGTTGCTAATATg < 2:655631/141‑1 (MQ=255) aaTACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAACGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAATATGtt > 2:47588/1‑141 (MQ=255) | AACAACCAAAGGCGTAGTTTTAGACTAATTTAAGGTTTGTATTTAATTTTAAACTATTCGGTTAAATTGAACGTAGTTGGTTGCTAATGCACCAACAGCAAAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCA‑CCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGCTCTAAGAAGCGGGGTTATGGATATGTTTGCAGCGTTATTACAAATAAAGAATTATAAACTCTTTGTTGCTAATATGTT > CP000730/748856‑749134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |