Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA CP000730 707,910 A→G 100% intergenic (‑1/‑121) USA300HOU_0653 ← / → USA300HOU_0654 ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP000730707,9100AG100.0% 223.5 / NA 67intergenic (‑1/‑121)USA300HOU_0653/USA300HOU_0654ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein/possible metal‑dependent transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (27/40);  total (27/40)
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold.
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand.

ATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAA  >  CP000730/707776‑708042
                                                                                                                                      |                                                                                                                                    
aTAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGttt                                                                                                                                 <  2:74395/140‑1 (MQ=255)
aTAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGACAATGGTACCAATTATTTCGACGCGTACTGGTATCGATGAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAGTTTTTTGTTTGTGATAAGCGttt                                                                                                                                 >  2:134406/1‑140 (MQ=255)
 tAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTAAAATCTTTTGTTTTTAAAAAGCGTTta                                                                                                                                >  2:370004/1‑140 (MQ=255)
   aGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTtata                                                                                                                              >  1:73826/1‑140 (MQ=255)
        aGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTCTCGACTGGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATAcctcc                                                                                                                         <  1:361366/140‑1 (MQ=255)
        aGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATAcctcc                                                                                                                         <  1:501955/140‑1 (MQ=255)
            ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAt                                                                                                                     >  2:638776/1‑140 (MQ=255)
             tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAtt                                                                                                                    >  2:309138/1‑140 (MQ=255)
               ccAGCCCCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTaa                                                                                                                  <  1:612239/140‑1 (MQ=255)
                    tccATTCGGTCCTATGTTACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTaaatggt                                                                                                             <  2:7920/139‑5 (MQ=255)
                    atcATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt                                                                                                             <  2:467429/138‑1 (MQ=255)
                    acctgtCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTAGTACCTAAAAACAGATGTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGtt                                                                                                             <  1:345996/135‑1 (MQ=255)
                      cATTCGTGCTCAAGATAGCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGGTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTa                                                                                                           <  1:257406/140‑1 (MQ=255)
                            ggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTaa                                                                                                     >  2:434882/1‑140 (MQ=255)
                                 aTGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaa                                                                                                <  2:327150/140‑1 (MQ=255)
                                   gagtccAAGTCTTACGGCGCGTACTGGGATCGAAAAAGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTAGTACCTAAAAACAGATTTAAATCCTTTGTTTATAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaatt                                                                                              <  2:204163/136‑1 (MQ=255)
                                   gATACCAATTATTGCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaatt                                                                                              <  2:285051/140‑1 (MQ=255)
                                     tACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaattaa                                                                                            >  1:420679/1‑140 (MQ=255)
                                        cAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGTAAATGTTTTTCACCACCGCCGTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTg                                                                                         <  1:171639/140‑1 (MQ=255)
                                            tattTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGtata                                                                                     >  2:175284/1‑140 (MQ=255)
                                             attTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataa                                                                                    <  2:640808/140‑1 (MQ=255)
                                                    cgcgTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTg                                                                             <  2:608836/140‑1 (MQ=255)
                                                       gTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTgaga                                                                          <  1:86528/140‑1 (MQ=255)
                                                       gTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTgaga                                                                          >  2:144419/1‑140 (MQ=255)
                                                            ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATAtt                                                                     >  2:202117/1‑140 (MQ=255)
                                                               attgATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTAt                                                                  <  2:75875/137‑1 (MQ=255)
                                                               aTCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTAt                                                                  <  1:520257/140‑1 (MQ=255)
                                                                   aTAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATg                                                              <  2:331953/140‑1 (MQ=255)
                                                                   aTAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACATAATTAATTGCATAATAACCTGAGAAAATTTATCagg                                                              <  2:444948/140‑3 (MQ=255)
                                                                      aGGAAATGTTTTTATGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCa                                                           <  1:739305/140‑1 (MQ=255)
                                                                        gAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAg                                                         <  1:500592/140‑1 (MQ=255)
                                                                        gAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAg                                                         <  1:86237/140‑1 (MQ=255)
                                                                           aTGTTTTTTAGTAATATCTTATTACCTAAAAACAGATTTATATTTTTTGTTTAGACTAAGCGTTTTTACCTCCTCATTTATTACCTTGTCTTTCTTAATTAAATATATGATGAACTGAGAATGTTTATCATGttaattaa                                                      <  2:346788/140‑1 (MQ=255)
                                                                           aTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaa                                                      <  2:666026/140‑1 (MQ=255)
                                                                             gTTTTTAATTACATTCTTATTACCTAAAAATAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAt                                                    <  1:700577/140‑1 (MQ=255)
                                                                                  tAAGTACATGGTAATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTg                                               <  2:73826/140‑1 (MQ=255)
                                                                                  tAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTGTGTTTCTAACAAGCGTATATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGGCTCTTCATCCTGGCAAGTAAATTCGTg                                               >  1:14666/1‑140 (MQ=255)
                                                                                     gTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGata                                            >  2:119447/1‑140 (MQ=255)
                                                                                     gTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACATCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatt                                            >  2:660548/1‑139 (MQ=255)
                                                                                      tACATGCTTAATACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAACTGCAACATTTACTGTGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatat                                           <  2:125439/140‑1 (MQ=255)
                                                                                       aCATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatata                                          <  1:638776/140‑1 (MQ=255)
                                                                                            cTTATTACTTAAAATGAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAAAAAGTGTTTATACCTTCTAATTAAAAGTTGAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataatata                                     <  1:368918/140‑1 (MQ=255)
                                                                                            cTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataatata                                     <  1:494411/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACa                                 >  1:614948/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAAATGAGCATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACa                                 >  1:326464/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                   ccTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatg                              >  2:93084/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                    cTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGAGATAATATAGACAatgt                             <  1:452296/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                    cTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATACTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgt                             <  1:83993/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                        aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTGTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTGAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAGTTGTGTAATAAAATGAAAATGTGTCTCATGGCAAGTAAATTCTTGAGATAATATTGAAAatgaattt                         >  2:344159/1‑138 (MQ=255)
                                                                                                        aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatgtatgt                         <  1:405038/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                        aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATAATGTCAAGTGAATTCTTGagataatttataaagttctatt                         >  1:4886/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                        aaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAAGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTAAAGTAAATTCGTGATATAATATAGGCAatgtatgt                         >  1:380750/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                            aGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATATGAgg                     >  1:235263/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                            aGATTTAAACCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATCCCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCGAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAgg                     <  2:26445/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                              aTTTAAATCTTTTGTTTCTAGCAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACCATGTATGTGAGGTg                   >  1:475426/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                              aTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTTAAGTAACTTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTg                   >  1:162905/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                              aTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTg                   >  1:576688/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                              aTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTg                   >  2:625156/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                   aaTCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACATAGTATGTGGGGTGAAAGt              >  2:112483/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                   aaTCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGt              >  2:614008/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                        tttGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTCTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTGAAGTAAATTCGTGATATAATAGAGACACTGTATGTGAGGTGAAAGTATGtt         >  2:476860/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                           gTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAAc      <  1:144419/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           gTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAAc      <  1:265258/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           gTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAAc      <  1:8929/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               cTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaa  <  1:501288/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               cTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAACTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaa  <  1:502494/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               cTAACAAGCGGTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATGCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaa  <  2:430484/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                      |                                                                                                                                    
ATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAA  >  CP000730/707776‑708042

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: