| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,519,951 | T→G | 6.5% | P227P (CCA→CCC) | narG ← | nitrate reductase alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,519,951 | 0 | T | G | 6.5% | 181.0 / 5.9 | 75 | P227P (CCA→CCC) | narG | nitrate reductase alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/30); new base G (4/2); total (43/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
TACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGATCTGG > CP000730/2519812‑2520091 | tACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTtgtg < 2:495811/141‑1 (MQ=255) aCCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTgg > 2:574013/1‑141 (MQ=255) cGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGTTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTTCGGAGAGGCAcgt > 1:243181/1‑141 (MQ=255) cGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggt < 2:523509/141‑1 (MQ=255) ggACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggtg < 2:675863/141‑1 (MQ=255) ggACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTAACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggtg > 1:227478/1‑141 (MQ=255) gACTTCAGTCATAAAATTTTCATCCTGAGTACGTGTTAAAGGTAAATTATAGACGCACATAATAATGTATGATCCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggtgg < 1:716705/141‑1 (MQ=255) gACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAggtgg < 2:188452/141‑1 (MQ=255) acatgaGTCATAAACTGTGCTTCCGGAGTAAGTGTTAAAGGTATTGTAGAGGCCCCAATAACAACGTATGATGGGTTATACCTTTTACTTGATTCCGGTTTATATGTTTGCTCTCCCCATATTTGTGGAGAGGCAggtggt > 2:217451/6‑141 (MQ=255) ttCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTaa > 2:610366/1‑141 (MQ=255) tCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAACTTTGTGGAGAGGCAGGTGGTaaa > 2:746080/1‑141 (MQ=255) aGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATc < 1:583553/141‑1 (MQ=255) aGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATc > 2:106168/1‑141 (MQ=255) tCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAAGAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTg < 2:341712/141‑1 (MQ=255) aaaaTGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATa > 1:650998/1‑141 (MQ=255) tgtgCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGTCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTCAATCTGCATACCAg < 1:425495/141‑1 (MQ=255) tgtgCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAg > 2:481457/1‑141 (MQ=255) gtgCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGt > 2:670094/1‑141 (MQ=255) cATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCAt < 2:489268/141‑1 (MQ=255) aTCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATa > 2:98708/1‑141 (MQ=255) aTCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATa > 1:230777/1‑141 (MQ=255) gtgtTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCa > 2:584068/1‑141 (MQ=255) ttAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCAttt > 1:352543/1‑141 (MQ=255) tACATTAGGGCCGCCCATAATCATGTATGATGCCTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACACCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAACAACTAAGCATTTCaccacc < 2:430964/141‑1 (MQ=255) tACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCaccacc < 1:627575/141‑1 (MQ=255) ttAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGGGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGc > 1:732486/1‑141 (MQ=255) tAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCa < 1:42210/141‑1 (MQ=255) ggCCCTACATAATAATCTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAAt < 2:248407/140‑1 (MQ=255) ccccACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCCCCAAGCAAATtg > 1:429850/1‑141 (MQ=255) ccccACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATtg > 2:574881/1‑141 (MQ=255) caTAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGaa > 1:535575/1‑141 (MQ=255) caTAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGaa > 1:19916/1‑141 (MQ=255) taataaTGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATc > 2:12609/1‑141 (MQ=255) ataatGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGa > 1:471695/1‑141 (MQ=255) aggtgtgatgCGTTATACCAGTCACTTGATCCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCa < 1:94441/136‑1 (MQ=255) tttATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCAc < 1:13309/139‑1 (MQ=255) tATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACct < 2:230777/141‑1 (MQ=255) gatgCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCCCCTCTGTTTCCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCCGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTCCACCCCCACGCAGATCGAGGCATCCAGCAcaccct > 2:363368/1‑136 (MQ=255) 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(MQ=255) aCCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAGATTTGTGGAGAGGCAGGTGTTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCTAGCACCTACTGCATAACTaa > 1:425059/1‑141 (MQ=255) aCCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGCGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACCAAGCATTTCACCACCAAGCTAATTGAGGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTaa > 2:422859/1‑141 (MQ=255) ccAGTCGCTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAACCTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAAt < 2:615274/141‑1 (MQ=255) cAGTCGCTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATc > 1:502280/1‑141 (MQ=255) cACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTg < 1:500971/141‑1 (MQ=255) gATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCGTAACTAATCATTGACATc > 1:226806/1‑141 (MQ=255) gATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATc > 1:286030/1‑141 (MQ=255) tttCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCg < 1:376616/140‑1 (MQ=255) tttCAGGCACATCTGTCTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCCGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCg < 1:217451/140‑1 (MQ=255) tgtCAGGCACATTTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCg < 2:255354/139‑1 (MQ=255) ttCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGc > 2:742602/1‑141 (MQ=255) aGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGAACTCCCTgg > 2:581344/1‑141 (MQ=255) caTCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGTACATTAATGTATCGGGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGaaggg > 1:249843/1‑138 (MQ=255) caTCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAg > 2:752527/1‑141 (MQ=255) caTCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAg < 2:761703/141‑1 (MQ=255) tCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgt > 2:751607/1‑141 (MQ=255) cTGTTTGCCCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtg < 1:247537/141‑1 (MQ=255) tGTTTGCTCTCCCCAGATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATCGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtgt < 1:512347/141‑1 (MQ=255) tGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGgtgt > 2:746815/1‑141 (MQ=255) tGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGGGCACCGGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAAt > 1:363148/1‑141 (MQ=255) gcctctCCACAAATTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATAATTGACATCGCTGGAATAGGTGTaaaa > 1:36494/3‑140 (MQ=255) ctctCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTACGCATTTCACCACCACGCAAATTGATGAATCGCGAACCTCCTGCAACACTCATCGTGAACATCGCTGGATTGGGTGTTAATcc > 2:527124/1‑141 (MQ=255) ctcCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATAGAGAACCGGCTTCATAACTAATCATTGACAGCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTg < 2:277082/141‑1 (MQ=255) cAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGAtt < 1:577911/141‑1 (MQ=255) aaaTTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTc < 2:370601/141‑1 (MQ=255) aaaTTTGGGGAGAGGGAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTc > 1:385272/1‑141 (MQ=255) aaTTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGGCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCg < 2:58260/141‑1 (MQ=255) aaTTTGGGGGGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACGAAGCATTGCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCg < 2:80426/141‑1 (MQ=255) aaTTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCg > 1:762620/1‑141 (MQ=255) aaTTTGGCGAGAGGCAGGTGGGAAAACTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCg < 2:237330/141‑1 (MQ=255) aTTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGa < 1:98708/141‑1 (MQ=255) aTTTGGGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGa > 2:38364/1‑141 (MQ=255) tgtgGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGATCt < 1:633406/141‑1 (MQ=255) gtgGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGATCTg > 2:262269/1‑141 (MQ=255) tgGAGAGGCAGGTGGTAGATCTGCATACCAGTCGAAAGAACGAACTATTTGACAAGCATGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGGATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGATCTgg > 1:369403/1‑141 (MQ=255) | TACCTTTATAGCGGACTTCAGTCATAAAATGTGCATCCGGAGTACGTGTTAAAGGTACATTAGAGCCCCACATAATAATGTATGATGCGTTATACCAGTCACTTGATTCAGGCACATCTGTTTGCTCTCCCCAAATTTGTGGAGAGGCAGGTGGTAAATCTGCATACCAGTCATAAAAACTAAGCATTTCACCACCAAGCAAATTGATGAATCGAGCACCTGCTGCATAACTAATCATTGACATCGCTGGAATAGGTGTAAATCCTGCGATTCGATCTGG > CP000730/2519812‑2520091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |