| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,744,644 | C→A | 22.8% | V10F (GTT→TTT) | apt ← | adenine phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,744,644 | 0 | C | A | 22.8% | 132.3 / 30.2 | 68 | V10F (GTT→TTT) | apt | adenine phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/18); new base A (8/8); total (42/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
CAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATT > CP000730/1744506‑1744784 | cAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACtt > 2:76325/1‑141 (MQ=255)cAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACtt > 1:230372/1‑141 (MQ=255) aGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTc < 2:385369/141‑1 (MQ=255) tACAACGATACCAACATCTCTGGCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATAc < 2:895/141‑1 (MQ=255) ataaCGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTTCAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACg < 1:577620/139‑1 (MQ=255) cGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTAtt > 2:50505/1‑141 (MQ=255) gATATCAACATCTCTGTCTTTTTCTTATTCTACAATTTTAACTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTg > 2:371454/1‑141 (MQ=255) atatCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTTTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGc < 1:392205/141‑1 (MQ=255) atCAACATCTTTGTTTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCtt < 2:244787/141‑1 (MQ=255) tCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCttt < 1:272676/141‑1 (MQ=255) cttgcTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCAtt < 2:643957/137‑1 (MQ=255) ctGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCAtt > 2:117744/1‑141 (MQ=255) cGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATTCATTAATATTtcct > 1:449438/1‑141 (MQ=255) tATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTtcctcc > 2:427643/1‑141 (MQ=255) ttCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCCTTATCCCTAATTCTAGTAATACCCTTGAAACTAACACCCGGTTTCGGCCCATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTCAATCCATTAATATTTcctcctc > 2:306378/1‑140 (MQ=255) ttCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTa > 2:306377/1‑141 (MQ=255) aTTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCAATTAATACTCCCTCCTAAATTGCt < 2:757760/141‑1 (MQ=255) tATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACg < 1:67742/141‑1 (MQ=255) aTCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGa > 2:318799/1‑141 (MQ=255) aTCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGATCACGa > 2:203650/1‑141 (MQ=255) aTCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATACATTACTATTTCCTCCTAAATTGCTCACGa > 1:80636/1‑141 (MQ=255) tCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTCAATCCATTAATATTTTCTCCTAAATTGCTCACGAc > 2:628262/1‑141 (MQ=255) ttttGCATAGCCATATGCATCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACaa < 1:489003/139‑1 (MQ=255) gTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCCAACTTGAAATTCTGCTACGACTTGCTTTACATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCCCgcccat > 2:594082/1‑136 (MQ=255) gTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAACCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAAt < 1:371454/141‑1 (MQ=255) tGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATtg < 1:3176/141‑1 (MQ=255) gCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATACCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATtgt < 1:210249/141‑1 (MQ=255) gCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACtt > 2:446681/1‑141 (MQ=255) cATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTACTATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTa > 1:590284/1‑141 (MQ=255) atGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCTTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATcc > 2:645072/1‑141 (MQ=255) atGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATcc > 2:228312/1‑141 (MQ=255) tGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCa > 2:632319/1‑141 (MQ=255) gCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCaa > 2:50391/1‑141 (MQ=255) cTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAAt > 1:546287/1‑141 (MQ=255) cACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAAtttc < 1:214877/141‑2 (MQ=255) aCCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAAttttt > 2:294459/1‑141 (MQ=255) cATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCATCCTAAATTGCTCACGCCAATTGTGACTCTATCCAAttttttt > 2:765658/1‑140 (MQ=255) cATTATCCATAATTGTAGGAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTa < 1:380375/141‑1 (MQ=255) ttATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCAAGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTAtt > 1:658561/1‑141 (MQ=255) tATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTAttt > 2:736855/1‑141 (MQ=255) cATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGa > 1:389402/1‑141 (MQ=255) aTAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGACCAATCTTGAACTTCTGATACGCATTGCTTTAAATCCATTAATTTTTCCTCCTAAATTGCTCCCGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGaa > 2:269329/1‑141 (MQ=255) tAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGTCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGaaa > 1:647734/1‑141 (MQ=255) aaTTGGAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCCGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACACTTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTTaaaa > 2:299122/1‑141 (MQ=255) tGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATc > 1:603935/1‑141 (MQ=255) gtagtaATATCCTTGATACCAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCATAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCt > 1:429356/1‑141 (MQ=255) gtaATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTATATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGa > 1:176230/1‑141 (MQ=255) gtaATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATGTCTGAAAAATCTTGa > 1:329042/1‑141 (MQ=255) gtaATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATCGTGACTTTATCCAATTTTTTAGTTCTGAAAAATCTTGa < 1:427643/141‑1 (MQ=255) aaTATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTAGACCAAAGATGGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGata > 1:365680/1‑141 (MQ=255) cTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATAtaataa > 2:727521/1‑141 (MQ=255) ttGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATaataat < 2:133135/141‑1 (MQ=255) aaCTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAAGCCAGTAATATTTCCTCCTAAGTTGCTCACGGCCATGGGGACTGTATCCAATTTTTTATTTCTGAAATATCTTGATATaataatgtct > 1:333369/1‑137 (MQ=255) aCTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCtt < 2:452296/141‑1 (MQ=255) aCTAACACCTGGTGTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCtt < 2:59413/141‑1 (MQ=255) aaCACCTGGTTTCGGCCAATCTTAAAAGCCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTc > 2:165473/1‑141 (MQ=255) acacCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTACTATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCa > 1:105967/1‑141 (MQ=255) acacCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCa > 1:91062/1‑141 (MQ=255) cTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACAt < 1:113836/141‑1 (MQ=255) cTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACAt < 1:117744/141‑1 (MQ=255) tGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATc > 2:607948/1‑141 (MQ=255) ggCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACgt < 1:529979/141‑1 (MQ=255) ccAATCTTGAAATTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACgttg < 2:691305/141‑1 (MQ=255) cAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACgttgt < 1:356866/141‑1 (MQ=255) aaTCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATCATAATTGCTTTTCAACATCCATACgttgtt > 1:187441/1‑141 (MQ=255) tCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTtgttgt < 1:422925/141‑1 (MQ=255) cTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTc < 1:326409/141‑1 (MQ=255) gAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGTAATATCTTGATCTAATACTAGCTTTTCAACCTCCATACGTTGTTGTCTTa > 2:428679/1‑141 (MQ=255) cTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAAtt > 1:314326/1‑141 (MQ=255) | CAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATT > CP000730/1744506‑1744784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |