Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 2,571,957 | 0 | A | G | 4.1% | 328.5 / 2.8 | 112 | intergenic (‑109/+117) | panE1/USA300HOU_2433 | 2‑dehydropantoate 2‑reductase/MFS family major facilitator transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/50); new base G (3/2); total (60/52) | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AATGCACCCGATCCAGCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCATCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGTTTGATTTTTA > CP000730/2571817‑2572095 | aaTGCACCCGATCCAGCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCATCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCta > 1:379881/1‑141 (MQ=255) aTGCACCCGATCCATCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCATCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCtat < 1:783910/141‑1 (MQ=255) aTGCACCCGATCCAGCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCCTCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCtat > 2:404636/1‑141 (MQ=255) aTGCACCCGATCCAGCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCATCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCtat < 1:61213/141‑1 (MQ=255) 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2:1175648/141‑1 (MQ=255) gCACACAGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACATACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTAc < 2:886298/141‑1 (MQ=255) cacacaGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACa < 1:906077/141‑1 (MQ=255) cacacaGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACa < 1:687507/141‑1 (MQ=255) ccaGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAAt < 2:286570/140‑1 (MQ=255) caGCTTTTATCGTCTATAAAAGCACCGCGTTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATACCTTGCTTTAATTTCAGTTTTACAAAtt > 2:548174/1‑141 (MQ=255) gCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCg < 1:104888/141‑1 (MQ=255) gCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCg > 1:1190715/1‑141 (MQ=255) gCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCg > 1:687426/1‑141 (MQ=255) ttttATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGtt > 2:689506/1‑141 (MQ=255) ttttATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGtt > 2:109550/1‑141 (MQ=255) ttATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGTTTg > 2:475571/1‑141 (MQ=255) ttATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGACAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTACTTTAACATCCACACCTACAGCGAATCTTTCATTTCGCTTTTACAACTTCGTTTg > 2:539869/1‑141 (MQ=255) tATCGACTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTGTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGTTTGa < 2:532381/141‑1 (MQ=255) aTCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAACCGGCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGTTTGAt < 1:316635/141‑1 (MQ=255) tCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTCCAAATTCGTTTGAttttt > 2:721633/1‑141 (MQ=255) cTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCCACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAGAATTTCCTTTAAAATCCCTACGTAATAACTTGCTGTCGTTTGGGTTTTTCAAATTCGTTTGgttgttt > 1:437445/1‑140 (MQ=255) | AATGCACCCGATCCAGCAATTGCAATTTTCATCCTATAAACCCCTCTTCATCGTTGTTGTTCATTTTAAAAATACTACTTTCGCATATTAGCGTCAATTTGAAAATCATTCGCTTAATATGCACACAGCTTTTATCGTCTATAAAAGAACACACCTAACATTAAACGTCAATACGCAACATTAAGTGTGTATGATAAACTTACTTTCACAAAATTTCCTTTAAAATCCCTACATAATAACTTGCTTTCATTTCAGTTTTACAAATTCGTTTGATTTTTA > CP000730/2571817‑2572095 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |