| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,028,394 | A→C | 68.3% | F84C (TTT→TGT) | USA300HOU_1882 ← | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,028,394 | 0 | A | C | 68.3% | 119.9 / 61.5 | 90 | F84C (TTT→TGT) | USA300HOU_1882 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/17); new base C (29/31); total (40/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
ATATACATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATACACATCCCAATAA > CP000730/2028255‑2028533 | atataCATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCCCAATAAGTACTaaaaaaaa > 2:834729/1‑141 (MQ=255)atataCATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATaaaaa > 1:640480/1‑141 (MQ=255) ataCATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGa > 1:415142/1‑141 (MQ=255) taCATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAGTAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGAc > 1:833775/1‑141 (MQ=255) taCATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAAGACACAATAAGTAATAATAAACAGAc > 1:1085196/1‑141 (MQ=255) tAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAAc < 2:178141/141‑1 (MQ=255) aaaCTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTAC‑TTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACaa < 1:302069/141‑1 (MQ=255) aaCTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACaa > 1:683936/1‑141 (MQ=255) aaCTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACaa < 1:683385/141‑1 (MQ=255) ctgcggtACGTTGCTCACCAAACCTCTTTTGTTTAATAAAAGATGGAGAAGTCAGAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACTAACAAga < 2:842074/136‑1 (MQ=255) tGGTGTACGTTGCTTACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAGGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTTCATAACGCTCAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAgat < 2:612778/141‑1 (MQ=255) gtgtACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAgatga > 1:301634/1‑141 (MQ=255) gtgtACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTATGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAgatga > 1:515309/1‑141 (MQ=255) ggtACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAgatgat < 1:4485/140‑1 (MQ=255) tACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTGAAAACAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTGTGACTTTCGTATTACATCACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAaatgacga > 2:792559/1‑141 (MQ=255) tACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGCTTAAAAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAgatgatga < 1:984912/141‑1 (MQ=255) ttGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGt > 2:996799/1‑141 (MQ=255) ttGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGt > 2:975887/1‑141 (MQ=255) gCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGtat < 2:415142/141‑1 (MQ=255) gCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGCTGATGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAAATAACAGAAGAGCAAGATGATAAttaaat > 2:788059/1‑137 (MQ=255) cTCACCCAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACGACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGGATTAAATATCGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGtata < 2:782110/141‑1 (MQ=255) cAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCCCAATCAGTACTAATAAAAAAACGAACAAGATGATGATTGTATACttat > 1:513007/1‑141 (MQ=255) cAAACAACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGGAATAATAACAAGACGAACAAGATGATGATGGTATACttat > 1:514572/1‑141 (MQ=255) aaCCGCTTTTGTTTAATAAAAGATGGTCAAGTCATAACCTCATCCCTCGCAACTACTTGTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACttatta < 1:589981/141‑1 (MQ=255) ccACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGGACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGa < 1:1134821/141‑1 (MQ=255) cTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACaa > 2:619996/1‑141 (MQ=255) ttttGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACaat < 1:744328/141‑1 (MQ=255) gtttGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACaat < 2:585596/140‑1 (MQ=255) taataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCTTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGa > 1:1187134/1‑141 (MQ=255) taataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACGGACGAAGAAGATGATGATTGTATCCTTATTAGACAATAATGTGa > 1:195472/1‑141 (MQ=255) taataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTAATAGACAATAATGTGa > 2:1000738/1‑141 (MQ=255) aataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGAACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGaa < 2:201005/141‑1 (MQ=255) ataaAAGATGGTGAAGTCATCAGACGATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTATAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAAt > 2:849108/1‑141 (MQ=255) ataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAAt > 1:1104423/1‑141 (MQ=255) ataaAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGAGGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAAt > 1:88331/1‑141 (MQ=255) aaaaGATGGTGAAGTCATAACATCATCCGTCGCAACTAC‑TTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCa > 2:547570/1‑141 (MQ=255) gATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAAtt < 2:831117/141‑1 (MQ=255) aTGGTGAATTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTa < 2:815930/141‑1 (MQ=255) tGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTGGTGTGTTAAATAATGCACAATAAGTAATAATAAAAAGGCGAACGAGATGATGATAATATACTTATTAGCCGAAAGTGTGAATGAAATTaa > 1:1146049/1‑141 (MQ=255) ggTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGCCAATAATGTGAATGCAATTAAt < 2:875719/141‑1 (MQ=255) ggTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAAt > 1:1125954/1‑141 (MQ=255) ggTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAAt < 1:855461/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATa > 1:1031456/1‑141 (MQ=255) gTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACACACAATAAGTAATAATAACAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATa > 2:770840/1‑141 (MQ=255) tGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTAATTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAGTGTGAAGGCAATTAATAg > 1:342340/1‑141 (MQ=255) ggacttCATAACCTTATCCGTCGAAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAg < 2:275211/136‑1 (MQ=255) gAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAgc > 1:941571/1‑141 (MQ=255) aGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAgcgc < 1:299136/141‑1 (MQ=255) taTAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGcc < 2:739249/140‑1 (MQ=255) cATACCCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTCAGTAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGcc < 1:33408/141‑1 (MQ=255) aTAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGCTTGTCAACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCt < 2:595462/141‑1 (MQ=255) tAACCTCATCCGTCTCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTa < 2:1119635/141‑1 (MQ=255) tAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTa < 1:990318/141‑1 (MQ=255) tAACCTCAGCCGTCGCAACTACTGTTTTTGGGTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTa < 2:187900/141‑1 (MQ=255) ccGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACg > 1:131514/1‑141 (MQ=255) ccGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACg > 1:597100/1‑141 (MQ=255) gTCGCAACGACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGcc < 1:1133618/141‑1 (MQ=255) ctCGCAACTACTTTTTTTGGGTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGcc < 1:1133590/140‑1 (MQ=255) tCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCa < 1:989389/141‑1 (MQ=255) cAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATCTTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCaaaa < 1:996799/141‑1 (MQ=255) ctTTTTTTGATTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCAc < 2:805504/141‑1 (MQ=255) tttttttGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAATAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACg < 1:617332/141‑1 (MQ=255) ttttttGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGt < 1:24641/141‑1 (MQ=255) tttttGTGTTAAACCTGTGTATTAAATAACGCACAAGAAGTAAAAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAAGAATCTGAAGGCAATTAATAGCGCGCCTCTCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTa < 2:560717/141‑1 (MQ=255) ttttGGTTTAAACTTGTGTATACAGAAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCACAACGCCAAAAGGCAACGTAt > 2:1157123/1‑141 (MQ=255) tGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGACATAACAACCGCGCCTGTGCAAAACGGCAAAAAGCGACAGAtttt > 2:630797/1‑141 (MQ=255) gTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAAACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGACTGCACGTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTAt < 2:785865/141‑1 (MQ=255) gTTTAAACTTCTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTAt < 2:798988/141‑1 (MQ=255) tgtATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGa > 2:1084759/1‑141 (MQ=255) agtATAAAAAAACAGACACGAAGTAATAAGAAAGAGAGAAACAAGATGATGACTGTATGCTTATTAGACAGTAATGTGAATGCAATTAATTGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGa < 2:224995/140‑1 (MQ=255) gtATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGat < 2:1034565/141‑1 (MQ=255) tATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGata < 2:1187134/141‑1 (MQ=255) gaTTAAAGAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAGGATGACGATTTTATACCTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGGGCGCCGACTCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGata < 2:195472/140‑1 (MQ=255) ttAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATc < 1:22531/141‑1 (MQ=255) ttAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATc < 1:433124/141‑1 (MQ=255) tAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATGGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTAATTTATGAACATAAAGATATcc < 1:619996/141‑1 (MQ=255) aaaTAACGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCt > 1:709382/1‑141 (MQ=255) aaaTAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAAT‑ATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAAATATCCTa > 2:766694/1‑141 (MQ=255) aTAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTAc < 2:796102/141‑1 (MQ=255) cGCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATaa > 2:1033568/1‑141 (MQ=255) gCACAATAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATaaa > 2:593503/1‑141 (MQ=255) acaATAAGTAAGTAGAAAGAGACGAATAAGCTGCTGATTGTATACCTATCAGAAAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTACGCAAAGCCCCAAAAGGCCACGTAGTTTATTAAAATAAAGATATCCTACATAAACt < 2:901640/141‑1 (MQ=255) aaTAAGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTGCATAAACTaa < 2:812271/141‑1 (MQ=255) tAAGTAATAATAAACTGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATa > 1:600914/1‑141 (MQ=255) tAAGTAATAACAAACAGACCAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATa < 2:278506/141‑1 (MQ=255) aaGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATac > 2:537991/1‑141 (MQ=255) aaGTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATac > 1:1070496/1‑141 (MQ=255) gTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATacac > 1:1131439/1‑141 (MQ=255) gTAATAATAAACAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATacaa > 1:1145944/1‑140 (MQ=255) gTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATacac < 1:478033/141‑1 (MQ=255) ctaataataaACAGACGAACAAGAGGATGATTGTATACCTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTACCCAAAACTCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAACAAAGATATCCTACATAAACTAATacac < 2:1085196/140‑1 (MQ=255) ataataataaACAGACGAACAAGATGATGATCGTATACATATTAAACAATAATGTGAATGCAAATAATAGCGCCCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTACGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATacac < 2:833775/140‑1 (MQ=255) aaaGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATACACATCCCaataa > 1:30463/1‑141 (MQ=255) | ATATACATAAACTGGTGTACGTTGCTCACCAAACCACTTTTGTTTAATAAAAGATGGTGAAGTCATAACCTCATCCGTCGCAACTACTTTTTTTGGTTTAAACTTGTGTATTAAATAACGCACAATAAGTAATAATAAAAAGACGAACAAGATGATGATTGTATACTTATTAGACAATAATGTGAATGCAATTAATAGCGCGCCTATCCAAAACGCCAAAAGGCCACGTATTTTATGAAAATAAAGATATCCTACATAAACTAATACACATCCCAATAA > CP000730/2028255‑2028533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |