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* | CP000730 | 442,222 | 0 | A | G | 5.6% | 378.1 / 9.7 | 125 | intergenic (‑290/+103) | USA300HOU_0415/USA300HOU_0416 | hypothetical protein/hypothetical protein |
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) acgtcatcTGGCCTTCAGCTAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGAATTTGTAAATCAATTATATCAGATGTAATATTACAATTCAATTAGAAAAGAACTTTATCTTTAAt > 2:641799/4‑141 (MQ=255) atcatcTGACCTTCAGCAAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGAATTTGTAAATCAATTATATCAGATGTAATATTACAATTAAATTAGAAAAGAACTTTATCTTTAATTg > 2:371551/1‑141 (MQ=255) tGACCTTCAGCTAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGAATTTGTAAATCAATTATATCCGATGTAATATTACAATTCAATTAGAAAAGAACTTTATCTTTAATTGCTTTTc > 1:327150/1‑141 (MQ=255) aCCTTCAGCTAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGCATTTGTAAATCAATTATATCAGATGTAATATTACAATTCAATTAGAAAAGAACTTTTTCTTTAATTGCTTTTCgt > 2:136873/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAGCTAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGAATTTGTAAATCAATTATATCAGATGTAATATTACAATTCAATTAGAAAAGAACTTTATCTTTAATTGCTTTTCGa > 2:648086/1‑141 (MQ=255) | CGATAATAGTGACATGTGGCTTATAACACATTGTGTAATTTATTGTGTGTTTTGTGATGTCTAATATTGATTGCAGATTGTTGTATATTTCACTTAAAGGGCATTTATATAAAAAAAGAGGCCAGATGACGTATCATCTGACCTTCAGCTAAAACGCTGAGAATATGTCATTCTTCAAGAGAATGAAGCCGGAATGGTTACCGGGAATTTGTAAATCAATTATATCAGATGTAATATTACAATTCAATTAGAAAAGAACTTTATCTTTAATTGCTTTTCGA > CP000730/442082‑442362 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |