Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 54.6% | 113.9 / inf | 638 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 644 total aligned reads displayed.
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tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aaaaaagcttat < 2:659259/141‑8 (MQ=1) tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aaaaaagcttat < 1:4924/141‑8 (MQ=1) aatGCATTGAGCTATCGTAATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAACATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑aaaaaagcttat < 1:624372/140‑8 (MQ=11) tATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTa > 2:690444/1‑141 (MQ=38) gagcGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATTAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAg < 2:282267/138‑1 (MQ=255) gAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGGCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAAGATAATATCAGATTGCGTATTGATGAGACGTATATCAAAATaaaa > 1:405176/1‑141 (MQ=1) tgtAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAACAGTGGTAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATgg < 1:928255/141‑1 (MQ=255) gtAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGa > 2:760295/1‑141 (MQ=40) ctttCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTCATTACAGATGGCATTTTGAGTAGACGTACATAAAAATAAAAGGAAGTTGGAGCTAt < 1:690444/139‑1 (MQ=11) gTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTAtt < 2:474663/141‑1 (MQ=40) aaCGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGcc < 2:501468/141‑1 (MQ=40) | GTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAT‑AAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATT > CP000730/76213‑76492 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |