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Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
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(MQ=1) gtggtGCAAAGGAAAAAAATGTAGCTAACCCCTAATGTATCATGTCAGGGTTCGCTTAACTTGGTAGCATGATGCTAATTGCGTGGCATGGCGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTGCGGTCCTTTTTATATAGAGCGt < 2:48393/137‑1 (MQ=1) tagaGCCAACCACTAATTTATCCTGTCAGTGTTCGTTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGCGAAAATCCGTTGATCTGAAGAGACCTGCGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCttt < 1:53581/138‑1 (MQ=1) | CATTGACAAAGTATTTAATGTAGAAGCTATTCAGTATAAAGTTTTTGGCGAAAAATGATTACTTGAACAAGAGCTAAAATAAAATTGTG‑ATCTAATAAAAATAGAAGGTTCTGTTGCAAAGTAAAAAAATATAGCTAACCACTAATTTATCATGTCAGTGTTCGCTTAACTTGCTAGCATGATGCTAATTTCGTGGCATGGCGAAAATCCGTAGATCTGAAGAGACCTGCGGTTCTTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTT > CP000730/35712‑35981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |