| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,605,313 | 0 | T | G | 4.0% | 302.7 / 3.4 | 99 | intergenic (‑107/+345) | USA300HOU_2465/USA300HOU_2466 | possible decarboxylase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/45); new base G (2/2); total (52/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ACTCTCCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTCCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCTTTAGTTAAAACATTTAGCACTTATATTTAAAAAATATATAAAATATGAAAACAGATTGAAAGGATATTATACCTTGCTCTACCCTTTTTTATAAAAAATCACACACATTTGAGAAAATTTGATAATGTCAATAAATC > CP000730/2605173‑2605449 | aCTCTCCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTCCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCtt < 2:699578/141‑1 (MQ=255) ctctCCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTGCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCttt > 2:502040/1‑141 (MQ=255) ctctCCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTCCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCttt > 1:39842/1‑141 (MQ=255) ctcCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTCCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCTTTAg < 2:196601/141‑1 (MQ=255) 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ACTCTCCATTTTGTTTCTTGTAATTATACGGCATTTGCAATCTCTCCTTTACATTGTTTAATACCAATCCAGTGATACTACACTTCGAACAATATTGGATAGAATTTGAAATTCTGTATAACATCTTGTCAATCTATGCTTTAGTTAAAACATTTAGCACTTATATTTAAAAAATATATAAAATATGAAAACAGATTGAAAGGATATTATACCTTGCTCTACCCTTTTTTATAAAAAATCACACACATTTGAGAAAATTTGATAATGTCAATAAATC > CP000730/2605173‑2605449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |