| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,464,772 | 0 | A | T | 4.6% | 379.5 / 7.5 | 132 | L344M (TTG→ATG) | USA300HOU_2327 | isopentenyl‑diphosphate delta‑isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/57); new base T (3/3); total (72/60) | |||||||||||
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAATGATTCTACATAAGCTACTGTAT > CP000730/2464632‑2464912 | tATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCaa > 1:952593/1‑141 (MQ=255) aTTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGGGGGCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAg > 1:990288/1‑141 (MQ=255) aTTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAg > 1:623290/1‑141 (MQ=255) aTTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAg > 1:756298/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) aTGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAATGATTCTACATa > 2:480374/1‑141 (MQ=255) gTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACACTATTTCCGGCCTAAATAAGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATATTTAGCATCTAACATCGTCATTATTTATGTCATGTGTTCAATAAATGATTCTCCATGAg > 2:31803/1‑141 (MQ=255) tcttCAATTTTCGTTTTTCTTTCCATTACAATATTTCCGACCTTAATACGATTTGTTTTTGTGCTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAATGATTCTACATAAGCTa < 2:46107/139‑1 (MQ=255) tatTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAATGATTCTACATAAGCTa < 1:450270/141‑1 (MQ=255) aGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAACGCTTCTGTATAACATACTGTAt > 2:929984/1‑141 (MQ=255) | TATTGTTGGTGCATTCTTAATCGATTTAATTGGTGTTATAGTCATTATGGGATTCATACAATGGTTTAGTTAAACACCAAACTCATAAATAAAAGAGGAGGCCTTCGCCTCCTCTTTTATTTATCCTCGATGTATATTCAAGTTACGTTGTTCTATCCATGACAATATTTCCGGACTAAATACGATTTGTTTTTGTGTTAAGTCGTCAATATTTTTAGCATCTAACATCGTCATTATTGATTTCATGTGTTCAATAAATGATTCTACATAAGCTACTGTAT > CP000730/2464632‑2464912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |