BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	86 (1.320)	50 (1.110) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	35/180	NT	45.7%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	1998278 =	NA (NA)	50 (1.110) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	35/180	NT	45.7%	intergenic (‑6/+5)	USA300HOU_t0050/rrf4	tRNA‑Val/5S ribosomal RNA

Only 100 of 171 total aligned reads displayed.

GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

   cacctcgtcccatgccgaacacagaagttacgctccttagcgtcgattgtattctaacttacgttcctctaaagtagaacgtcgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaaaaa                                                                                                                                         >  2:717001‑M1/137‑141 (MQ=255)

     cctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGt                                                                                                                                       >  1:400661‑M1/135‑141 (MQ=255)

       tggtcccatgccgaacacaggagttgagcttcttagcgtcgatggtgggcgaacttacgttccgctagagtagaaggttgccaggcagttttttaaccaaattttggtttaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTa                                                                                                                                     >  2:422714‑M1/133‑141 (MQ=255)

         gaaCAGATGACAAAGGTGCACTTTTTACTGTAGTTAATCAGATAGAAAGCCAGTCTAGCATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAACTACTAACGAAAATGAACTGTAAAAAgcaata                                                                                                                                   >  2:497386/3‑136 (MQ=255)

         gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTACTTTTAAAAAGTTAtt                                                                                                                                   >  2:239182/1‑141 (MQ=255)

         gTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTAtt                                                                                                                                   >  1:660734/1‑141 (MQ=255)

             catgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACt                                                                                                                               <  1:106722‑M1/15‑1 (MQ=255)

                 gaaaaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTaaa                                                                                                                           <  2:762615/138‑1 (MQ=255)

                   caacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                         >  1:208266‑M1/121‑141 (MQ=255)

                    aacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  2:104044‑M1/120‑141 (MQ=255)

                     acacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttacgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGATTTAACTGtt                                                                                                                       <  2:509418‑M1/23‑1 (MQ=255)

                     acacagaaggtaagttgcttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       >  1:641349‑M1/119‑141 (MQ=255)

                     aaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       <  1:420037/141‑1 (MQ=255)

                      aGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTta                                                                                                                      >  2:500382/1‑141 (MQ=255)

                        cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAatgttgat                                                                                                                    >  1:315211‑M1/116‑138 (MQ=255)

                          gtAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTtaataa                                                                                                                  >  1:244627/1‑141 (MQ=255)

                            aaTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTCTTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATaaaa                                                                                                                >  1:743099/1‑141 (MQ=255)

                            aaTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATaaaa                                                                                                                >  1:268341/1‑141 (MQ=255)

                             aTTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGAAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTAATAAAGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt                                                                                                               >  2:199109/1‑141 (MQ=255)

                              tttgtATTGTTGTTAATCAATTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATg                                                                                                              <  2:622333/141‑1 (MQ=255)

                              ttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATg                                                                                                              >  1:402564‑M1/110‑141 (MQ=255)

                                   ctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggataaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAatgtacaa                                                                                                         <  1:671917‑M1/37‑4 (MQ=255)

                                     tgttgtTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATCGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTGATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                       <  1:447131/141‑1 (MQ=255)

                                     tgttgtTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                       <  1:759014/141‑1 (MQ=255)

                                       ttgttAAGCAGTCTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAAATAAATTTAAAAAGTTCTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     >  2:345767/1‑141 (MQ=255)

                                       ttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     <  1:715787‑M1/41‑1 (MQ=255)

                                       ttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggtgaaaaaataaaagggacaagataaAAACAGGTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     <  2:349502‑M1/41‑1 (MQ=255)

                                        tgttAAGCAGTCTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTAtaattaat                                                                                                    <  1:374463/141‑1 (MQ=255)

                                         tttaacaaGTTTCAAAGCATGTATATTATTTATTCTCTGAGCAAATTAAATTAACACAACTGAAGAAATAACTTTCATTCTTGAAGAAAGATAAAAATTAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAAGTAGaactaatt                                                                                                   <  2:318845/134‑1 (MQ=255)

                                           cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGCTAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  1:214245‑M1/45‑1 (MQ=255)

                                               gatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTc                                                                                             <  1:140719‑M1/49‑1 (MQ=255)

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                                                aGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCg                                                                                            >  1:543160/1‑141 (MQ=255)

                                                  ggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  2:69692‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                    tGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        >  1:175319/1‑141 (MQ=255)

                                                       aaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                     >  1:620008/1‑141 (MQ=255)

                                                              tacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                              >  1:593682‑M1/78‑141 (MQ=255)

                                                              aataagatttaattGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                              <  2:750950/135‑1 (MQ=255)

                                                                 gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAAGGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                           >  1:156884‑M1/75‑141 (MQ=255)

                                                                  ttccgctagagtagaccgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                          <  1:587482‑M1/68‑1 (MQ=255)

                                                                  ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                          <  2:443828‑M1/68‑1 (MQ=255)

                                                                  ttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                          <  1:217230‑M1/68‑1 (MQ=255)

                                                                  gTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTCACGACAATTAATTTTAAAAAGTTATTGCCTTAAATGTTAATAAAAGGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAAGGAACAtt                                                                          >  1:462465/1‑141 (MQ=255)

                                                                  ctccgctagagtagaacggtgccaggcagtttcttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACATAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAtt                                                                          >  1:527702‑M1/74‑141 (MQ=255)

                                                                    atttatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGa                                                                        <  2:34145/141‑1 (MQ=255)

                                                                        atttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                    <  1:390457/141‑1 (MQ=255)

                                                                         tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   <  2:651900/141‑1 (MQ=255)

                                                                         tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   >  1:131444/1‑141 (MQ=255)

                                                                         tttGTTAAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   <  2:355637/141‑1 (MQ=255)

                                                                         agagtagaacgttgacaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTCAGACAAATGAACATTGAAAACt                                                                   <  1:436523‑M1/75‑1 (MQ=255)

                                                                           tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACtaa                                                                 >  2:361541/1‑139 (MQ=255)

                                                                           tgttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATAAACATTGAAAACTGa                                                                 >  2:361537/1‑141 (MQ=255)

                                                                            gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGaa                                                                >  2:431718/1‑141 (MQ=255)

                                                                                  gCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACaa                                                          <  1:101973/141‑1 (MQ=255)

                                                                                   gttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         <  2:557333‑M1/85‑1 (MQ=255)

                                                                                   gttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         <  1:697935‑M1/85‑1 (MQ=255)

                                                                                   gtggccaggaagttttttaatctaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         >  1:110103‑M1/57‑141 (MQ=255)

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                                                                                      acaaaacaaCTCAACTTAAGACAAATGGCGTGTAACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTAAATAACAATATg                                                      >  1:382599/1‑141 (MQ=255)

                                                                                         aggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAAATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                   <  1:392336‑M1/91‑1 (MQ=255)

                                                                                         aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATTTCa                                                   >  1:226494/1‑141 (MQ=255)

                                                                                         aaacaaCTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCa                                                   <  2:145778/141‑1 (MQ=255)

                                                                                          ggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa                                                  <  2:259120‑M1/92‑1 (MQ=255)

                                                                                          aacaacTCAACTCAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCaa                                                  >  1:747153/1‑141 (MQ=255)

                                                                                           acaacTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGACTATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAAc                                                 >  1:447288/1‑141 (MQ=255)

                                                                                               ctcaactTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTa                                             >  2:401512/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                 ttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAAt                                           <  1:512355‑M1/99‑1 (MQ=255)

                                                                                                    ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGTATATTAATTGTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                        <  1:11880/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                    ctTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                        <  1:12046/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                       acaaatattgggtaaaaaagaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAAGTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                     >  2:425827‑M1/37‑141 (MQ=255)

                                                                                                       aaGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaa                                     <  1:553861/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                         aaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                   <  2:59694‑M1/107‑1 (MQ=255)

                                                                                                         aaattttagttaaaaaataaaatggacaagaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTAAAAAAAGAAAAAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                   >  2:130130‑M1/35‑141 (MQ=255)

                                                                                                          aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaaa                                  <  1:79665‑M1/108‑1 (MQ=255)

                                                                                                           aaTAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGGCAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAAc                                 >  1:694946/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                            ttttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTAAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACg                                >  1:332977‑M1/32‑141 (MQ=255)

                                                                                                               aCTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTaa                             <  1:388292/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                cTTAAATAACTAACGAAAAATAAAATAAAAAAATTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGAATAAATAACTCTTCTCGGTAAGAAAAATGAACATAGAACACTGAATCACAATATGTCAACAAAAAAAAAAAAAAACGTAAc                            <  2:617246/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  ggAATTACTAACGAAAATTAAATTTAAAAAGTCATTGACTTAAAAGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGAAAGAAAATTGAACATTGAAAACTGAATGACACTATGTCAACGTTAGTTCTAAAAAACGTAACta                          >  2:766759/2‑141 (MQ=37)

                                                                                                                     aTTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTGTTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATCACAATATGTCAACGTTAAAACAAAAAAACGTAACTATaa                       <  2:579245/141‑1 (MQ=38)

                                                                                                                     aTTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGGATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATaa                       >  2:673176/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                       tACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     <  2:282123/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                         cTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTa                   >  1:140792/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                          tAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAc                  <  1:191828/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             aatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAGCTGAATGACAATATGTCAACGTTAAGTCCAAAAGACGTAACTATAAGTTACaaa               >  1:511211‑M1/15‑141 (MQ=255)

                                                                                                                             aatggacaagataaAAAAAGTGATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATATCAACGTTAATTCAAAAAAACGTAACTATAAGTAACaaa               <  2:469414‑M1/127‑1 (MQ=255)

                                                                                                                               tggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             >  1:57577‑M1/13‑141 (MQ=255)

                                                                                                                               aggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             >  1:16850‑M1/13‑141 (MQ=255)

                                                                                                                               aaacTTAATTTTAAAAATGTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAGTGTAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             <  2:527620/141‑1 (MQ=25)

                                                                                                                               aaaaTTAATTTTAAAAAGTTAATGACTTAAATGATAATAAAATGTATAAATAATTCGTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACATTAAATCAAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             <  1:651912/141‑1 (MQ=25)

                                                                                                                                aaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACat            >  2:568527/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                  attaattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACatta          <  2:77807/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                    taattTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACattatt        >  1:146205/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                     agataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAAATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAAAAAAATTAttt       <  2:236102‑M1/135‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                      gatacAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCTAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTa      <  1:535797‑M1/136‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        tttAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTGTAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTACTTGCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACataattctgt    >  1:324497/1‑137 (MQ=25)

                                                                                                                                         ttAAAAATTTATTGCATTAAATGTTAATAAAATGTATATTTAATCTTTGTCGTTAACAAAACTGAACATTGAAAACTGAATGACAATACGTAAACGTTAATTCCAAAAATCGTAACTTTAAGTTACAAACATTATTTAGTa   <  2:143987/141‑1 (MQ=18)

                                                                                                                                         aaAAGAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAGATGTATAATTAATTCGTGTCGGGAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTTAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTAtttattg   <  2:479722‑M1/139‑4 (MQ=255)

                                                                                                                                         aaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTa   >  2:140719‑M1/3‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                          aAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAt  >  2:688401‑M1/2‑141 (MQ=255)

GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.