| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,113,768 | 0 | T | C | 4.0% | 306.1 / 2.7 | 105 | R79G (AGA→GGA) | USA300HOU_1983 | hypothetical bacteriophage protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/46); new base C (2/3); total (56/49) | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CGGTTATTCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTCGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTACTTCCTTGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAGCTCGTC > CP000730/2113628‑2113906 | cgGTTATTCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTCGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTACTTCCTTGTTCgctct > 2:608366/1‑141 (MQ=255) tttttCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTAGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTGCTTCCTTGTTCgctctgct < 1:545823/138‑1 (MQ=255) aTTCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTCGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTACTTCCTTGTTCgctctgctct > 2:26628/1‑141 (MQ=255) ttCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTCGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTACTTCCTTGTTCGCTCTGCactc > 2:82077/1‑141 (MQ=255) 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cTTGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAAt > 1:777843/1‑141 (MQ=255) cTTGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACCCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCaaa > 1:514841/1‑140 (MQ=255) ttGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCCAACAATTCATGTTTCAGAGTGCGAAAAATTTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATa > 1:649492/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTCTATCCCCAATa > 2:144408/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATa > 1:521084/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATa > 1:454656/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATa > 1:98816/1‑141 (MQ=255) gTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAg < 2:535717/141‑1 (MQ=255) ttCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAGc > 1:836703/1‑141 (MQ=255) gctctgctctCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAGCTCg < 1:154711/141‑1 (MQ=255) tctgctctCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAGCTCGTc > 1:488599/1‑141 (MQ=255) | CGGTTATTCATTTGTGTCATCCTCCATTTGCCCTAAAAATTCGTAGAACTCATTTGTTCCGTCTAGTTTGTCCATTCGGCACAATATAACACTTAAGTTGATTTCAGCTCTTCTATATATAGCTACTTCCTTGTTCGCTCTGCTCTCAATCTGTAGTTCGCTAAGTCTAAAACGGTAAAATTCGTATCTTCCAAACAATTCATTTTTAAGCGTGCGCCACATGTTCTCCAGCTCTTCGTTACGCTCTCTTAACTTAGCTATATCCCCAATAAGCTCGTC > CP000730/2113628‑2113906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |