Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP000730 | 628,618 | T→A | 6.9% | S8T (TCG→ACG) | nagB → | glucosamine‑6‑phosphate deaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP000730 | 628,618 | 0 | T | A | 6.9% | 248.7 / 3.4 | 97 | S8T (TCG→ACG) | nagB | glucosamine‑6‑phosphate deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/37); new base A (3/5); total (55/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAT > CP000730/628478‑628758 | aaTCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGAt > 2:456073/1‑141 (MQ=255) acAAAAATTTGTTGGAATGTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCg < 1:579036/140‑1 (MQ=255) cAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAAATAGGGATCGa > 2:423688/1‑141 (MQ=255) aaaaaTTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGaa < 1:716075/141‑1 (MQ=255) aTTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATGAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAAATCATAAGATTTTAAAATGTAGTGAATTGGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGTGTCGaaaaaa > 2:210252/1‑141 (MQ=255) ttgttgGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACa > 2:842299/1‑141 (MQ=255) tGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGACTTAATAAGTTTTTAACATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAATATTAAACTTAGGAACGAAATAACAAGCATCATTca > 2:626911/1‑140 (MQ=255) tGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGAATCATTCt > 2:463809/1‑141 (MQ=255) aaaGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTATACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATCCTATg > 1:106750/1‑141 (MQ=255) tgtTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGc > 2:92153/1‑141 (MQ=255) ttAAACATTTAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAt < 2:875105/141‑1 (MQ=255) atAAACATTAAAAATGAAGTGATATTAATGGTGTAAAAATGAATAAATAAGATGTTAAAATGTATTAAACTTGTGGAGGAATTGCAAGACTGAATGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAt < 2:229339/140‑1 (MQ=255) tAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAtg < 1:804833/141‑1 (MQ=255) aaaCATTAAAAATGATGTTATATTAATGGTGTATGAATGAATTAATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACGATGTATGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAtgt < 2:118767/141‑1 (MQ=255) aaaCATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAATTTTTTAAGATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAtgt < 1:671853/141‑1 (MQ=255) aaaCATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAtgt < 1:820209/141‑1 (MQ=255) ttAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGtt < 1:98090/141‑1 (MQ=255) aaaaaTGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAATATTAAACTTAGGTTAGAAAAAACATGCATCATTCTATTTTGCATGTAAGTtat > 2:600209/1‑141 (MQ=255) aaaTGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGGGAGTtatat > 2:574109/1‑141 (MQ=255) aaggatgGTAAATAAAAGGTGTAGGAATGAATACAAAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACGATGAAAGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTtatata < 2:66102/138‑1 (MQ=255) aaTGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTtatata > 1:222633/1‑141 (MQ=255) gatgCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAag > 2:560186/1‑141 (MQ=255) atgCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAagg > 2:738568/1‑140 (MQ=255) tataTTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATg > 1:128574/1‑141 (MQ=255) tataTTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTATTTAAAATGTATTAAACTTGTGTAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATg > 1:128492/1‑141 (MQ=255) atatTAATTGTGTATGAATGAATTTATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATgg < 2:393445/141‑1 (MQ=255) ttAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCAt > 1:20763/1‑141 (MQ=255) aaTGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCAttt < 1:319958/141‑1 (MQ=255) aTGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTa < 1:537450/141‑1 (MQ=255) aTGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTa < 2:118177/141‑1 (MQ=255) tGGTTTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGTGTTATATAAAGAGATGGCATTTaa < 1:572436/141‑1 (MQ=255) ggTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAGCAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAAt > 1:879700/1‑141 (MQ=255) gtgtATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATc < 2:277462/141‑1 (MQ=255) gtgtATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAAATTAAGAAAGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATc < 2:277489/141‑1 (MQ=255) atgaatgaATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCa > 2:364196/1‑141 (MQ=255) atgaatTCATAAGTTTTTACAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTCAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGCAAAAACCAGCATCATTCTATCTTGCTTGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCATCACTGt > 2:366603/1‑141 (MQ=255) atgaatTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTAATAAACTTAGGAACGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGt > 2:863284/1‑141 (MQ=255) taatTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAAATTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCAGTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTaa < 2:546407/140‑1 (MQ=255) gaatTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATCAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTaa > 1:634197/1‑141 (MQ=255) gaatTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTaa < 2:353856/141‑1 (MQ=255) gaatTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATAAACACTGTaa > 2:122826/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAgg > 1:251344/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAgg > 1:251608/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAgg > 1:320014/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAgg > 2:733907/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCAAAGTAAACTAgg > 1:698223/1‑141 (MQ=255) aTAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCAAGTGAGTTATATAAAGAGATGGCAATTAATCAGCACTGTAAACTAgg > 2:399659/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGtt < 1:419377/141‑1 (MQ=255) aaGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGATATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGtt > 2:726124/1‑141 (MQ=255) ttttAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGc < 2:803540/141‑1 (MQ=255) ttttAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGc > 1:795543/1‑141 (MQ=255) ttttAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGc < 1:500202/141‑1 (MQ=255) atgtAAAATGTATTAAATTTGTGGAAGCAAGTAAACAATGAAAATATTAAACATAGTATCGAAAAAACAAGCATCAATCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGc < 2:449707/138‑1 (MQ=255) tttAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCa > 2:341286/1‑141 (MQ=255) tAAAATTTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGTTCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAAc < 1:510276/141‑1 (MQ=255) tAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAAc > 2:793065/1‑141 (MQ=255) tAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAAc < 1:33141/141‑1 (MQ=255) aaaaTGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACt > 2:768971/1‑141 (MQ=255) aaaaTGTATTAAATTTGTGGAAGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACt < 2:640748/141‑1 (MQ=255) aaTGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCGGCCCTGTAAACTAGGTTTAGCAACtgg > 1:562290/1‑141 (MQ=255) aaTGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACtgg < 1:274710/141‑1 (MQ=255) tGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACtggtg > 2:692131/1‑141 (MQ=255) tATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAAATAGGTTTAGAACAtggtgtg > 1:97334/1‑139 (MQ=255) tATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGCAAACTAGGTTTAGCAACTggttgt < 2:181458/141‑1 (MQ=255) ttAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGTAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTAc < 2:144582/141‑1 (MQ=255) ctcaacttGTGGAGGCATTTAAACAATGAAAGTATCAAACTTAGGATCGACAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGACGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTAc < 1:66108/135‑1 (MQ=255) aaaTTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACaa > 2:773667/1‑141 (MQ=255) aaaTTAGTGAAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACaa > 2:556681/1‑141 (MQ=255) aaTTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAAt < 1:384949/141‑1 (MQ=255) aTTTGTGGAGGCATGTAAAAAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATg > 1:497727/1‑141 (MQ=255) ttGTGTAGGCGTGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGAc < 2:677989/141‑1 (MQ=255) tgtgGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACa > 1:657031/1‑141 (MQ=255) gAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGAtt > 2:614804/1‑141 (MQ=255) aGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGAttt > 1:383969/1‑141 (MQ=255) gCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGt > 1:565388/1‑141 (MQ=255) aTGAAAACAATTAAAGTAATAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTAt < 2:659017/141‑1 (MQ=255) gTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGa > 1:36741/1‑141 (MQ=255) gTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCAGTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGa > 1:572416/1‑141 (MQ=255) taaatcaTGAACGTATTCAAAATAGGATCGACAACCCAAGCATACTTCTATGATGCAAGTGATGTGTAAAACGAGATGGCAATTAATAAGCACTGTAAACAGGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGaa > 2:264859/7‑141 (MQ=255) aaaaTAATGAAAGGATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGaa < 1:767283/140‑1 (MQ=255) cAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGaacaac > 1:427161/1‑141 (MQ=255) aaTGAAAGTATTAAACCTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACt < 1:296658/141‑1 (MQ=255) aggAAAGTAATAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACtt < 2:321518/139‑1 (MQ=255) aTGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAACCTCGGTTTAGAAACTGGTGGCACACTGACCGACTTACATGTCCAACtt < 2:906081/141‑1 (MQ=255) aTGAAAGAATTAAAGTCAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTAGGTTGCATGTGAGTTATATAAAGGGATGGCATTTAAGCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACtt < 2:428195/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAATAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTg < 2:189818/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTg > 2:360909/1‑141 (MQ=255) aGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTTGCGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTaa > 2:866996/1‑141 (MQ=255) aGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTaa < 1:593744/141‑1 (MQ=255) aGTATTAAACTTAGGAACGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAAGTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGAGAGATTTGTATGAACAACGTGTTaa > 1:450686/1‑141 (MQ=255) aTTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGtt > 1:854147/1‑141 (MQ=255) aaaCTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGCCAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGttatt > 2:758161/1‑141 (MQ=255) aaCTTAGGATCTAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGttatta < 1:477309/141‑1 (MQ=255) aaCTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGttatta > 2:617966/1‑141 (MQ=255) aaCTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGttatta > 1:741529/1‑141 (MQ=255) cTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATtaaa < 1:768971/141‑1 (MQ=255) ggATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATtaaataaa > 1:716309/1‑141 (MQ=255) aTCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGGGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAAATTGTTAATTTATTCAATaaaaa > 1:328941/1‑141 (MQ=255) tCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAt > 2:707410/1‑141 (MQ=255) tCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAt > 2:76723/1‑141 (MQ=255) | AATCAAAAATTTGTTGGAATTTGAAAAGTGTTAAACATTAAAAATGATGCTATATTAATGGTGTATGAATGAATTCATAAGTTTTTAAAATGTATTAAATTTGTGGAGGCATGTAAACAATGAAAGTATTAAACTTAGGATCGAAAAAACAAGCATCATTCTATGTTGCATGTGAGTTATATAAAGAGATGGCATTTAATCAGCACTGTAAACTAGGTTTAGCAACTGGTGGTACAATGACAGATTTGTATGAACAACTTGTTAAGTTATTAAATAAAAAT > CP000730/628478‑628758 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |