Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,295 | 0 | T | C | 57.5% | 273.8 / inf | 723 | intergenic (+353/‑781) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 733 total aligned reads displayed.
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1:592950/1‑141 (MQ=11) actaTCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCCCATTTGTAAGAAAAAGCATa > 1:566586/1‑141 (MQ=11) aataTCTAAGATATTCATTGATCTAACGTTATATATATGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATa < 2:367543/139‑1 (MQ=11) ctaTCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaa < 1:682171/141‑1 (MQ=255) cTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaa > 1:829658/1‑140 (MQ=25) aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTGGGGTTCAAAAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagct > 2:780100/1‑137 (MQ=11) aGATATGACTTGAGTTATCGTGATATATATGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAAAGTTAATAATTCCAAGGTATACCGTTGGGTGAAAGATTATGCACCACTTTTATATCTAATTTGGAACAAAAAGCAAAACAAGCTa > 2:247762/1‑141 (MQ=2) aGATATGAATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATTACCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGTAAAAGCATAAAAAgact > 2:641095/1‑138 (MQ=11) atatGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctta < 1:93010/141‑7 (MQ=1) tatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagcttat > 1:820202/1‑134 (MQ=11) | TATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATG > CP000730/76155‑76431 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |