Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 49.2% | 17.8 / inf | 425 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
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1:295217/1‑140 (MQ=255) tAAGATATGGATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGGGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaag < 2:524670/141‑3 (MQ=11) aaGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCt < 1:280027/141‑1 (MQ=37) atatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctta < 1:183203/141‑7 (MQ=11) tatGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGACCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagcttat > 2:392034/1‑134 (MQ=0) cATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAAAGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAGAGAATaaaaaagtctattaaa > 2:699737/1‑130 (MQ=1) cgtGAGTTATCATGATATATCTGAAATATTAAGGGGACGTGCTGAAAACGTTCATCAATCAACGGTCTACCGGTGGGTTCAAGCATATGCCCCAATTTTATATCAAAGTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACaaa < 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TATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTAC‑TATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATT > CP000730/76214‑76492 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |