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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 57.5% | 65.3 / 170.5 | 158 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
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2:163578/1‑134 (MQ=255) tatGCATGGAGTTCTCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATAATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAAtt < 2:132527/141‑1 (MQ=255) aatGCATAGAGCTATCGTGAAATATCCGAAATATTAAGAGAACGTGGGGTAAACGTTCATCATTCAACGATCAACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTAAATCAAATAAAAAAAAAAAAGCATaaaaaagcttat < 2:274839/140‑8 (MQ=11) aTTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCCTAAATAGCTATTTACaaa > 1:15748/1‑141 (MQ=255) ttGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAAt < 1:88118/141‑1 (MQ=40) gTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACAGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAACAAGCATAAAAAACTAATTACAAATGGCg > 2:327087/1‑141 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |